More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3424 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3424  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  100 
 
 
164 aa  338  2e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628106  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  85.37 
 
 
164 aa  295  2e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06100  cytosine/adenosine deaminase  55.56 
 
 
158 aa  172  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.13 
 
 
161 aa  169  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2061  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.59 
 
 
158 aa  157  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448071  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2794  Guanine deaminase  55.13 
 
 
186 aa  155  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026215 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1419  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  58.6 
 
 
161 aa  154  7e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2805  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  51.22 
 
 
158 aa  151  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2297  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  50.31 
 
 
155 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000194857  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1141  guanine deaminase  53.75 
 
 
158 aa  147  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172316  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0860  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.41 
 
 
160 aa  146  9e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1429  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  60.65 
 
 
161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000748458 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0107  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.31 
 
 
163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0710056 
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  45.81 
 
 
150 aa  142  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0857  Guanine deaminase  50 
 
 
163 aa  138  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1532  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  44.06 
 
 
159 aa  135  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00420564  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1461  hypothetical protein  44.06 
 
 
159 aa  135  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.252188  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.38 
 
 
158 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.724864 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  41.4 
 
 
157 aa  130  6.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.94 
 
 
155 aa  128  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.94 
 
 
183 aa  127  8.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285833  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1731  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  44.65 
 
 
157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120946  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  36.94 
 
 
154 aa  123  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3479  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.95 
 
 
223 aa  121  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1670  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.62 
 
 
163 aa  120  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0217007  normal  0.338032 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.14 
 
 
157 aa  117  6e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1249  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.99 
 
 
155 aa  117  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0215  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.35 
 
 
159 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1831  guanine deaminase  40.76 
 
 
149 aa  115  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.358543  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4793  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.758133  normal  0.45937 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1498  zinc-binding domain-containing protein  40.61 
 
 
164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.31 
 
 
160 aa  111  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  46.72 
 
 
161 aa  109  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0576  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.85 
 
 
161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1303  cytosine/adenosine deaminase  44.92 
 
 
148 aa  108  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3254  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.3 
 
 
214 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8163  guanine deaminase  46.41 
 
 
157 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.241917 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2814  twin-arginine translocation pathway signal  42.5 
 
 
176 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338742  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.54 
 
 
211 aa  102  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  45.38 
 
 
156 aa  101  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2436  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.67 
 
 
301 aa  100  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4004  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.46 
 
 
159 aa  99.8  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0207982  hitchhiker  0.00540331 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4251  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.15 
 
 
157 aa  99  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3292  Guanine deaminase  36.84 
 
 
188 aa  97.4  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.650383  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4602  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein; guanine deaminase  40.83 
 
 
153 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.92 
 
 
163 aa  95.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5383  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  40.68 
 
 
152 aa  92.8  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2814  cytidine/deoxycytidylate deaminase  42.61 
 
 
155 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0144  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  43.1 
 
 
147 aa  92  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.263375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4858  cytidine/deoxycytidylate deaminase  41.74 
 
 
167 aa  91.7  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0141  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.5 
 
 
157 aa  91.7  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0136  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  37.5 
 
 
157 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2500  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.17 
 
 
190 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.59246 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1282  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.95 
 
 
156 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16352  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1066  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.09 
 
 
188 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32340  putative deaminase  41.74 
 
 
151 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319572  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2740  putative deaminase  37.5 
 
 
151 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1166  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  40.37 
 
 
190 aa  85.5  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2685  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.16 
 
 
190 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.109845  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1129  hypothetical protein  34.59 
 
 
154 aa  84.3  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1134  hypothetical protein  34.59 
 
 
154 aa  84.3  7e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5437  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.44 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  normal  0.506194 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2029  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  38.95 
 
 
141 aa  83.6  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1017  tRNA-adenosine deaminase  49.45 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.251058  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0031  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.32 
 
 
148 aa  82  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000369042  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.39 
 
 
155 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659828  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2203  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.82 
 
 
153 aa  82  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282185  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  44.9 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00940  cytosine/adenosine deaminase  40.52 
 
 
175 aa  80.9  0.000000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3135  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.54 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.065238 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  40.18 
 
 
168 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4002  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.68 
 
 
162 aa  79.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.789776 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.84 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.21 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1712  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.19 
 
 
167 aa  79  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.344098  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  38.1 
 
 
182 aa  79  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0518  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.74 
 
 
158 aa  79  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  37.62 
 
 
148 aa  78.6  0.00000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.86 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  37.62 
 
 
148 aa  78.6  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0839  tRNA-adenosine deaminase  50.63 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3629  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.37 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1609  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.98 
 
 
165 aa  77.8  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0448042  normal  0.295189 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0289  zinc-binding domain-containing protein  43.56 
 
 
137 aa  77.8  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1216  tRNA-adenosine deaminase  44.21 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01142  hypothetical protein  41.67 
 
 
164 aa  77.4  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1655  guanine deaminase  33.97 
 
 
298 aa  77.4  0.00000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4143  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.75 
 
 
149 aa  77  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0816552 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0065  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  51.28 
 
 
179 aa  77  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289308  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2603  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  50.63 
 
 
155 aa  77  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000499641  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4584  tRNA-adenosine deaminase  38.33 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2427  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.1 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777873  normal  0.277053 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4719  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.41 
 
 
174 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.267474  normal  0.468215 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0158  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1986  tRNA-adenosine deaminase  40.38 
 
 
152 aa  77  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.365375  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3332  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.14 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.19 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143091  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4941  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  45.45 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0239  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  42.02 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000722464  hitchhiker  0.0000000000000386131 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.84 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>