50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3647 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3647  hypothetical protein  100 
 
 
360 aa  722    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673078  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4042  hypothetical protein  37.66 
 
 
344 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  decreased coverage  0.00123714 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1824  hypothetical protein  28.85 
 
 
367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1964  hypothetical protein  28.35 
 
 
367 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5380  hypothetical protein  29.87 
 
 
325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0864  protein of unknown function DUF917  29.41 
 
 
366 aa  136  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125947  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3065  protein of unknown function DUF917  29.6 
 
 
369 aa  134  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0430  hypothetical protein  29.43 
 
 
354 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.204192  normal 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3585  protein of unknown function DUF917  26.13 
 
 
365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1849  hypothetical protein  29.87 
 
 
361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0098  hypothetical protein  31.25 
 
 
358 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4117  protein of unknown function DUF917  32.01 
 
 
375 aa  123  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716234  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0429  hypothetical protein  27.27 
 
 
367 aa  123  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329691  normal  0.645536 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1546  hypothetical protein  26.46 
 
 
366 aa  123  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0651  protein of unknown function DUF917  25.87 
 
 
367 aa  122  8e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0286525 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1726  hypothetical protein  26.23 
 
 
369 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4109  protein of unknown function DUF917  26.51 
 
 
362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2950  hypothetical protein  27.74 
 
 
356 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.559043  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22870  hypothetical protein  30.53 
 
 
368 aa  119  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.594068 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1850  hypothetical protein  28.08 
 
 
372 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.683335  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0428  hypothetical protein  25.16 
 
 
362 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.232081 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4113  hypothetical protein  25.31 
 
 
360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1994  protein of unknown function DUF917  27.24 
 
 
369 aa  113  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3369  hypothetical protein  28.57 
 
 
390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000644747  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4195  hypothetical protein  26.86 
 
 
374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0569866  normal  0.0852747 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0096  hypothetical protein  23.99 
 
 
366 aa  109  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4084  hypothetical protein  26.58 
 
 
381 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3135  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2213  protein of unknown function DUF917  26.64 
 
 
357 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.800798 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2453  protein of unknown function DUF917  24.66 
 
 
348 aa  102  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3582  protein of unknown function DUF917  25.16 
 
 
371 aa  99.4  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3365  hypothetical protein  29.1 
 
 
355 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2212  protein of unknown function DUF917  30.87 
 
 
381 aa  98.6  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5379  hypothetical protein  27.27 
 
 
374 aa  97.8  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2417  hypothetical protein  28.79 
 
 
367 aa  97.4  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1967  hypothetical protein  25.85 
 
 
369 aa  97.4  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2451  protein of unknown function DUF917  22.47 
 
 
360 aa  94.7  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1543  hypothetical protein  23.08 
 
 
371 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22860  hypothetical protein  28.61 
 
 
344 aa  94.4  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.420757 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22880  hypothetical protein  26.26 
 
 
362 aa  93.2  7e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.602917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2140  protein of unknown function DUF917  25 
 
 
362 aa  90.9  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0447006 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0395  hypothetical protein  24.48 
 
 
369 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  25.54 
 
 
983 aa  89.4  8e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1347  hypothetical protein  25.91 
 
 
370 aa  82  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3468  hypothetical protein  26.71 
 
 
373 aa  74.3  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07952  conserved hypothetical protein  25.1 
 
 
994 aa  66.6  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77272  normal  0.240542 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04610  hydantoinase, putative  23.56 
 
 
999 aa  63.2  0.000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.6497  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2201  protein of unknown function DUF917  20.8 
 
 
372 aa  60.1  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2548  hypothetical protein  23.31 
 
 
355 aa  53.9  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.836938  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4633  protein of unknown function DUF917  23.6 
 
 
365 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.951403  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2687  protein of unknown function DUF917  22.7 
 
 
354 aa  43.9  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0300826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>