48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3245 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3245  flavodoxin-like protein  100 
 
 		 176 aa  353  6.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2314  flavodoxin-like  37.5 
 
 		 170 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0403811  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2554  Flavodoxin-like protein  34.64 
 
 		 169 aa  98.2  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1410  Flavodoxin-like protein  32.39 
 
 		 175 aa  92.8  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00810371 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3023  flavodoxin  37.14 
 
 		 170 aa  85.1  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2108  flavodoxin-like protein  32.95 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0677138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0573  protoporphyrinogen oxidase  33.33 
 
 		 167 aa  76.6  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307777 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1632  flavodoxin-like protein  31.38 
 
 		 193 aa  74.3  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.138919  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1824  flavodoxin  31.52 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1685  flavodoxin  31.61 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0906832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2562  Flavodoxin-like protein  29.78 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2492  flavodoxin-like protein  30.59 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0168  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.74 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29950  hypothetical protein  35.33 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4171  flavodoxin-like protein  32.74 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2409  protoporphyrinogen oxidase  32.39 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136205  normal  0.0149961 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00340  flavodoxin  29.67 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2438  Flavodoxin-like protein  32.58 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000794828  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1699  flavodoxin  26.7 
 
 		 176 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1035  protoporphyrinogen oxidase  29.83 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.395736  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19080  flavodoxin  30.11 
 
 		 159 aa  52.8  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0077  flavodoxin-like protein  24.71 
 
 		 160 aa  50.8  0.000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03990  Flavodoxin  31.68 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000376234  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0141  Protoporphyrinogen oxidase  27.07 
 
 		 173 aa  50.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3743  protoporphyrinogen oxidase  35.29 
 
 		 179 aa  48.1  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000514113  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0029  protoporphyrinogen oxidase  25.27 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00401521  normal  0.0528505 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3929  protoporphyrinogen oxidase  33.72 
 
 		 177 aa  45.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000339774  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1916  protoporphyrinogen oxidase  33.72 
 
 		 177 aa  45.8  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000017226  normal  0.191063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3662  hypothetical protein  29.05 
 
 		 140 aa  45.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.35074  normal  0.580287 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0287  protoporphyrinogen oxidase  33.72 
 
 		 177 aa  45.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000232863  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3897  protoporphyrinogen oxidase  32.94 
 
 		 179 aa  45.4  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0092686  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3790  protoporphyrinogen oxidase  22.35 
 
 		 175 aa  45.1  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0025  protoporphyrinogen oxidase  23.98 
 
 		 177 aa  45.1  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00109828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0027  protoporphyrinogen oxidase  24.86 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0184042 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03690  hypothetical protein  30.23 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000962205  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5289  protoporphyrinogen oxidase  30.23 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000241436  normal  0.0811334 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03741  protoporphyrin oxidase, flavoprotein  30.23 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00160389  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4231  protoporphyrinogen oxidase  30.23 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000133684  normal  0.0229749 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4160  protoporphyrinogen oxidase  30.23 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000131743  decreased coverage  0.00000239257 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4073  protoporphyrinogen oxidase  30.23 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000311087  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4131  Protoporphyrinogen oxidase  30.23 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000348526  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4230  protoporphyrinogen oxidase  32.94 
 
 		 179 aa  42  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0023265  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3945  protoporphyrinogen oxidase  31.4 
 
 		 180 aa  42  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000851494  decreased coverage  0.00158179 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4320  protoporphyrinogen oxidase  29.07 
 
 		 181 aa  41.6  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000364139  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0266  protoporphyrinogen oxidase  26.7 
 
 		 177 aa  41.6  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0106275  normal  0.013044 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4369  protoporphyrinogen oxidase  29.07 
 
 		 181 aa  41.6  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000843735  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1106  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.13 
 
 		 156 aa  41.6  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.796872  normal  0.0316992 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3403  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.4 
 
 		 193 aa  41.2  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.200863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>