235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3186 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 271 aa  562  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  84.7 
 
 		 271 aa  477  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3260  beta-lactamase domain-containing protein  36.84 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 272 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1653  beta-lactamase domain-containing protein  37.72 
 
 		 238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.139658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3034  beta-lactamase domain-containing protein  35.53 
 
 		 275 aa  123  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.641137 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  32.85 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  34.5 
 
 		 321 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  32.22 
 
 		 298 aa  105  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  37.62 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.68 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.231237 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  32.84 
 
 		 342 aa  102  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  35.68 
 
 		 327 aa  99  8e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7059  beta-lactamase domain protein  32.5 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  32.46 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  34.45 
 
 		 349 aa  96.7  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  30.12 
 
 		 299 aa  93.2  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  31.27 
 
 		 287 aa  93.2  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  28.05 
 
 		 319 aa  92.4  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  27.64 
 
 		 319 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  33.66 
 
 		 314 aa  91.7  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  27.64 
 
 		 319 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 319 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  30 
 
 		 319 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 336 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 		 321 aa  90.5  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  34.18 
 
 		 321 aa  90.1  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 339 aa  89.4  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 339 aa  89  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  29.52 
 
 		 319 aa  89  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  29.52 
 
 		 319 aa  88.2  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  29.61 
 
 		 323 aa  88.2  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  29.88 
 
 		 332 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  28.28 
 
 		 319 aa  87.4  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 321 aa  85.5  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  32.07 
 
 		 315 aa  85.5  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  29.86 
 
 		 332 aa  85.5  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  33.18 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  30.81 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  28.57 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  30.81 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  30.29 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  29.95 
 
 		 335 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  29.95 
 
 		 335 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  29.33 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  31.42 
 
 		 317 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  29.39 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  32.67 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  32.67 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  30.08 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  32.67 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  30.35 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  32.67 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  32.67 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  32.67 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  32.67 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  28.63 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  32.67 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  30.08 
 
 		 316 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  28.39 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  30.29 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  28.63 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  30.3 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  32.67 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  29.15 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  30.36 
 
 		 364 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  30.51 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  29.25 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  29.27 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  29.48 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11942  hypothetical protein  28.57 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  30.29 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  30.84 
 
 		 264 aa  75.5  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  29.91 
 
 		 364 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  27.54 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1709  beta-lactamase-like  27.53 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.587452  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  27.47 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3402  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433473  normal  0.430357 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1269  beta-lactamase domain-containing protein  31.88 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  31.16 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  30.33 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  23.58 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  28.37 
 
 		 317 aa  72.4  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  25 
 
 		 362 aa  72.4  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1866  beta-lactamase domain protein  32.86 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.914687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  31.02 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2963  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  25.73 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0775  beta-lactamase domain-containing protein  29.66 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.366597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1646  beta-lactamase domain-containing protein  25.51 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  29.63 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  25.84 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  27.16 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  27.8 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  27.8 
 
 		 318 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.33 
 
 		 319 aa  67  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  28.81 
 
 		 310 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>