84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3643 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3643  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 340 aa  679    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0075  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like  48.84 
 
 		 336 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1051  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like  32.3 
 
 		 371 aa  139  7e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.28211  normal  0.0668071 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4123  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  30.34 
 
 		 361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.472584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2298  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  34.04 
 
 		 345 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211923  normal  0.0897745 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2216  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.46 
 
 		 344 aa  113  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2088  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  30.56 
 
 		 390 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.323377  normal  0.268162 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1618  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.85 
 
 		 316 aa  69.3  0.00000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6223  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.61 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.945898  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0691  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.97 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0990716 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3448  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.18 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2906  Monosaccharide-transporting ATPase  23.36 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0655902 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2026  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.51 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3621  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.11 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2475  monosaccharide-transporting ATPase  23.64 
 
 		 321 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.498676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2257  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.23 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876756  normal  0.048401 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2035  Monosaccharide-transporting ATPase  29.23 
 
 		 309 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.609477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4489  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.61 
 
 		 334 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  decreased coverage  0.000667621 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3570  rhamnose ABC transporter, periplasmic rhamnose-binding protein  24.64 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0352467  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1794  monosaccharide-transporting ATPase  23.18 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.37883  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2277  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.02 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.455143  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4173  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.94 
 
 		 317 aa  50.8  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2399  ribose ABC transporter, periplasmic ribose-binding protein  27.6 
 
 		 310 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1642  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.39 
 
 		 333 aa  50.4  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000807495  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09540  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.45 
 
 		 320 aa  50.4  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0566218  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2522  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.44 
 
 		 315 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2666  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.59 
 
 		 372 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.157111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3087  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25 
 
 		 343 aa  49.7  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.154884  normal  0.401469 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6804  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.41 
 
 		 322 aa  49.3  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5162  putative ABC transporter  28.36 
 
 		 339 aa  49.3  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.504378  normal  0.824643 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4340  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.12 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2434  putative periplasmic binding abc transporter protein  26.38 
 
 		 333 aa  48.5  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1824  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.97 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00471967  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0381  Monosaccharide-transporting ATPase  25.12 
 
 		 339 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3044  rhamnose ABC transporter, periplasmic rhamnose- binding protein  28.57 
 
 		 358 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00338498  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4898  D-ribose transporter subunit RbsB  25.55 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00612951  hitchhiker  0.000000869292 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2242  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.62 
 
 		 321 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.853779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  24.19 
 
 		 904 aa  47  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2825  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.44 
 
 		 316 aa  47  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.223477  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0867  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.9 
 
 		 330 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000788488 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1533  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.79 
 
 		 378 aa  47  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0868667  normal  0.874786 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5809  rhamnose ABC transporter, periplasmic rhamnose-binding protein  23.44 
 
 		 331 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3291  ABC transporter substrate-binding protein  26.72 
 
 		 341 aa  47  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.353742  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2079  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.76 
 
 		 330 aa  46.6  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.509497  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0583  monosaccharide-transporting ATPase  24.17 
 
 		 307 aa  46.2  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4136  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.92 
 
 		 322 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5518  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24 
 
 		 322 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.40732  normal  0.0614119 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50130  Periplasmic substrate-binding protein of sugar ABC transporter  26.67 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50320  ABC transporter substrate binding protein  25.4 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.193489  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6710  rhamnose ABC transporter, periplasmic rhamnose-binding protein  24.77 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.440152 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4625  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.71 
 
 		 329 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.525494 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1272  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.87 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.269718  normal  0.414933 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0564  monosaccharide-transporting ATPase  24.46 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000302445  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3110  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00370209  hitchhiker  0.000114297 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0996  ribose ABC transporter, periplasmic D-ribose-binding protein  24.59 
 
 		 355 aa  44.3  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5157  putative simple sugar transport system substrate-binding protein  27.59 
 
 		 344 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385229  normal  0.972844 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1480  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.27 
 
 		 312 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1536  putative simple sugar transport system substrate-binding protein  29.95 
 
 		 340 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.59084  normal  0.407856 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4769  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.34 
 
 		 296 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.674163  normal  0.210606 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1857  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.56 
 
 		 322 aa  44.3  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.566225  hitchhiker  0.00271003 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3126  monosaccharide-transporting ATPase  25.5 
 
 		 310 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0798  ribose ABC transporter, ribose-binding protein  23.53 
 
 		 308 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000267941  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3541  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.82 
 
 		 313 aa  43.9  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0938  ribose ABC transporter, periplasmic D-ribose-binding protein  24.32 
 
 		 329 aa  43.9  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1855  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.49 
 
 		 326 aa  43.9  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373009  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0292  monosaccharide-transporting ATPase  24.09 
 
 		 300 aa  43.9  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4637  ribose ABC transporter, ribose-binding protein  23.53 
 
 		 308 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.146123  unclonable  4.40126e-26 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0166  monosaccharide-transporting ATPase  21.32 
 
 		 307 aa  43.9  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4112  putative sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein ABC transporter  25 
 
 		 340 aa  43.5  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3328  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  20.81 
 
 		 311 aa  43.5  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3269  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.62 
 
 		 330 aa  43.5  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.605596  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1985  monosaccharide-transporting ATPase  23.64 
 
 		 306 aa  43.5  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2594  putative periplasmic binding ABC transporter protein  25.48 
 
 		 332 aa  43.1  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.693301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3536  ABC transporter substrate-binding protein  25.1 
 
 		 337 aa  43.1  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.584688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2204  monosaccharide-transporting ATPase  32.97 
 
 		 335 aa  43.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00482964  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0344  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.91 
 
 		 306 aa  43.1  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2808  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.91 
 
 		 349 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0701  ribose ABC transporter, ribose-binding protein  23.53 
 
 		 308 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.199726  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2825  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.91 
 
 		 349 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.0535027 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0398  periplasmic sugar binding protein-like protein  23.49 
 
 		 365 aa  43.1  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00152665  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2781  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  22.91 
 
 		 349 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0363  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.23 
 
 		 318 aa  43.1  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.879984  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0737  ribose ABC transporter, ribose-binding protein  23.53 
 
 		 308 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.926456  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2882  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.08 
 
 		 354 aa  43.1  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.79248 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>