201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3373 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3373  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  614  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3162  hypothetical protein  75 
 
 
362 aa  409  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0841875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5871  hypothetical protein  33.93 
 
 
369 aa  123  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000185366  normal  0.407546 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4422  hypothetical protein  38.34 
 
 
366 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0479  hypothetical protein  36.04 
 
 
348 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1383  hypothetical protein  35.4 
 
 
365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.068723  normal  0.317281 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0213  chromosome partitioning-like ATPase  37.03 
 
 
346 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4839  hypothetical protein  36.03 
 
 
359 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5422  hypothetical protein  34.78 
 
 
365 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4040  hypothetical protein  38.44 
 
 
366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79902  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0363  septum site determining protein  35.28 
 
 
348 aa  109  7.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000346854  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35930  hypothetical protein  33.23 
 
 
364 aa  105  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.184188 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0728  hypothetical protein  34.19 
 
 
359 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1983  septum site determining protein  32.44 
 
 
403 aa  103  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0129  putative septum site determining protein  35.46 
 
 
364 aa  94.4  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4806  hypothetical protein  34.2 
 
 
353 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.723828  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4892  hypothetical protein  34.2 
 
 
353 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.131307 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5193  hypothetical protein  34.57 
 
 
353 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000272361 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0591  septum site determining protein  36.57 
 
 
357 aa  84.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0053  hypothetical protein  35.36 
 
 
569 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.544146  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0476  hypothetical protein  34.96 
 
 
369 aa  79  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0000368033  normal  0.0256844 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3909  hypothetical protein  36.76 
 
 
355 aa  77.8  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0517  hypothetical protein  33.8 
 
 
352 aa  75.9  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13690  hypothetical protein  34.36 
 
 
350 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00103627  normal  0.200408 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4296  putative septum site determining protein  31.29 
 
 
402 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334486  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0618  hypothetical protein  35.64 
 
 
345 aa  65.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0275  hypothetical protein  35.87 
 
 
371 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2225  hypothetical protein  39.78 
 
 
265 aa  58.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.503048 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  33.16 
 
 
400 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  28.35 
 
 
412 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2520  septum site-determining protein MinD  24.71 
 
 
269 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000147543  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5329  putative septum site determining protein  29.17 
 
 
301 aa  57.4  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.499327  normal  0.108162 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33370  hypothetical protein  32.58 
 
 
309 aa  57.4  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.066941  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2113  septum site-determining protein MinD  24.71 
 
 
269 aa  57.8  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000128974  normal  0.232041 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25310  hypothetical protein  31.02 
 
 
235 aa  57  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3422  septum site-determining protein MinD  24.1 
 
 
266 aa  55.8  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00479465  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1689  septum site-determining protein (cell division inhibitor)  23.91 
 
 
276 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1688  septum site-determining protein (cell division inhibitor)  23.91 
 
 
276 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1205  septum site-determining protein MinD  26.1 
 
 
265 aa  54.7  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1931  septum site-determining protein MinD  24.23 
 
 
269 aa  54.7  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000172441  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  26.51 
 
 
387 aa  53.9  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2425  septum site-determining protein MinD  25.22 
 
 
269 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000184306  normal  0.063488 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1901  septum site-determining protein MinD  25.22 
 
 
269 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000001062  normal  0.370789 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1867  septum site-determining protein MinD  25.22 
 
 
269 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000037885  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1894  septum site-determining protein MinD  25.22 
 
 
269 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000304586  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2582  septum site-determining protein MinD  25.11 
 
 
269 aa  53.5  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195621  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1521  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  30.68 
 
 
398 aa  53.1  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1764  septum site-determining protein MinD  24.78 
 
 
269 aa  53.1  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000145291  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01605  septum site-determining protein MinD  23.32 
 
 
269 aa  53.1  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1078  septum site-determining protein MinD  26.18 
 
 
270 aa  53.1  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000761328  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  29.12 
 
 
400 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2400  cell division inhibitor MinD  25 
 
