More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3422 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3422  hypothetical protein  100 
 
 
433 aa  844    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3202  protein of unknown function DUF182  60.18 
 
 
421 aa  451  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  43.77 
 
 
366 aa  271  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  43.2 
 
 
373 aa  267  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  45.85 
 
 
368 aa  265  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  41.42 
 
 
397 aa  258  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  41.5 
 
 
385 aa  256  4e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  41.59 
 
 
374 aa  253  4.0000000000000004e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  41.22 
 
 
357 aa  252  1e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  42.21 
 
 
385 aa  251  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  42.54 
 
 
386 aa  251  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  43.13 
 
 
390 aa  249  6e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  42.5 
 
 
372 aa  247  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  42.37 
 
 
386 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  42.37 
 
 
386 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  43.13 
 
 
385 aa  246  4.9999999999999997e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  41.73 
 
 
386 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  43.52 
 
 
381 aa  245  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3973  hypothetical protein  42.06 
 
 
398 aa  238  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  42.69 
 
 
370 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  40.19 
 
 
368 aa  237  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  44.09 
 
 
380 aa  236  8e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  41.39 
 
 
373 aa  236  9e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  43.55 
 
 
363 aa  233  7.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  42.49 
 
 
372 aa  232  9e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  38.26 
 
 
369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  39.86 
 
 
389 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  33.73 
 
 
367 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1565  protein of unknown function DUF182  38.13 
 
 
402 aa  193  4e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.39267  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4732  protein of unknown function DUF182  53.89 
 
 
483 aa  190  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  37.02 
 
 
376 aa  182  9.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0200  hypothetical protein  37.38 
 
 
369 aa  182  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0521133  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  33.93 
 
 
323 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  36.44 
 
 
388 aa  169  8e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0117  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  43.95 
 
 
266 aa  169  9e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.379471  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4124  protein of unknown function DUF182  38.37 
 
 
375 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  53.01 
 
 
425 aa  166  8e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  32.73 
 
 
342 aa  147  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  45.68 
 
 
250 aa  144  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  46.34 
 
 
240 aa  144  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  30.51 
 
 
372 aa  142  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  31.92 
 
 
340 aa  140  6e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  45.31 
 
 
389 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1186  xanthine dehydrogenase accessory factor  45.18 
 
 
242 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0761609  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1056  xanthine dehydrogenase accessory factor  45.18 
 
 
242 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.1872 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0986  xanthine dehydrogenase accessory factor  42.27 
 
 
243 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.044104  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  42.53 
 
 
356 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  43.9 
 
 
248 aa  133  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  45.6 
 
 
338 aa  133  7.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0474  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  47.83 
 
 
228 aa  133  7.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0496449  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  43.9 
 
 
244 aa  132  9e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  31.83 
 
 
346 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0125  hypothetical protein  27.65 
 
 
386 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1278  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5448  xanthine dehydrogenase accessory factor  47.06 
 
 
228 aa  127  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.87643  normal  0.175638 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  27.34 
 
 
379 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3910  xanthine dehydrogenase accessory factor  45.09 
 
 
234 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  29.84 
 
 
398 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1755  xanthine dehydrogenase accessory factor  41.49 
 
 
242 aa  124  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1787  xanthine dehydrogenase accessory factor  43.48 
 
 
233 aa  123  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112917  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2200  hypothetical protein  44.44 
 
 
230 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3673  xanthine dehydrogenase accessory factor  42.86 
 
 
233 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5313  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  43.48 
 
 
233 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.377214 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  30.5 
 
 
389 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  40.51 
 
 
318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  42.14 
 
 
329 aa  119  9e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3469  xanthine dehydrogenase accessory factor  41.82 
 
 
233 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0122  hypothetical protein  46.98 
 
 
313 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143026  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  32.36 
 
 
370 aa  118  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4321  hypothetical protein  42.59 
 
 
233 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1636  xanthine dehydrogenase accessory factor  41.61 
 
 
230 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.215395  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1935  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  42.04 
 
 
176 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000282048  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5191  protein of unknown function DUF182  27.99 
 
 
400 aa  117  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.337929 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  32.62 
 
 
362 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  45.28 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2480  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  30.58 
 
 
402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3433  protein of unknown function DUF182  28.43 
 
 
354 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2006  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  39.16 
 
 
249 aa  115  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.88376  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  27.82 
 
 
372 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2602  hypothetical protein  41.61 
 
 
230 aa  114  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  42.21 
 
 
225 aa  114  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  45.22 
 
 
306 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1293  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  40 
 
 
235 aa  113  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126009  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  38.85 
 
 
323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  43.31 
 
 
306 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1005  hypothetical protein  27.61 
 
 
351 aa  110  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1261  Xanthine dehydrogenase  28.69 
 
 
341 aa  110  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3033  protein of unknown function DUF182  47.13 
 
 
360 aa  109  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112795  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6028  hypothetical protein  39.05 
 
 
231 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0970  hypothetical protein  43.04 
 
 
216 aa  106  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1482  xanthine dehydrogenase accessory factor  38.1 
 
 
235 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0236654 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1138  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  33.16 
 
 
384 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2200  hypothetical protein  29.41 
 
 
382 aa  104  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707411 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  36.54 
 
 
340 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1581  hypothetical protein  29.22 
 
 
376 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4481  hypothetical protein  30.29 
 
 
395 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  36.54 
 
 
340 aa  97.8  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  37.82 
 
 
345 aa  96.7  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  28.35 
 
 
353 aa  96.3  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1257  hypothetical protein  46.15 
 
 
104 aa  96.3  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6439  hypothetical protein  41.98 
 
 
357 aa  96.3  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>