More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3645 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3645  inner-membrane translocator  100 
 
 
327 aa  631  1e-180  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0077  inner-membrane translocator  59.63 
 
 
331 aa  343  2e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4121  inner-membrane translocator  44.15 
 
 
328 aa  221  1e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49492  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  41.69 
 
 
327 aa  219  4e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2214  inner-membrane translocator  41.31 
 
 
324 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.543943 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1049  inner-membrane translocator  39.2 
 
 
340 aa  192  8e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.186781  normal  0.0406542 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  40.32 
 
 
311 aa  188  8e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  40.32 
 
 
311 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  40.32 
 
 
311 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  40.32 
 
 
311 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  40.32 
 
 
311 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  40.32 
 
 
311 aa  188  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  40.72 
 
 
311 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.30424e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  40 
 
 
311 aa  186  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  40 
 
 
311 aa  186  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  40 
 
 
311 aa  185  7e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  37.18 
 
 
314 aa  184  1e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2090  inner-membrane translocator  41.95 
 
 
335 aa  183  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.268162 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  40.39 
 
 
314 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  39.12 
 
 
312 aa  179  5e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  35.78 
 
 
331 aa  178  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  39.54 
 
 
311 aa  178  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  3.52632e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 
311 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3763  L-arabinose transporter permease protein  37.5 
 
 
316 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139254  normal  0.990186 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  40.66 
 
 
336 aa  174  2e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  38.51 
 
 
333 aa  174  3e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  42.96 
 
 
327 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  35.38 
 
 
342 aa  169  7e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1133  monosaccharide-transporting ATPase  37 
 
 
359 aa  168  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  2.91616e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  36.14 
 
 
345 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  36.14 
 
 
345 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.14 
 
 
345 aa  167  3e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  36.14 
 
 
345 aa  167  3e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4227  monosaccharide-transporting ATPase  34.45 
 
 
326 aa  166  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  38.49 
 
 
324 aa  166  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4348  inner-membrane translocator  38.08 
 
 
348 aa  165  1e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  35.45 
 
 
323 aa  164  2e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  38.59 
 
 
313 aa  163  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  37.91 
 
 
322 aa  163  4e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  37.67 
 
 
345 aa  162  5e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  37.76 
 
 
347 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  36.68 
 
 
309 aa  162  8e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6250  inner-membrane translocator  39.43 
 
 
335 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.862039  normal  0.813312 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  39.27 
 
 
330 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  39.27 
 
 
330 aa  162  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  6.2023e-05 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  39.27 
 
 
330 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  37.72 
 
 
333 aa  162  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  39.46 
 
 
331 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2640  L-arabinose ABC transporter, permease protein  35.67 
 
 
329 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0418311  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  35.94 
 
 
322 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  33.13 
 
 
334 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  39.13 
 
 
336 aa  160  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1619  Monosaccharide-transporting ATPase  37.3 
 
 
314 aa  160  4e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3475  L-arabinose transporter permease protein  37.18 
 
 
316 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3602  L-arabinose transporter permease protein  35.24 
 
 
317 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1131  monosaccharide-transporting ATPase  34.34 
 
 
332 aa  159  6e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1910  L-arabinose transporter permease protein  35.94 
 
 
328 aa  159  7e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  35.45 
 
 
345 aa  159  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2698  putative sugar ABC transporter, permease protein  34.34 
 
 
332 aa  159  8e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3779  putative sugar ABC transporter, permease protein  34.34 
 
 
332 aa  159  8e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  35.56 
 
 
342 aa  159  9e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  35.56 
 
 
334 aa  158  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2699  putative sugar ABC transporter, permease protein  34.34 
 
 
332 aa  158  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  35.56 
 
 
342 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  36.69 
 
 
310 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  38.39 
 
 
336 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  37.01 
 
 
310 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  36.92 
 
 
323 aa  157  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  35.86 
 
 
339 aa  157  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2247  L-arabinose transporter permease protein  35.42 
 
 
327 aa  157  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  3.58536e-06 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  34.65 
 
 
341 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1122  Monosaccharide-transporting ATPase  34.34 
 
 
332 aa  156  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2831  putative sugar ABC transporter, permease protein  34.34 
 
 
332 aa  156  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02438  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  34.34 
 
 
332 aa  156  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02402  hypothetical protein  34.34 
 
 
332 aa  156  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  37.99 
 
 
320 aa  156  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3775  L-arabinose transporter permease protein  35.08 
 
 
315 aa  156  5e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  34.06 
 
 
335 aa  156  5e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  37.99 
 
 
322 aa  156  5e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  36.24 
 
 
315 aa  156  5e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2034  Monosaccharide-transporting ATPase  39.23 
 
 
326 aa  156  5e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0584323  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2373  L-arabinose transporter permease protein  35.06 
 
 
329 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00546665  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  34.75 
 
 
335 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  35.06 
 
 
340 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  37.18 
 
 
309 aa  155  9e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  33.99 
 
 
306 aa  155  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4099  putative xylose transport system permease protein XylH  34.64 
 
 
394 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4156  sugar transport system permease  34.64 
 
 
394 aa  155  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  35.28 
 
 
338 aa  155  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4139  L-arabinose transporter permease protein  35.98 
 
 
322 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.494868  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2331  L-arabinose transporter permease protein  35.98 
 
 
328 aa  154  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266483  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  35.65 
 
 
835 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2147  L-arabinose transporter permease protein  36.25 
 
 
328 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  35.6 
 
 
322 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4325  inner-membrane translocator  37.29 
 
 
355 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2570  inner-membrane translocator  33.64 
 
 
325 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  35.83 
 
 
334 aa  154  3e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  35.99 
 
 
342 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  32.7 
 
 
338 aa  153  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  35.99 
 
 
342 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>