61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3564 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3564  hypothetical protein  100 
 
 		 415 aa  844    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0056  protein of unknown function DUF88  34.24 
 
 		 448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1187  hypothetical protein  33.41 
 
 		 418 aa  208  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000236385  decreased coverage  0.000174597 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3051  protein of unknown function DUF88  32.93 
 
 		 418 aa  202  7e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10856 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3848  hypothetical protein  33.41 
 
 		 461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1289  protein of unknown function DUF88  54.95 
 
 		 474 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0260555  hitchhiker  0.00441203 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2484  hypothetical protein  32.12 
 
 		 439 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00113577  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0344  protein of unknown function DUF88  38.18 
 
 		 504 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.752457  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1706  hypothetical protein  37.35 
 
 		 507 aa  162  9e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.936741 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0028  protein of unknown function DUF88  36.46 
 
 		 509 aa  162  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0546  protein of unknown function DUF88  29.49 
 
 		 426 aa  154  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4578  protein of unknown function DUF88  36.78 
 
 		 527 aa  146  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.975373  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0587  protein of unknown function DUF88  45.03 
 
 		 240 aa  134  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000787089  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3191  protein of unknown function DUF88  26.42 
 
 		 478 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000122431  normal  0.16823 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1700  protein of unknown function DUF88  24.9 
 
 		 564 aa  70.9  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0123455  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0775  hypothetical protein  26.42 
 
 		 480 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1099  hypothetical protein  27.66 
 
 		 472 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1190  protein of unknown function DUF88  30.92 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2205  hypothetical protein  32.14 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1798  hypothetical protein  27.66 
 
 		 483 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0347  hypothetical protein  27.66 
 
 		 483 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1883  hypothetical protein  28.11 
 
 		 477 aa  67  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148092  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2113  hypothetical protein  30.71 
 
 		 508 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.827349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3189  hypothetical protein  29.93 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4302  hypothetical protein  28.18 
 
 		 496 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160322  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1193  hypothetical protein  28.18 
 
 		 498 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0714  hypothetical protein  28.18 
 
 		 498 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1072  hypothetical protein  27.08 
 
 		 501 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1168  hypothetical protein  28.18 
 
 		 498 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0240517 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1072  hypothetical protein  27.08 
 
 		 507 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1940  hypothetical protein  30.56 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0541  hypothetical protein  30.71 
 
 		 440 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3120  hypothetical protein  23.67 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.462437  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1734  hypothetical protein  30.56 
 
 		 249 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04690  hypothetical protein  32.14 
 
 		 412 aa  59.7  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2817  hypothetical protein  31.62 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556577  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2905  protein of unknown function DUF88  31.62 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.489552  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2999  protein of unknown function DUF88  31.62 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4412  hypothetical protein  26.06 
 
 		 787 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00112817  normal  0.0579767 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0980  protein of unknown function DUF88  27.97 
 
 		 260 aa  49.7  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3445  hypothetical protein  25.53 
 
 		 842 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132322 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2871  hypothetical protein  29.55 
 
 		 240 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3082  hypothetical protein  27.43 
 
 		 261 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.407546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00290  hypothetical protein  32.67 
 
 		 249 aa  48.9  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0105  hypothetical protein  36.47 
 
 		 236 aa  47.4  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4745  hypothetical protein  30.3 
 
 		 246 aa  47.4  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0180  hypothetical protein  27.81 
 
 		 254 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.124198  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1822  hypothetical protein  30.83 
 
 		 275 aa  45.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.81231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5232  hypothetical protein  54.55 
 
 		 284 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.682006 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0335  hypothetical protein  26.79 
 
 		 247 aa  46.2  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000159017  normal  0.161063 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3705  protein of unknown function DUF88  27.16 
 
 		 600 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000821311  hitchhiker  0.0000382798 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1542  hypothetical protein  26.38 
 
 		 272 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0806  protein of unknown function DUF88  29.27 
 
 		 246 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0118  hypothetical protein  51.06 
 
 		 286 aa  45.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2768  hypothetical protein  26.59 
 
 		 272 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3452  hypothetical protein  25.95 
 
 		 282 aa  43.9  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2652  protein of unknown function DUF88  39.73 
 
 		 253 aa  44.3  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000246678  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2410  hypothetical protein  28.12 
 
 		 259 aa  43.9  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.727494  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2044  hypothetical protein  27.04 
 
 		 249 aa  43.9  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0376115  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11150  hypothetical protein  33.75 
 
 		 314 aa  43.9  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.280093 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0707  protein of unknown function DUF88  46.81 
 
 		 258 aa  43.1  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000235983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>