60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3057 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3057  hypothetical protein  100 
 
 
494 aa  978    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3060  hypothetical protein  44.58 
 
 
434 aa  251  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.647331  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3543  putative integral membrane protein  37.62 
 
 
428 aa  150  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21610  Protein of unknown function (DUF2029)  36.07 
 
 
421 aa  149  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0338543  normal  0.0110628 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5506  hypothetical protein  35.62 
 
 
395 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344164  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2502  Protein of unknown function DUF2029  35.02 
 
 
414 aa  143  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  36.65 
 
 
420 aa  143  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1126  Protein of unknown function DUF2029  32.36 
 
 
425 aa  143  8e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2968  putative integral membrane protein  34.58 
 
 
430 aa  140  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3276  putative integral membrane protein  34.54 
 
 
418 aa  136  8e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3338  putative integral membrane protein  34.54 
 
 
418 aa  136  8e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3287  putative integral membrane protein  35.4 
 
 
418 aa  134  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505534  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12209  integral membrane protein  32.38 
 
 
427 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4020  Protein of unknown function DUF2029  33.64 
 
 
426 aa  123  7e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643753  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4322  mannosyltransferase  33.23 
 
 
417 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2282  Protein of unknown function DUF2029  32.99 
 
 
469 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291881  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4234  sugar transporter superfamily protein  33.85 
 
 
402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3224  hypothetical protein  37.29 
 
 
378 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0743  mannosyltransferase  29.94 
 
 
398 aa  114  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6115  hypothetical protein  28.6 
 
 
479 aa  114  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112096  normal  0.027736 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0243  putative integral membrane protein  32.57 
 
 
417 aa  113  9e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2198  hypothetical protein  34.49 
 
 
408 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2916  hypothetical protein  33.65 
 
 
470 aa  110  7.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189824  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0139  hypothetical protein  31.17 
 
 
437 aa  107  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0425  hypothetical protein  30.49 
 
 
417 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0435  hypothetical protein  30.49 
 
 
417 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2153  mannosyltransferase  31.22 
 
 
369 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0955915  normal  0.0100871 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  32.57 
 
 
570 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5329  hypothetical protein  31.21 
 
 
478 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4045  mannosyltransferase  32.48 
 
 
443 aa  103  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4120  mannosyltransferase  32.48 
 
 
443 aa  103  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.703888 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4274  mannosyltransferase  32.48 
 
 
443 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0468  mannosyltransferase  31.5 
 
 
422 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06020  Protein of unknown function (DUF2029)  30.81 
 
 
444 aa  103  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0479  mannosyltransferase  31.5 
 
 
422 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0455  mannosyltransferase  31.5 
 
 
422 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3057  Protein of unknown function DUF2029  31.31 
 
 
455 aa  101  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0888832  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1016  hypothetical protein  32.13 
 
 
419 aa  100  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4089  hypothetical protein  33.33 
 
 
408 aa  99.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11183  mannosyltransferase  29.53 
 
 
431 aa  99  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000655823  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1385  hypothetical protein  32.92 
 
 
412 aa  98.6  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488241  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21600  Protein of unknown function (DUF2029)  29.58 
 
 
467 aa  95.9  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0988113  hitchhiker  0.00696231 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5055  hypothetical protein  27.32 
 
 
477 aa  95.5  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4550  mannosyltransferase  30.03 
 
 
406 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0993  hypothetical protein  32.73 
 
 
411 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4545  hypothetical protein  30.87 
 
 
477 aa  90.1  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0453  mannosyltransferase  28.68 
 
 
438 aa  90.1  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355546  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0466  mannosyltransferase  28.68 
 
 
438 aa  90.1  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0477  mannosyltransferase  28.68 
 
 
438 aa  90.1  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1343  hypothetical protein  33.33 
 
 
410 aa  89.7  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1125  hypothetical protein  31.08 
 
 
408 aa  89.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.51418  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0070  hypothetical protein  31.37 
 
 
455 aa  88.2  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3685  hypothetical protein  33.83 
 
 
420 aa  84  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0119  hypothetical protein  31.25 
 
 
429 aa  84  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0478  mannosyltransferase  28.79 
 
 
428 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0467  mannosyltransferase  28.79 
 
 
428 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0454  mannosyltransferase  28.79 
 
 
428 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2285  Protein of unknown function DUF2029  31.05 
 
 
463 aa  76.6  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3880  putative conserved membrane protein  29.08 
 
 
375 aa  66.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561968 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3867  hypothetical protein  24.77 
 
 
734 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0838155  normal  0.221167 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>