More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3203 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3203  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
328 aa  670    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2023  family 2 glycosyl transferase  33.58 
 
 
292 aa  152  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1638  glycosyl transferase family protein  34.21 
 
 
322 aa  149  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1395  glycosyltransferase  34.36 
 
 
300 aa  142  9e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.438596  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2743  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 
297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08750  predicted glycosyltransferase  35.79 
 
 
313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0987948  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0630  glycosyl transferase family 2  35.48 
 
 
315 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1180  glycosyltransferase, group 2 family protein  29.7 
 
 
322 aa  124  2e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1742  glycosyltransferase  31.71 
 
 
306 aa  123  3e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1625  family 2 glycosyl transferase  31.09 
 
 
293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1169  glycosyl transferase family 2  33.68 
 
 
615 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390036  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0127  glycosyl transferase family 2  35.43 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4543  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  33.88 
 
 
303 aa  114  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4361  glycosyl transferase family 2  34.07 
 
 
302 aa  112  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.972233 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0850  glycosyl transferase family 2  36.79 
 
 
323 aa  112  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20870  predicted glycosyltransferase  31.82 
 
 
334 aa  100  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1400  glycosyl transferase family protein  30.12 
 
 
306 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1399  glycosyl transferase family protein  30.96 
 
 
315 aa  99.4  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3890  glycosyl transferase family 2  35.92 
 
 
633 aa  94  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1497  glycosyltransferase  26.98 
 
 
304 aa  87  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.041756  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2615  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 
298 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106045  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4001  hypothetical protein  30.04 
 
 
320 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891502  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  23.72 
 
 
754 aa  75.5  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2348  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000992199 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 
489 aa  73.2  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0780  putative glycosyl transferase  29 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0260013  normal  0.0469615 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0877  putative glycosyl transferase  29 
 
 
297 aa  72.8  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.277014 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0843  putative glycosyl transferase  28.14 
 
 
297 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000580713 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  20.97 
 
 
314 aa  72  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0288  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2264  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.48 
 
 
296 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4102  glycosyl transferase family 2  34.62 
 
 
313 aa  68.9  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.694392  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0081  glycosyl transferase family 2  27.16 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 
455 aa  66.2  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 
305 aa  65.9  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0078  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.63 
 
 
327 aa  65.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.780673  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  24.41 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  23.44 
 
 
298 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2546  glycosyl transferase family 2  29.86 
 
 
341 aa  64.3  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0821  glycosyltransferase, group 2 family protein  27.4 
 
 
344 aa  63.9  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  26.11 
 
 
722 aa  63.9  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3445  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.11 
 
 
333 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867023  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2177  rhamnosyltransferase  26.59 
 
 
323 aa  63.5  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  27.15 
 
 
302 aa  63.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.32 
 
 
315 aa  62.8  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 
315 aa  62.8  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4321  glycosyl transferase family 2  31.71 
 
 
307 aa  62.8  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1125  glycosyl transferase family 2  29.09 
 
 
329 aa  62.4  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  23.99 
 
 
299 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0057  putative glycosyltransferase  25.42 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.395036  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3730  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 
336 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.202885 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  22.48 
 
 
303 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0276  glycosyl transferase family 2  30.85 
 
 
301 aa  60.5  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0949477  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3397  rhamnosyltransferase  28 
 
 
294 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385877  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1383  glycosyltransferase-like protein  27.06 
 
 
954 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  24.5 
 
 
320 aa  59.7  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3227  glycosyl transferase family protein  25.85 
 
 
333 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4992  glycosyl transferase family protein  33 
 
 
297 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5080  glycosyl transferase family protein  33 
 
 
297 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.566674 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5373  glycosyl transferase family protein  33 
 
 
297 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6236  rhamnosyltransferase  26.79 
 
 
294 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240243  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  21.57 
 
 
339 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01490  predicted glycosyltransferase  30.41 
 
 
303 aa  58.9  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.731654  normal  0.0270435 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6405  rhamnosyltransferase  26.79 
 
 
294 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6638  rhamnosyltransferase  26.79 
 
 
294 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.204482  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  25.86 
 
 
318 aa  58.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0818  hypothetical protein  21.57 
 
 
339 aa  57.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0752  family 2 glycosyl transferase  33.64 
 
 
997 aa  57.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.069226 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3216  glycosyl transferase family 2  25.25 
 
 
302 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 
297 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0722  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 
472 aa  57  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.693159 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  24.46 
 
 
317 aa  57  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  23.47 
 
 
300 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5619  glycosyl transferase family protein  30.12 
 
 
313 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
299 aa  57  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  25.43 
 
 
298 aa  56.2  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2514  hypothetical protein  33.61 
 
 
1074 aa  56.2  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  21.61 
 
 
311 aa  55.8  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0132  glycosyl transferase family 2  31.66 
 
 
298 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  22.45 
 
 
338 aa  55.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 
366 aa  54.7  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  27.19 
 
 
1435 aa  55.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  26.74 
 
 
333 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  22.33 
 
 
320 aa  54.3  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1377  glycosyl transferase family protein  28.43 
 
 
297 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0605163 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
1268 aa  54.3  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2951  glycosyl transferase family 2  24.47 
 
 
314 aa  53.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.769684  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4231  glycosyl transferase family protein  33.93 
 
 
360 aa  53.5  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  23.5 
 
 
288 aa  53.1  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1643  glycosyl transferase family 2  24.36 
 
 
324 aa  53.1  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2693  glycosyl transferase family protein  41.77 
 
 
671 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.316585  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  26.15 
 
 
282 aa  53.1  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  22.75 
 
 
305 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4246  glycosyl transferase family protein  27.74 
 
 
354 aa  53.1  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.691572  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 
289 aa  53.1  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13816  L-rhamnosyltransferase  31.86 
 
 
304 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.660189 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  34.62 
 
 
1099 aa  52.8  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  23.51 
 
 
327 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0122  glycosyl transferase family 2  25.53 
 
 
378 aa  52.8  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000124856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>