38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3393 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3393  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  680    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07770  uncharacterized conserved protein (DUF2332)  50.3 
 
 
322 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0887642 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0324  protein of unknown function UCP012608  49.4 
 
 
327 aa  263  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00596462  normal  0.0240651 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1968  protein of unknown function UCP012608  46.57 
 
 
328 aa  248  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000182349  unclonable  0.0000000414728 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4596  hypothetical protein  48.28 
 
 
274 aa  223  4e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.316655  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1412  hypothetical protein  41.89 
 
 
311 aa  211  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127467  hitchhiker  0.0000136786 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01400  uncharacterized conserved protein (DUF2332)  43.32 
 
 
325 aa  204  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1455  hypothetical protein  43.3 
 
 
294 aa  191  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0177  hypothetical protein  34.33 
 
 
353 aa  147  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.607974  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2974  hypothetical protein  28.57 
 
 
348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2761  hypothetical protein  28.9 
 
 
348 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0637564  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2973  hypothetical protein  28.9 
 
 
348 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2691  hypothetical protein  29.22 
 
 
348 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2969  hypothetical protein  29.22 
 
 
348 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000226097 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2711  hypothetical protein  28.9 
 
 
348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00787314  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2767  hypothetical protein  28.9 
 
 
348 aa  125  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617962  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3010  hypothetical protein  28.25 
 
 
348 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.253861  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3010  hypothetical protein  28.25 
 
 
348 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0357086  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1037  hypothetical protein  33.33 
 
 
371 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314959  normal  0.0209911 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06550  hypothetical protein  34.04 
 
 
391 aa  123  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2269  hypothetical protein  32.2 
 
 
241 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0672878 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2426  protein of unknown function UCP012608  33.43 
 
 
354 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0817  hypothetical protein  32.63 
 
 
355 aa  105  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10704  hypothetical protein  36.97 
 
 
349 aa  103  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4153  hypothetical protein  32.17 
 
 
363 aa  87.8  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.989771  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3766  hypothetical protein  35.29 
 
 
349 aa  85.5  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2746  hypothetical protein  35.03 
 
 
355 aa  84  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7454  hypothetical protein  33.2 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.774061  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0814  hypothetical protein  34.78 
 
 
362 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0858  hypothetical protein  34.07 
 
 
373 aa  72.8  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6238  hypothetical protein  31.73 
 
 
358 aa  70.5  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0225  protein of unknown function UCP012608  39.77 
 
 
179 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2918  hypothetical protein  32.98 
 
 
353 aa  67.4  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1263  hypothetical protein  32.09 
 
 
350 aa  65.1  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3591  hypothetical protein  37.58 
 
 
356 aa  63.5  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2028  hypothetical protein  31.63 
 
 
359 aa  59.7  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0314361 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4402  hypothetical protein  29.47 
 
 
372 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.930332 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5646  hypothetical protein  25.12 
 
 
372 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.145203 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>