More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3580 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3580  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 159 aa  328  1e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1710  transcriptional regulator, AraC family  82 
 
 		 326 aa  266  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.492868 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2711  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  47.37 
 
 		 319 aa  139  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2471  transcriptional regulator, AraC family  43.31 
 
 		 311 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0153728 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16600  transcriptional regulator, AraC family  44.52 
 
 		 301 aa  136  8.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4811  helix-turn-helix, AraC type  41.94 
 
 		 315 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0365  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 299 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20280  transcriptional regulator, AraC family  43.23 
 
 		 309 aa  120  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0229385  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3808  AraC family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 321 aa  114  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2607  AraC family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 303 aa  102  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334421  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 301 aa  101  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2339  AraC family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 303 aa  101  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.295664 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6144  transcriptional regulator, AraC family  45.76 
 
 		 301 aa  101  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 301 aa  101  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  35.57 
 
 		 299 aa  99.8  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  34.93 
 
 		 298 aa  97.1  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0133  AraC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 315 aa  95.9  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13686 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  31.82 
 
 		 301 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  31.82 
 
 		 307 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  34.44 
 
 		 287 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  34.44 
 
 		 301 aa  94  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5065  AraC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 312 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289747  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 301 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5795  AraC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 312 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4384  AraC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 312 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.7748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3070  AraC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 311 aa  92  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3182  AraC family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 315 aa  92  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000265571 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1891  transcriptional regulator, AraC family  28.95 
 
 		 291 aa  90.5  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1078  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 318 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.441231  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0236  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 339 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6660  AraC family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 297 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3237  transcriptional regulator, AraC family  34.69 
 
 		 325 aa  89  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.434177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2340  helix-turn-helix domain-containing protein  30.97 
 
 		 290 aa  89.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581264  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0070  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 332 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0349  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 332 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1744  AraC family transcription regulator  34.48 
 
 		 350 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109239  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1655  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 350 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365127  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1237  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 332 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.89016  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1174  AraC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 330 aa  88.2  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0789379  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0499  AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 339 aa  88.2  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811586 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5590  AraC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 310 aa  87.8  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1701  AraC family DNA-binding protein  34.01 
 
 		 296 aa  87.8  5e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2310  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.71 
 
 		 299 aa  87.4  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120361  normal  0.040249 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3986  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.78 
 
 		 289 aa  86.7  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2436  AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 329 aa  85.1  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  37.58 
 
 		 294 aa  84.7  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3165  helix-turn-helix domain-containing protein  32.26 
 
 		 308 aa  82  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00840402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1116  transcriptional regulator, AraC family  33.95 
 
 		 325 aa  81.6  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2069  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 329 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.020463  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1886  transcriptional regulator, AraC family  31.54 
 
 		 289 aa  81.6  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1906  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 329 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.166677  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4043  transcriptional regulator, AraC family  30.38 
 
 		 303 aa  81.3  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0681  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 256 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0345  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 296 aa  80.9  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6320  transcriptional regulator, AraC family  32.39 
 
 		 294 aa  80.5  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.636258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4594  transcriptional regulator, AraC family  32.39 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3229  transcriptional regulator, AraC family  44.19 
 
 		 326 aa  79.3  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.686696 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0731  AraC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 328 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.617247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1919  AraC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 329 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.480868  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2939  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.19 
 
 		 289 aa  77.8  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0806864  normal  0.433201 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4301  transcriptional regulator, AraC family  39.13 
 
 		 286 aa  77.8  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220521  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0895  AraC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 302 aa  77.8  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0508  transcriptional regulator, AraC family  32.76 
 
 		 295 aa  77.4  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.3342  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1199  AraC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.33488  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0737  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.45 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.359471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  34.95 
 
 		 324 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.953379  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1643  AraC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0305  AraC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.183082  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0855  AraC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2946  transcriptional regulator, AraC family  34.95 
 
 		 324 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5736  transcriptional regulator, AraC family  26.12 
 
 		 302 aa  75.1  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.458087  normal  0.0804567 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1435  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 324 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1408  helix-turn-helix domain-containing protein  34.95 
 
 		 324 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2813  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.1 
 
 		 290 aa  74.7  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0565  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5462  AraC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 319 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3546  AraC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 319 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.776433  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4202  AraC family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 319 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4821  AraC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 319 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535496  normal  0.116549 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5388  transcriptional regulator, AraC family  36.56 
 
 		 298 aa  72  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.769805 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0883  AraC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 322 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  34.69 
 
 		 537 aa  70.9  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4725  AraC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 319 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.70917  normal  0.0655004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3988  transcriptional regulator, AraC family  27.46 
 
 		 291 aa  70.5  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00119398  normal  0.630817 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  40.2 
 
 		 300 aa  70.9  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4971  transcriptional regulator, AraC family  28.38 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0504817  hitchhiker  0.0000000000361988 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4074  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63505 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3586  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.41 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0787  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 324 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0185188  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0666  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 322 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00660506  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1480  transcriptional regulator, AraC family  30.2 
 
 		 288 aa  68.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0895908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2328  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 324 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241475  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4415  AraC family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 303 aa  68.2  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.0031509  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  37.11 
 
 		 303 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1743  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 324 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1627  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 324 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0192166  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1835  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 324 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00187488  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2466  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 324 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000149064  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0505  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 324 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.66204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>