 
270 aa  52.8  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000176634  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2122  cell division inhibitor MinD  25 
 
 
270 aa  52.8  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00365598  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2011  cell division inhibitor MinD  25 
 
 
270 aa  52.8  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000962296  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2577  septum site-determining protein MinD  24.68 
 
 
269 aa  52  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2445  septum site-determining protein MinD  23.91 
 
 
269 aa  52  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000350464  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2185  septum site-determining protein MinD  23.91 
 
 
269 aa  52.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000542736  unclonable  0.00000174808 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  24.11 
 
 
412 aa  51.6  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  30 
 
 
383 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2174  septum site-determining protein MinD  24.78 
 
 
269 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000643693  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2251  septum site-determining protein MinD  24.78 
 
 
269 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000178028  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3038  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.61 
 
 
343 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0322  septum site-determining protein MinD  24.79 
 
 
271 aa  50.8  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0928879  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0445  septum site-determining protein MinD  22.39 
 
 
270 aa  50.8  0.00003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.103592  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2383  septum site-determining protein MinD  24.35 
 
 
269 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000153952  normal  0.326214 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2971  septum site-determining protein MinD  25.83 
 
 
271 aa  50.8  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0323  flp pilus assembly protein FlpE  31.08 
 
 
266 aa  50.4  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264858  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3342  septum site-determining protein MinD  23.68 
 
 
268 aa  50.4  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0868  septum site-determining protein MinD  22.22 
 
 
269 aa  50.4  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.662974  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1546  septum site-determining protein MinD  24.46 
 
 
276 aa  50.4  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000380987  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004087  septum site-determining protein MinD  24.89 
 
 
270 aa  50.1  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000729512  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0502  septum site-determining protein MinD  27.59 
 
 
271 aa  50.1  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0531405 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1703  septum site-determining protein MinD  26.99 
 
 
272 aa  50.1  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2235  cell division inhibitor MinD  24.62 
 
 
270 aa  49.7  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000561907  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2353  septum site-determining protein MinD  24.45 
 
 
277 aa  49.7  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.013257  normal  0.155337 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1954  cell division inhibitor MinD  24.57 
 
 
270 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00226645  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1957  cell division inhibitor MinD  24.57 
 
 
270 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000405698  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2014  cell division inhibitor MinD  24.57 
 
 
270 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00470279  normal  0.220645 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1502  cell division inhibitor MinD  24.57 
 
 
270 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0106864  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16660  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.61 
 
 
288 aa  49.3  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1318  cell division inhibitor MinD  24.57 
 
 
270 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000703051  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1628  septum site-determining protein MinD  23.81 
 
 
269 aa  49.3  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000684278  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3784  septum site-determining protein MinD  25.68 
 
 
266 aa  49.3  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0077808  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2007  cell division inhibitor MinD  24.23 
 
 
270 aa  49.3  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5651  septum site-determining protein MinD  24.47 
 
 
271 aa  49.3  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531855  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  32.31 
 
 
756 aa  49.3  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  21.53 
 
 
284 aa  48.9  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  25 
 
 
397 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  29.6 
 
 
381 aa  48.5  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1939  cell division inhibitor MinD  24.62 
 
 
270 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2336  septum site-determining protein MinD  24.14 
 
 
270 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0379601  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1996  cell division inhibitor MinD  24.89 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000863698  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0633  septum site-determining protein MinD  23.32 
 
 
271 aa  48.5  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01384  septum formation inhibitor-activating ATPase  24.46 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2473  septum site-determining protein MinD  24.9 
 
 
270 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0020932  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.71 
 
 
377 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0773  chromosome partitioning ATPase protein-like  32.12 
 
 
445 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1660  cell division inhibitor MinD  24.9 
 
 
270 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000129404  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1736  septum site-determining protein MinD  23.81 
 
 
269 aa  47.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.112551  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6587  septum site-determining protein MinD  24.23 
 
 
272 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236177 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>