200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3609 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  98.65 
 
 
508 aa  448  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  100 
 
 
222 aa  441  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  68.26 
 
 
507 aa  241  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  75.66 
 
 
556 aa  240  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  47.51 
 
 
566 aa  196  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  47.35 
 
 
585 aa  191  6e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  60 
 
 
568 aa  179  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  60.28 
 
 
620 aa  176  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  41.81 
 
 
628 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  43.12 
 
 
605 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  45.86 
 
 
580 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  52.5 
 
 
551 aa  124  8.000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  48.76 
 
 
499 aa  124  9e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  46.56 
 
 
580 aa  124  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  48.76 
 
 
584 aa  123  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  47.93 
 
 
558 aa  122  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  47.93 
 
 
535 aa  118  6e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  41.89 
 
 
530 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  41.1 
 
 
602 aa  97.8  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  40.14 
 
 
714 aa  97.4  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  43.33 
 
 
603 aa  95.5  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  40.17 
 
 
443 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  39.32 
 
 
443 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  38.66 
 
 
510 aa  83.2  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  42.98 
 
 
521 aa  82.4  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  42.98 
 
 
360 aa  80.9  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  33.33 
 
 
567 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  38.82 
 
 
502 aa  79  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  32.86 
 
 
426 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  38.94 
 
 
748 aa  76.6  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  38.35 
 
 
441 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  37.31 
 
 
469 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  33.77 
 
 
485 aa  69.7  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  33.58 
 
 
512 aa  69.3  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  37.19 
 
 
494 aa  69.3  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06130  HNH endonuclease  37.82 
 
 
561 aa  67.8  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  36.92 
 
 
442 aa  67  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  29.19 
 
 
424 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31690  hypothetical protein  38.35 
 
 
577 aa  67  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  38.17 
 
 
432 aa  66.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  37.7 
 
 
661 aa  65.5  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  31.82 
 
 
637 aa  65.5  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06770  hypothetical protein  37.98 
 
 
523 aa  63.9  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.417774  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0067  HNH endonuclease  35.4 
 
 
458 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  33.33 
 
 
310 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  33.82 
 
 
516 aa  63.2  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  30.67 
 
 
377 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  30.67 
 
 
377 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  29.73 
 
 
475 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  30.72 
 
 
411 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2442  hypothetical protein  35.24 
 
 
440 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  32.59 
 
 
620 aa  60.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  39.76 
 
 
407 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  33.8 
 
 
709 aa  60.5  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  35.29 
 
 
408 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2401  hypothetical protein  35.58 
 
 
256 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0040  hypothetical protein  41.1 
 
 
436 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3732  hypothetical protein  35.35 
 
 
438 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5006  hypothetical protein  36 
 
 
435 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0237713  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  30.3 
 
 
423 aa  59.3  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3805  hypothetical protein  35.35 
 
 
438 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.482154  normal  0.0784296 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5094  hypothetical protein  36 
 
 
435 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0514803  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3744  hypothetical protein  39.73 
 
 
436 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  31.29 
 
 
519 aa  58.9  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  39.17 
 
 
572 aa  59.3  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  36.84 
 
 
481 aa  58.5  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  31.37 
 
 
430 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  31.37 
 
 
430 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1988  hypothetical protein  39.73 
 
 
436 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1846  hypothetical protein  35.35 
 
 
434 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785639  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2508  hypothetical protein  34.62 
 
 
441 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.0045565  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  30.34 
 
 
553 aa  57.8  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  37.35 
 
 
413 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1187  hypothetical protein  33.65 
 
 
430 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102985  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  35.92 
 
 
546 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1204  hypothetical protein  33.65 
 
 
430 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  37.82 
 
 
469 aa  57  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0413  hypothetical protein  34.62 
 
 
426 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1214  hypothetical protein  33.65 
 
 
426 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2479  hypothetical protein  34.62 
 
 
430 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5387  hypothetical protein  35.35 
 
 
437 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0426  hypothetical protein  33.65 
 
 
434 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2471  hypothetical protein  33.65 
 
 
445 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  36.72 
 
 
566 aa  56.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0436  hypothetical protein  33.65 
 
 
430 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257628  normal  0.0261589 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2516  hypothetical protein  33.65 
 
 
445 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1865  HNH endonuclease  38.36 
 
 
142 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2373  hypothetical protein  35.9 
 
 
480 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.022356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4558  hypothetical protein  35.9 
 
 
489 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361669  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  32.26 
 
 
480 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02590  HNH endonuclease  26.35 
 
 
169 aa  55.5  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  32.26 
 
 
480 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  32.26 
 
 
480 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0273  hypothetical protein  35.9 
 
 
466 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.88175  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  34.23 
 
 
391 aa  55.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  32.17 
 
 
578 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4621  hypothetical protein  35.9 
 
 
481 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.957856  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  34.78 
 
 
561 aa  55.1  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11790  hypothetical protein  35.62 
 
 
418 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.8127e-48  hitchhiker  0.00000599328 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01520  HNH endonuclease  40.59 
 
 
504 aa  54.3  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>