More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3650 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  100 
 
 
428 aa  852  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  63 
 
 
393 aa  450  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  45.99 
 
 
419 aa  326  6e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  45.17 
 
 
419 aa  323  5e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  46.37 
 
 
407 aa  305  1e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  46.27 
 
 
417 aa  304  2e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  43.69 
 
 
420 aa  303  3e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  44.23 
 
 
413 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  44.23 
 
 
413 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  43.44 
 
 
436 aa  297  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  43.1 
 
 
413 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  44.47 
 
 
425 aa  292  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  45.13 
 
 
412 aa  289  6e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  41.3 
 
 
416 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  42.61 
 
 
406 aa  279  8e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  43.31 
 
 
461 aa  275  8e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  42.71 
 
 
405 aa  273  4e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  44.53 
 
 
418 aa  273  6e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  42.86 
 
 
403 aa  271  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  41.28 
 
 
411 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  39.43 
 
 
445 aa  269  7e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  40.49 
 
 
408 aa  268  9e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  39.64 
 
 
391 aa  266  5e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  43.29 
 
 
415 aa  266  6e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  39.56 
 
 
413 aa  265  9e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  40.95 
 
 
414 aa  259  5e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  39.4 
 
 
405 aa  258  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  42.04 
 
 
443 aa  256  6e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  40.2 
 
 
411 aa  254  2e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  41.07 
 
 
425 aa  249  6e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  39.12 
 
 
413 aa  242  8e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  40.2 
 
 
409 aa  242  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  35.61 
 
 
411 aa  229  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  36.06 
 
 
411 aa  226  5e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  39.84 
 
 
447 aa  215  1e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  35.88 
 
 
486 aa  215  1e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  36.6 
 
 
461 aa  214  2e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  35.17 
 
 
434 aa  213  4e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  32.78 
 
 
412 aa  209  6e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  35.07 
 
 
482 aa  207  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  32.61 
 
 
412 aa  207  4e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0060  amidohydrolase  32.77 
 
 
440 aa  203  4e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2295  putative amidohydrolase  31.87 
 
 
490 aa  203  6e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  33.33 
 
 
478 aa  202  1e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  32.3 
 
 
420 aa  199  7e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  32.37 
 
 
436 aa  199  8e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3872  amidohydrolase  33.25 
 
 
419 aa  198  1e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  34.86 
 
 
407 aa  195  1e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0482  amidohydrolase  33.18 
 
 
426 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  32.25 
 
 
456 aa  194  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  34.4 
 
 
433 aa  192  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0696  amidohydrolase  31.82 
 
 
444 aa  189  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1663  hypothetical protein  31.33 
 
 
429 aa  187  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21530  amidohydrolase, imidazolonepropionase  34.17 
 
 
447 aa  187  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  33.26 
 
 
445 aa  188  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1266  amidohydrolase  30.79 
 
 
447 aa  186  5e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  28.74 
 
 
413 aa  172  9e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  33.84 
 
 
426 aa  170  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  32.12 
 
 
407 aa  168  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  32.07 
 
 
451 aa  168  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  34.43 
 
 
459 aa  167  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  31.89 
 
 
421 aa  166  6e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  30.19 
 
 
445 aa  165  1e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3014  amidohydrolase  29.33 
 
 
459 aa  164  2e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  35.15 
 
 
438 aa  163  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  34.61 
 
 
432 aa  160  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  31.47 
 
 
408 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  31.47 
 
 
408 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  31.47 
 
 
408 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  31.8 
 
 
422 aa  158  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  30.92 
 
 
426 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  31.92 
 
 
412 aa  158  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  31.53 
 
 
411 aa  155  9e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  31.05 
 
 
400 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  33.18 
 
 
419 aa  154  3e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  31.03 
 
 
407 aa  154  4e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  31.16 
 
 
430 aa  152  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  31.36 
 
 
423 aa  152  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  30.29 
 
 
430 aa  150  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  33.73 
 
 
402 aa  150  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  30.24 
 
 
428 aa  149  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  30.84 
 
 
426 aa  149  1e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  30.34 
 
 
431 aa  145  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  33.25 
 
 
426 aa  143  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  32.13 
 
 
440 aa  143  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  31.97 
 
 
404 aa  142  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  32.04 
 
 
409 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  32.04 
 
 
409 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  33.16 
 
 
391 aa  142  1e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  32.04 
 
 
409 aa  142  1e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  34.32 
 
 
408 aa  142  1e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  31.35 
 
 
403 aa  141  2e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  32.83 
 
 
433 aa  142  2e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  30.68 
 
 
480 aa  141  2e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  32.85 
 
 
402 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  31.33 
 
 
428 aa  140  4e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  30.2 
 
 
470 aa  140  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  32.15 
 
 
421 aa  140  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  27.31 
 
 
441 aa  139  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  32.45 
 
 
432 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>