More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3597 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3597  amidohydrolase  100 
 
 		 445 aa  869    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  33.01 
 
 		 459 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  28.16 
 
 		 426 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  30.14 
 
 		 440 aa  141  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  31.73 
 
 		 430 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  28.81 
 
 		 426 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  29.37 
 
 		 444 aa  136  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  29.9 
 
 		 445 aa  135  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  29.38 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  31.67 
 
 		 433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  31 
 
 		 407 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  30.97 
 
 		 426 aa  131  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  27.79 
 
 		 407 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  30.7 
 
 		 432 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  30.24 
 
 		 444 aa  127  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  29.29 
 
 		 422 aa  126  9e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  28.79 
 
 		 437 aa  126  9e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  29.33 
 
 		 444 aa  125  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  30.52 
 
 		 433 aa  125  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  29.62 
 
 		 423 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  32 
 
 		 428 aa  123  7e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  27.25 
 
 		 431 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  29.45 
 
 		 416 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  28.57 
 
 		 402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  30.48 
 
 		 402 aa  121  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  29.05 
 
 		 433 aa  121  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  27.05 
 
 		 428 aa  120  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  28.94 
 
 		 434 aa  119  9e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  28.54 
 
 		 417 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  28.54 
 
 		 417 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  28.54 
 
 		 417 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  29.26 
 
 		 415 aa  119  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  27.06 
 
 		 441 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  31.96 
 
 		 421 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  28.6 
 
 		 445 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  30.89 
 
 		 438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  26.81 
 
 		 412 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  28.82 
 
 		 455 aa  114  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  26.61 
 
 		 410 aa  112  9e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  26.89 
 
 		 430 aa  112  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  30.38 
 
 		 486 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  29.22 
 
 		 421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  31.44 
 
 		 391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  28.47 
 
 		 408 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  27.88 
 
 		 414 aa  111  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  28.47 
 
 		 408 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  28.47 
 
 		 408 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  31.37 
 
 		 417 aa  110  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  29.87 
 
 		 424 aa  110  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  29.08 
 
 		 419 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  28.67 
 
 		 436 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  28.6 
 
 		 413 aa  110  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  26.27 
 
 		 411 aa  110  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5618  amidohydrolase  30.47 
 
 		 422 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.313113  normal  0.102085 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  25.71 
 
 		 401 aa  109  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  30.94 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  28.95 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  29.41 
 
 		 419 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  29.5 
 
 		 412 aa  107  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  28.74 
 
 		 419 aa  107  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  28.95 
 
 		 413 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  32.31 
 
 		 428 aa  107  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  28.27 
 
 		 405 aa  106  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  29.62 
 
 		 461 aa  106  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  25.78 
 
 		 431 aa  106  9e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  28.99 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  27.45 
 
 		 403 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  26.92 
 
 		 423 aa  105  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  28.38 
 
 		 407 aa  104  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  29.63 
 
 		 413 aa  104  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  26.59 
 
 		 413 aa  104  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  27.36 
 
 		 420 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  28.48 
 
 		 480 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  29.93 
 
 		 414 aa  103  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2932  amidohydrolase  26.53 
 
 		 431 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  28.98 
 
 		 418 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  32.09 
 
 		 408 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  25.46 
 
 		 470 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  26.47 
 
 		 404 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  28.61 
 
 		 421 aa  100  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  27.64 
 
 		 425 aa  100  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  26 
 
 		 426 aa  100  6e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  30.04 
 
 		 482 aa  100  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  25.2 
 
 		 412 aa  99.8  9e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  29.9 
 
 		 403 aa  99.8  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  26.79 
 
 		 443 aa  99.4  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  27.1 
 
 		 407 aa  98.6  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  27.13 
 
 		 470 aa  99  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  24.44 
 
 		 400 aa  98.6  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  27.7 
 
 		 411 aa  97.8  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  25.2 
 
 		 412 aa  97.8  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  27.09 
 
 		 409 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  27.09 
 
 		 409 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  27.09 
 
 		 409 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1275  amidohydrolase  25.54 
 
 		 415 aa  97.4  5e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0293  amidohydrolase  25.41 
 
 		 415 aa  97.1  5e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.356604 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  30.17 
 
 		 426 aa  97.4  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  28.91 
 
 		 405 aa  96.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  24.89 
 
 		 436 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  31.46 
 
 		 423 aa  95.1  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>