67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3351 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3351  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 
278 aa  577  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18060  sugar phosphate isomerase/epimerase  57.65 
 
 
295 aa  305  4.0000000000000004e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00570  sugar phosphate isomerase/epimerase  52.53 
 
 
294 aa  268  5e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0473  xylose isomerase-like  50.78 
 
 
308 aa  265  5e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17470  sugar phosphate isomerase/epimerase  49.82 
 
 
325 aa  263  3e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105049  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6143  xylose isomerase domain-containing protein  50.39 
 
 
288 aa  257  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.536999  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0476  xylose isomerase domain-containing protein  50.79 
 
 
262 aa  256  3e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9139  Sugar phosphate isomerase/epimerase-like protein  48.88 
 
 
270 aa  255  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0185  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  49.21 
 
 
284 aa  252  4.0000000000000004e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5002  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  49.42 
 
 
312 aa  252  5.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0821356  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3410  xylose isomerase domain-containing protein  49.41 
 
 
272 aa  251  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.498178  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3200  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  51.94 
 
 
287 aa  251  1e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.278083  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0407  xylose isomerase domain-containing protein  48.65 
 
 
295 aa  250  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0340  xylose isomerase domain-containing protein  48.26 
 
 
302 aa  250  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4464  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  49.61 
 
 
294 aa  248  6e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4928  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  50.39 
 
 
268 aa  247  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8356  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  47.79 
 
 
305 aa  243  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2709  hypothetical protein  48.05 
 
 
305 aa  243  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320407  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5758  Xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  47.45 
 
 
263 aa  242  5e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625631  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10507  hypothetical protein  47.45 
 
 
280 aa  237  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0480257  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0835  xylose isomerase domain-containing protein  45.09 
 
 
281 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.279878  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0077  xylose isomerase domain-containing protein  44.36 
 
 
281 aa  228  6e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0659  xylose isomerase domain-containing protein  44.36 
 
 
281 aa  227  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.748247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0666  xylose isomerase-like TIM barrel  44.36 
 
 
281 aa  227  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0658  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  43.54 
 
 
280 aa  227  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0679  xylose isomerase domain-containing protein  44.36 
 
 
281 aa  227  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.419765 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6746  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  47.33 
 
 
272 aa  223  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249045  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24530  sugar phosphate isomerase/epimerase  47.45 
 
 
261 aa  223  4e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.482145  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0249  xylose isomerase domain-containing protein  45.7 
 
 
265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.273491  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1001  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  43.46 
 
 
295 aa  211  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02720  sugar phosphate isomerase/epimerase  43.68 
 
 
266 aa  203  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3029  xylose isomerase-like TIM barrel  27.47 
 
 
265 aa  87.8  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.599496  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1512  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.4 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2704  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.4 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000134824 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2906  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.28 
 
 
291 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0975  xylose isomerase domain-containing protein  28.1 
 
 
269 aa  77  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000320481  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0516  hypothetical protein  26.77 
 
 
263 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0218037  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  29.61 
 
 
268 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  29.82 
 
 
268 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  29.38 
 
 
268 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3750  fructoselysine 3-epimerase  22.18 
 
 
276 aa  60.1  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238004  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3842  fructoselysine 3-epimerase  22.18 
 
 
276 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4684  fructoselysine 3-epimerase  22.18 
 
 
275 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0340  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.18 
 
 
276 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03175  hypothetical protein  22.18 
 
 
276 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03223  predicted isomerase  22.18 
 
 
276 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3568  fructoselysine 3-epimerase  22.18 
 
 
276 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0340  fructoselysine 3-epimerase  22.18 
 
 
276 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.452792 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  24.5 
 
 
264 aa  56.2  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.01 
 
 
264 aa  55.8  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  24.6 
 
 
268 aa  52.8  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1261  endonuclease IV  26.6 
 
 
259 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.645529  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1640  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  20.27 
 
 
270 aa  50.8  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.264646  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1978  xylose isomerase domain-containing protein  24.71 
 
 
274 aa  49.3  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2524  xylose isomerase domain-containing protein  29.46 
 
 
287 aa  49.3  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3010  xylose isomerase-like TIM barrel  24.71 
 
 
281 aa  48.9  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  30.4 
 
 
255 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5093  endonuclease IV  26.96 
 
 
250 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.254368  normal  0.214987 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0988  xylose isomerase domain-containing protein  26.86 
 
 
253 aa  47  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.279783 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1980  xylose isomerase domain-containing protein  21.07 
 
 
274 aa  46.6  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0781  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.94 
 
 
282 aa  46.6  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  33.91 
 
 
257 aa  45.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4979  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.14 
 
 
283 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426661  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  28.02 
 
 
244 aa  43.9  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0530  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.6 
 
 
273 aa  43.9  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3944  AP endonuclease  34.62 
 
 
285 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0718494  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0323  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.67 
 
 
536 aa  42.7  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>