245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3174 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  448  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  77.25 
 
 		 234 aa  322  4e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 244 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 244 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  60.19 
 
 		 244 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  40.45 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  37.05 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  31.42 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 224 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 210 aa  99.8  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  37.44 
 
 		 218 aa  98.6  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  30.8 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 218 aa  93.2  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  30.8 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  42.38 
 
 		 218 aa  92.4  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 239 aa  89.4  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 240 aa  88.2  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 207 aa  88.2  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 222 aa  87.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 224 aa  85.1  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  31.82 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1495  TetR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.969103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2719  transcriptional regulator, TetR family  28.91 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4056  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.910923  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 315 aa  78.6  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  29.6 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  40.21 
 
 		 173 aa  77.8  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  34.01 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 245 aa  72  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10210  transcriptional regulator  26.62 
 
 		 272 aa  71.6  0.000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.472309  normal  0.0650558 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  33.79 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0414  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  27.9 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  31.01 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  25.53 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  24.54 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  28.83 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  35.65 
 
 		 267 aa  65.1  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  33.97 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4572  putative transcriptional regulator, TetR family  33.49 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145324  normal  0.111989 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1632  Tetracyclin repressor domain protein  27.35 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0188717 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1404  hypothetical protein  26.75 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.245587  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  26.91 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 272 aa  62  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 218 aa  62  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 343 aa  62  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6418  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 259 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3085  regulatory protein, TetR  25.48 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.355286  normal  0.26404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  29.49 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1017  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.056125 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6425  putative transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857124 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>