32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3481 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3481  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 278 aa  549  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2191  sugar phosphate isomerases/epimerases  34.94 
 
 		 273 aa  161  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6104  xylose isomerase domain-containing protein  35.48 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2603  xylose isomerase domain protein TIM barrel  38.32 
 
 		 271 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0698398 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1216  xylose isomerase domain-containing protein  38.06 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2702  xylose isomerase domain-containing protein  38.29 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.964957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1590  xylose isomerase-like TIM barrel  36.27 
 
 		 286 aa  150  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3122  xylose isomerase domain-containing protein  37.73 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30200  Xylose isomerase-type TIM-barrel protein  36.47 
 
 		 271 aa  145  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4909  xylose isomerase-like TIM barrel  34.63 
 
 		 271 aa  143  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3240  xylose isomerase domain-containing protein  36.58 
 
 		 271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.308635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2149  xylose isomerase domain-containing protein  35.9 
 
 		 271 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.398235 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2673  xylose isomerase domain-containing protein  37.66 
 
 		 287 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2346  xylose isomerase domain-containing protein  41.84 
 
 		 276 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.848938 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8641  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  35.1 
 
 		 269 aa  119  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2843  xylose isomerase domain-containing protein  37.31 
 
 		 269 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.51 
 
 		 274 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2699  xylose isomerase domain-containing protein  32.27 
 
 		 277 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.254699 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5912  xylose isomerase domain-containing protein  36.78 
 
 		 275 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.2156  decreased coverage  0.00155667 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1392  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.46 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3810  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.96 
 
 		 280 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.022666  normal  0.0930685 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0783  xylose isomerase-like TIM barrel  35.15 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.248846  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02960  hypothetical protein  35.25 
 
 		 271 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000610778 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3684  xylose isomerase domain-containing protein  35.51 
 
 		 277 aa  97.1  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.414118  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0410  xylose isomerase-like TIM barrel  31.69 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2254  xylose isomerase domain-containing protein  34.18 
 
 		 279 aa  89.7  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.565091 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3491  xylose isomerase domain-containing protein  27.95 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3304  xylose isomerase domain-containing protein  33.81 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1496  xylose isomerase domain-containing protein  26.48 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7150  xylose isomerase domain-containing protein  26.64 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0169524 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3640  xylose isomerase domain-containing protein  31.13 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0134  xylose isomerase domain-containing protein  27.27 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>