More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3583 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2082  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  61.47 
 
 
562 aa  655    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.126939  normal  0.0929922 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2221  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  61.3 
 
 
562 aa  658    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.202713 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2616  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  59.47 
 
 
568 aa  677    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3583  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 
583 aa  1168    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1185  AMP-dependent synthetase and ligase  53 
 
 
569 aa  554  1e-156  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.609931 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1327  AMP-dependent synthetase and ligase  50.52 
 
 
571 aa  546  1e-154  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17930  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  49.48 
 
 
574 aa  528  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.849454 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1973  AMP-dependent synthetase and ligase  49.19 
 
 
553 aa  492  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.935913  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  44.88 
 
 
584 aa  469  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  40.04 
 
 
569 aa  424  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.27 
 
 
582 aa  412  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.26 
 
 
561 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.08 
 
 
561 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.35 
 
 
563 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.35 
 
 
563 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.17 
 
 
563 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.35 
 
 
563 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.9 
 
 
561 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.19 
 
 
582 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.54 
 
 
561 aa  404  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.63 
 
 
561 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  38.25 
 
 
559 aa  399  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1727  AMP-dependent synthetase and ligase  42.25 
 
 
551 aa  399  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00049699  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  41.07 
 
 
549 aa  397  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  39.27 
 
 
561 aa  397  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  40.18 
 
 
564 aa  397  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  37.02 
 
 
590 aa  397  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  38.27 
 
 
566 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  40.59 
 
 
565 aa  395  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0228  AMP-dependent synthetase and ligase  40.39 
 
 
558 aa  389  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  36.33 
 
 
591 aa  391  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  39.05 
 
 
584 aa  386  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  36.51 
 
 
551 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  37.02 
 
 
577 aa  385  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  38.14 
 
 
578 aa  381  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.71 
 
 
585 aa  381  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  37.23 
 
 
539 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  37.97 
 
 
564 aa  376  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  38.3 
 
 
583 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  38.66 
 
 
583 aa  373  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0889  AMP-dependent synthetase and ligase  39.08 
 
 
560 aa  373  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0278278 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1757  AMP-dependent synthetase and ligase  37.69 
 
 
554 aa  373  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384408  normal  0.62754 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  37.52 
 
 
573 aa  372  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2760  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.51 
 
 
573 aa  369  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000411499  hitchhiker  0.00194378 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00067  putative long-chain fatty acyl CoA ligase  38.99 
 
 
560 aa  367  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2231  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.02 
 
 
572 aa  364  3e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00224599  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  35 
 
 
557 aa  363  4e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0200  AMP-dependent synthetase and ligase  39.83 
 
 
566 aa  360  4e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.366303  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3792  AMP-dependent synthetase and ligase  38.26 
 
 
571 aa  360  5e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3946  AMP-dependent synthetase and ligase  39.12 
 
 
578 aa  360  6e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0770506  normal  0.73273 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3653  AMP-dependent synthetase and ligase  38.67 
 
 
578 aa  359  8e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.6 
 
 
572 aa  359  9.999999999999999e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.451048  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3299  AMP-dependent synthetase and ligase  37.48 
 
 
559 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0394  AMP-dependent synthetase and ligase  36.77 
 
 
559 aa  359  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  38.64 
 
 
584 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128568  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  36.79 
 
 
561 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3077  AMP-dependent synthetase and ligase  38.61 
 
 
553 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3950  AMP-dependent synthetase and ligase  37.48 
 
 
559 aa  357  3.9999999999999996e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0302713  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5833  AMP-dependent synthetase and ligase  41 
 
 
569 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2010  AMP-dependent synthetase and ligase  36.72 
 
 
569 aa  356  5e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.982062  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1570  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37 
 
 
566 aa  355  1e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000352834  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2375  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.32 
 
 
572 aa  354  2.9999999999999997e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3797  AMP-dependent synthetase and ligase  36.52 
 
 
566 aa  352  1e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.589487 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3939  AMP-dependent synthetase and ligase  38.81 
 
 
585 aa  351  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0606256 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4440  AMP-dependent synthetase and ligase  36.73 
 
 
549 aa  350  5e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251188 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1498  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.75 
 
 
561 aa  349  7e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0422042  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4543  AMP-dependent synthetase and ligase  36.14 
 
 
562 aa  349  7e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2018  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.75 
 
 
561 aa  349  7e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.456222  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1958  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.75 
 
 
561 aa  349  7e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0509331  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1961  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.75 
 
 
561 aa  349  7e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0286809  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2791  AMP-dependent synthetase and ligase  35.54 
 
 
575 aa  348  1e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.444002 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1314  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.57 
 
 
561 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000394382  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2551  AMP-dependent synthetase and ligase  37.37 
 
 
559 aa  347  3e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.083055  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2532  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.57 
 
 
561 aa  347  3e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0895322  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01379  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.01 
 
 
563 aa  347  3e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1323  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37 
 
 
561 aa  347  4e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3734  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.24 
 
 
560 aa  347  4e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.862355  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0959  AMP-dependent synthetase and ligase  35.55 
 
 
558 aa  346  8e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.336851  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1993  AMP-dependent synthetase and ligase  35.64 
 
 
567 aa  345  1e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1838  AMP-dependent synthetase and ligase  35.99 
 
 
583 aa  344  2e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0025116  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1828  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.99 
 
 
583 aa  344  2e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.325094 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2192  AMP-dependent synthetase and ligase  34.91 
 
 
588 aa  345  2e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.899371  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2065  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.99 
 
 
561 aa  344  2e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01775  acyl-CoA synthase  35.99 
 
 
561 aa  344  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01763  hypothetical protein  35.99 
 
 
561 aa  344  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1893  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.99 
 
 
561 aa  344  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.99 
 
 
561 aa  344  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1383  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.99 
 
 
561 aa  344  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0924473  normal  0.838722 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0424  AMP-dependent synthetase and ligase  37.24 
 
 
561 aa  343  4e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004090  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.64 
 
 
563 aa  343  5e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0450361  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  36.4 
 
 
585 aa  343  5e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1831  putative long-chain fatty acyl CoA ligase  37.18 
 
 
558 aa  342  1e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.149833  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2684  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.47 
 
 
567 aa  342  1e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3633  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.91 
 
 
557 aa  342  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.956552  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.85 
 
 
577 aa  342  1e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0946  AMP-dependent synthetase and ligase  35.81 
 
 
559 aa  341  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2014  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.85 
 
 
562 aa  341  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000277435  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2125  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.85 
 
 
562 aa  341  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1593  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.93 
 
 
558 aa  340  4e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0451  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.74 
 
 
557 aa  340  4e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.321292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>