More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3034 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  100 
 
 
292 aa  589  1e-167  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  69.78 
 
 
267 aa  353  2.9999999999999997e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  67.18 
 
 
264 aa  351  8e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  64.53 
 
 
278 aa  350  1e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  66.04 
 
 
273 aa  349  3e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  64.93 
 
 
280 aa  349  4e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  56.85 
 
 
278 aa  323  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  55.73 
 
 
301 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  55.77 
 
 
297 aa  300  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  56.93 
 
 
295 aa  298  7e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  52.85 
 
 
288 aa  281  7.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  53.76 
 
 
269 aa  278  8e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  48.53 
 
 
258 aa  275  6e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  53.36 
 
 
276 aa  273  3e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  51.74 
 
 
290 aa  262  6e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  51.01 
 
 
253 aa  261  8e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  54.98 
 
 
251 aa  261  1e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  48.08 
 
 
254 aa  258  7e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  49.62 
 
 
261 aa  258  7e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  48.29 
 
 
266 aa  258  9e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  48.85 
 
 
254 aa  258  9e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  49.23 
 
 
254 aa  258  1e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  48.46 
 
 
254 aa  258  1e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  53.25 
 
 
252 aa  258  1e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  48.86 
 
 
253 aa  257  2e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  50.57 
 
 
267 aa  257  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  48.06 
 
 
264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  50 
 
 
284 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  49.44 
 
 
267 aa  253  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  51.5 
 
 
254 aa  252  6e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  53.69 
 
 
274 aa  251  7e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  47.62 
 
 
260 aa  251  1e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  51.95 
 
 
263 aa  250  2e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  54.55 
 
 
272 aa  249  5e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  47.33 
 
 
289 aa  248  8e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
272 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  50 
 
 
272 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  51.28 
 
 
293 aa  247  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  50.21 
 
 
278 aa  247  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  52.16 
 
 
265 aa  247  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
272 aa  247  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  50.65 
 
 
260 aa  247  2e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  55.25 
 
 
260 aa  246  3e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  51.5 
 
 
293 aa  246  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  51.97 
 
 
304 aa  246  4e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  46.92 
 
 
274 aa  244  9e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5603  ABC transporter related protein  50.21 
 
 
263 aa  244  9e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  54.39 
 
 
258 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  51.29 
 
 
246 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  48.88 
 
 
303 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  49.03 
 
 
306 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  51.65 
 
 
264 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1831  ABC transporter related  48.47 
 
 
270 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747209  normal  0.153605 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2356  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  48.47 
 
 
270 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659325  normal  0.0382396 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  48.64 
 
 
304 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  48.33 
 
 
252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  51.97 
 
 
258 aa  243  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  48.28 
 
 
308 aa  243  3e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  48.51 
 
 
303 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  51.08 
 
 
287 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3080  ABC transporter related  50.2 
 
 
290 aa  242  5e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.178187  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  49.38 
 
 
255 aa  242  5e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1187  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  47.99 
 
 
260 aa  241  7e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0360138  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  48.51 
 
 
303 aa  241  7e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  50.62 
 
 
304 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2121  ABC transporter-related protein  46.42 
 
 
270 aa  241  7.999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515525  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  48.26 
 
 
259 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  48.65 
 
 
264 aa  241  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  49.42 
 
 
261 aa  240  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1530  ABC transporter related  44.93 
 
 
285 aa  240  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  47.58 
 
 
261 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  46.79 
 
 
307 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  46.74 
 
 
278 aa  239  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  52.38 
 
 
273 aa  239  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  46.21 
 
 
311 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  45.08 
 
 
267 aa  239  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  51.93 
 
 
271 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  53.51 
 
 
271 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  50.21 
 
 
256 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0147  ABC transporter related  46.21 
 
 
273 aa  239  4e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  51.95 
 
 
271 aa  238  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  48.65 
 
 
257 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2104  ABC transporter related  46.97 
 
 
282 aa  238  9e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0748494  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5730  ABC transporter related  50.63 
 
 
259 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  50 
 
 
330 aa  238  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  47.37 
 
 
256 aa  238  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5351  ABC transporter related  50.63 
 
 
262 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5440  ABC transporter related  50.63 
 
 
262 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.556345 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  47.93 
 
 
257 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0956  ABC transporter related  49.62 
 
 
274 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279168  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  48.71 
 
 
261 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2333  ABC transporter related protein  49.8 
 
 
260 aa  235  6e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  46.96 
 
 
259 aa  235  7e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  45.16 
 
 
259 aa  235  8e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  45.31 
 
 
258 aa  234  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  52.45 
 
 
281 aa  234  9e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  47.23 
 
 
311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  48.5 
 
 
291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0285  ABC transporter related protein  48.06 
 
 
267 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120651  hitchhiker  0.0000760001 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  46.67 
 
 
263 aa  233  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>