76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3126 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3126  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  100 
 
 		 307 aa  597  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2821  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  66.25 
 
 		 289 aa  360  2e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00171982 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1776  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  50.21 
 
 		 245 aa  201  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.324205  normal  0.011171 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2795  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  48.75 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.048407  hitchhiker  0.00112635 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2078  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  48.72 
 
 		 238 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18840  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.03 
 
 		 515 aa  168  9e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00867929  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00880  hypothetical protein  43.53 
 
 		 251 aa  157  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28310  hypothetical protein  46.35 
 
 		 306 aa  149  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09950  hypothetical protein  46.31 
 
 		 249 aa  148  9e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640484  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1626  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.15 
 
 		 531 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0657  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.44 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.415953  normal  0.211128 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0300  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  37.35 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5921  hypothetical protein  39.38 
 
 		 250 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1785  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  41.06 
 
 		 255 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0615189  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1890  putative secreted protein  40.16 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.813593  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1324  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  45.15 
 
 		 275 aa  116  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215746  normal  0.208215 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10263  hypothetical protein  34.93 
 
 		 247 aa  116  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.826629  normal  0.120754 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2684  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.21 
 
 		 234 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55876  normal  0.318359 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1615  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.8 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.767556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3504  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  39.17 
 
 		 244 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2247  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  38.08 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.0131126 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.65 
 
 		 230 aa  106  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  decreased coverage  0.000000457043 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1378  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  38.97 
 
 		 238 aa  106  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.365904  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0262  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  39.42 
 
 		 231 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0272  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  39.42 
 
 		 231 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.243812 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0381  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  38.5 
 
 		 252 aa  105  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00853901 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0841  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.27 
 
 		 252 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000619723  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1812  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  38.55 
 
 		 249 aa  104  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.130446  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2817  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  40.33 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0252  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  38.94 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7383  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  38.15 
 
 		 253 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.882429 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12421  hypothetical protein  33.47 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2348  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.71 
 
 		 247 aa  100  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511172  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3859  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.33 
 
 		 234 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.72846  normal  0.0769538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6698  sirohydrochlorin cobaltochelatase  36.03 
 
 		 253 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99079  normal  0.371849 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3489  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.19 
 
 		 234 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1128  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.19 
 
 		 228 aa  87.4  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.421217  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3170  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.19 
 
 		 242 aa  86.3  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.803624  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3476  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.76 
 
 		 234 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3539  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.76 
 
 		 234 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12790  hypothetical protein  33.87 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3702  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.89 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.512385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4082  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.07 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1231  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  41.91 
 
 		 238 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4371  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.11 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.52 
 
 		 553 aa  65.9  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.459561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2699  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.1 
 
 		 550 aa  64.7  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2804  hitchhiker  0.000140912 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4163  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.64 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108946  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0297  hypothetical protein  34.01 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.625672 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1271  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.91 
 
 		 465 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0646  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.64 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00275078  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4925  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.82 
 
 		 127 aa  50.4  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1023  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.27 
 
 		 309 aa  50.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2430  hypothetical protein  32.89 
 
 		 229 aa  48.5  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0644  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.46 
 
 		 472 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44995  predicted protein  40.62 
 
 		 1217 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00833272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6031  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.21 
 
 		 288 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1722  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.53 
 
 		 127 aa  47.8  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1967  hypothetical protein  23.49 
 
 		 236 aa  47  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203988  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2174  cbiX domain protein  23.49 
 
 		 236 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2615  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  23.14 
 
 		 275 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2360  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  25.94 
 
 		 520 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3165  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.17 
 
 		 134 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1918  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.63 
 
 		 127 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1994  CbiX domain-containing protein  23.17 
 
 		 236 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2143  CbiX domain-containing protein  23.17 
 
 		 236 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.458667  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2563  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.27 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.523631  normal  0.848204 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0988  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.73 
 
 		 410 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5164  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  43.9 
 
 		 301 aa  43.5  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2425  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.19 
 
 		 243 aa  43.1  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0985952  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2473  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.19 
 
 		 243 aa  43.1  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0617296  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2405  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35 
 
 		 127 aa  42.7  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0914796  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0104  sirohydrochlorin cobaltochelatase  29.01 
 
 		 129 aa  42.7  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7366  putative transmembrane protein  25 
 
 		 275 aa  42.7  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0247614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2707  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.41 
 
 		 127 aa  42.4  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.079743  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1096  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.31 
 
 		 127 aa  42.4  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>