208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3225 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  91.59 
 
 
546 aa  944    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  100 
 
 
561 aa  1129    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  37.25 
 
 
572 aa  256  8e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  32.38 
 
 
627 aa  229  7e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  38.06 
 
 
442 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  35.47 
 
 
432 aa  205  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0483  hypothetical protein  46.45 
 
 
633 aa  194  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  48.48 
 
 
661 aa  193  8e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  51.72 
 
 
469 aa  190  5.999999999999999e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  39.91 
 
 
469 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  32.57 
 
 
485 aa  153  8.999999999999999e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  31.99 
 
 
407 aa  152  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  29.68 
 
 
408 aa  150  7e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  32.56 
 
 
413 aa  148  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1896  HNH endonuclease  36.65 
 
 
418 aa  126  8.000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0183  HNH endonuclease  35.29 
 
 
417 aa  125  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1835  hypothetical protein  28.9 
 
 
489 aa  124  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2273  HNH endonuclease  34.68 
 
 
418 aa  124  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.538872  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4731  hypothetical protein  30.77 
 
 
507 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  51.92 
 
 
494 aa  120  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3231  hypothetical protein  29.82 
 
 
510 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4397  hypothetical protein  29.27 
 
 
501 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5741  hypothetical protein  30.51 
 
 
519 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11151  hypothetical protein  27.79 
 
 
451 aa  118  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5454  hypothetical protein  30.26 
 
 
519 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157039  decreased coverage  0.0069948 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1730  hypothetical protein  30.08 
 
 
507 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1777  hypothetical protein  30.08 
 
 
507 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159063  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1709  hypothetical protein  30.08 
 
 
507 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4014  hypothetical protein  29.16 
 
 
464 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00728967 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4351  hypothetical protein  30.26 
 
 
507 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489972  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4437  hypothetical protein  30.26 
 
 
507 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.835135  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4912  hypothetical protein  29.05 
 
 
508 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477526  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3542  hypothetical protein  28.97 
 
 
444 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  28.97 
 
 
444 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5865  hypothetical protein  29.05 
 
 
511 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563621  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4827  hypothetical protein  29.31 
 
 
508 aa  114  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.79889  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3477  hypothetical protein  28.28 
 
 
506 aa  114  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.800826  normal  0.648899 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2106  hypothetical protein  28.72 
 
 
446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2779  hypothetical protein  28.97 
 
 
473 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  28.83 
 
 
442 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  28.83 
 
 
442 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2152  hypothetical protein  28.72 
 
 
492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.166446 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0327  hypothetical protein  29.85 
 
 
490 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  28.98 
 
 
447 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11717  hypothetical protein  27.54 
 
 
454 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.12455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3484  hypothetical protein  29.23 
 
 
552 aa  112  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210016  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4232  hypothetical protein  29.95 
 
 
448 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  28.46 
 
 
444 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0338  hypothetical protein  28.72 
 
 
492 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0348  hypothetical protein  28.72 
 
 
492 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2749  hypothetical protein  28.97 
 
 
473 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.621595  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2793  hypothetical protein  28.97 
 
 
473 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.925956  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4610  hypothetical protein  29.43 
 
 
448 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2089  hypothetical protein  29.41 
 
 
493 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4451  hypothetical protein  28.19 
 
 
518 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3851  hypothetical protein  28.12 
 
 
513 aa  105  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.432378 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2293  protein of unknown function DUF222  28.25 
 
 
540 aa  103  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2332  HNH endonuclease  41.58 
 
 
620 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.611085 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1199  hypothetical protein  27.84 
 
 
505 aa  101  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3379  hypothetical protein  27.01 
 
 
497 aa  100  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  29.7 
 
 
414 aa  99.8  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3050  hypothetical protein  26.63 
 
 
495 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3314  hypothetical protein  27.06 
 
 
526 aa  99.4  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0608226  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  28.23 
 
 
464 aa  98.6  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  37.5 
 
 
580 aa  96.7  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  38.19 
 
 
414 aa  96.3  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  37.89 
 
 
580 aa  95.9  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  27.87 
 
 
441 aa  94.7  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11173  hypothetical protein  27.15 
 
 
499 aa  94  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  39.07 
 
 
499 aa  93.2  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  35.1 
 
 
530 aa  92  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1280  HNH nuclease  29.55 
 
 
414 aa  91.3  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  35.21 
 
 
605 aa  89.7  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  37.32 
 
 
584 aa  88.6  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  35.21 
 
 
558 aa  87  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  36.59 
 
 
535 aa  87  9e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  31.56 
 
 
391 aa  86.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11974  hypothetical protein  27.42 
 
 
454 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18050  hypothetical protein  27.37 
 
 
577 aa  84.7  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418777  normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23120  hypothetical protein  26.78 
 
 
522 aa  84.3  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0151991  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26200  hypothetical protein  27.88 
 
 
526 aa  83.6  0.000000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17853  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2802  protein of unknown function DUF222  27.22 
 
 
551 aa  83.6  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0845411  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  26.48 
 
 
531 aa  82  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4824  protein of unknown function DUF222  28.57 
 
 
553 aa  81.6  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2470  protein of unknown function DUF222  26.3 
 
 
437 aa  80.9  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4127  protein of unknown function DUF222  26.2 
 
 
532 aa  80.5  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0067  HNH endonuclease  31.63 
 
 
458 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  32.73 
 
 
628 aa  79  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4861  HNH endonuclease  28.73 
 
 
472 aa  75.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.254841 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  36.52 
 
 
551 aa  75.1  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0273  hypothetical protein  34.35 
 
 
466 aa  74.7  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.88175  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  35.76 
 
 
620 aa  73.9  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  34.07 
 
 
566 aa  73.9  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4621  hypothetical protein  34.35 
 
 
481 aa  73.9  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.957856  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2809  HNH endonuclease  33.73 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  34.51 
 
 
714 aa  73.6  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2373  hypothetical protein  41.84 
 
 
480 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.022356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4558  hypothetical protein  41.05 
 
 
489 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361669  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01610  hypothetical protein  26.72 
 
 
538 aa  72.8  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.746521  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3811  protein of unknown function DUF222  25.56 
 
 
593 aa  71.2  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>