More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2997 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2709  aspartate aminotransferase  92.59 
 
 
405 aa  735    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0229127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2997  aspartate aminotransferase  100 
 
 
409 aa  822    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17330  aspartate aminotransferase  74.63 
 
 
402 aa  612  9.999999999999999e-175  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1066  aminotransferase, class I and II  72.35 
 
 
401 aa  574  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824593 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3164  aspartate aminotransferase  71.75 
 
 
460 aa  574  1.0000000000000001e-162  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.808038  normal  0.139624 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  69.08 
 
 
405 aa  567  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0907  aspartate aminotransferase  73.76 
 
 
415 aa  566  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.149386 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2679  aminotransferase class I and II  70.72 
 
 
411 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  69 
 
 
406 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0535  aminotransferase class I and II  70.62 
 
 
401 aa  556  1e-157  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169316  normal  0.0112885 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21060  aspartate aminotransferase  67.57 
 
 
410 aa  548  1e-155  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2661  aspartate aminotransferase  69.08 
 
 
402 aa  548  1e-155  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.975518  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6643  aspartate aminotransferase  67.81 
 
 
413 aa  528  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1011  aspartate aminotransferase  68 
 
 
412 aa  522  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0673  aspartate aminotransferase  67.83 
 
 
415 aa  523  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.185971  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4527  aminotransferase class I and II  67.25 
 
 
415 aa  519  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0566  aspartate aminotransferase  65.34 
 
 
402 aa  520  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0292  aspartate aminotransferase  64.94 
 
 
400 aa  520  1e-146  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03600  aspartate aminotransferase  64.11 
 
 
411 aa  514  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  63.25 
 
 
414 aa  515  1.0000000000000001e-145  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6064  aspartate aminotransferase  64.84 
 
 
402 aa  517  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1620  aspartate aminotransferase  60.05 
 
 
401 aa  481  1e-135  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.83573  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1220  putative aspartate transaminase  56.03 
 
 
412 aa  458  9.999999999999999e-129  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000208657 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1531  aminotransferase class I and II  50.12 
 
 
398 aa  380  1e-104  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.543061  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  43.69 
 
 
395 aa  364  1e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  44.75 
 
 
398 aa  354  2e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  47.21 
 
 
401 aa  354  2e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  45.36 
 
 
389 aa  353  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  45.98 
 
 
392 aa  352  8e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  46.1 
 
 
396 aa  351  2e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  45.34 
 
 
397 aa  347  2e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  46.38 
 
 
397 aa  345  8e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  44.86 
 
 
396 aa  345  8.999999999999999e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  45.09 
 
 
393 aa  344  2e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  43.36 
 
 
397 aa  342  5e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2189  aminotransferase, class I and II  44.92 
 
 
397 aa  343  5e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0726019  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  45.14 
 
 
400 aa  342  7e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  43.32 
 
 
395 aa  342  1e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  44.84 
 
 
400 aa  340  2e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1844  L-aspartate aminotransferase  40.75 
 
 
399 aa  341  2e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716649  normal  0.149603 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  44.22 
 
 
399 aa  339  7e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  42.21 
 
 
387 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0763  aspartate aminotransferase  45.14 
 
 
400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2422  aspartate aminotransferase  45.14 
 
 
400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352097  normal  0.171699 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  44.58 
 
 
390 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  41.1 
 
 
395 aa  336  5e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  43.04 
 
 
398 aa  334  2e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  44.89 
 
 
404 aa  334  2e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  43.83 
 
 
395 aa  332  5e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  43.83 
 
 
395 aa  332  5e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  43.83 
 
 
395 aa  332  5e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  43.83 
 
 
395 aa  332  5e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  43.83 
 
 
395 aa  332  5e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0135  aminotransferase class I and II  44.47 
 
 
407 aa  332  8e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.062979  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  43.58 
 
 
400 aa  332  9e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  43.07 
 
 
395 aa  331  1e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  43.07 
 
 
395 aa  330  2e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  41.29 
 
 
394 aa  331  2e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1569  aminotransferase  43.77 
 
 
398 aa  330  3e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  43.58 
 
 
396 aa  330  3e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  42.72 
 
 
399 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  43.07 
 
 
395 aa  329  6e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  43.07 
 
 
395 aa  329  6e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  42.32 
 
 
388 aa  327  2.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  44.78 
 
 
400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1360  aminotransferase, class I and II  41.96 
 
 
397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  42.82 
 
 
395 aa  327  3e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  39.55 
 
 
390 aa  327  3e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1440  aspartate aminotransferase, putative  43.4 
 
 
399 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1297  aspartate aminotransferase  43.92 
 
 
400 aa  325  9e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3084  aminotransferase, class I and II  43.39 
 
 
402 aa  325  9e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.373251  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3925  aspartate aminotransferase  43.18 
 
 
400 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0454577  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2058  aminotransferase, class I and II  42.47 
 
 
404 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07871  aminotransferase class-I  40.81 
 
 
393 aa  324  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.404062  hitchhiker  0.00724094 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  40.36 
 
 
398 aa  324  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3439  aminotransferase  43.14 
 
 
402 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1032  aminotransferase, class I and II  43.11 
 
 
394 aa  323  3e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.107898  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4809  aspartate aminotransferase  43.61 
 
 
400 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  40.85 
 
 
395 aa  322  6e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1187  aminotransferase class I and II  44.02 
 
 
402 aa  321  9.999999999999999e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3150  aspartate aminotransferase  42.43 
 
 
400 aa  322  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  41.65 
 
 
400 aa  322  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  42.11 
 
 
392 aa  320  1.9999999999999998e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1103  aspartate aminotransferase  43.18 
 
 
400 aa  320  3e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2987  aminotransferase class I and II  42.68 
 
 
393 aa  320  3e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  42.47 
 
 
400 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3551  aminotransferase  44.61 
 
 
400 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.547606 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0165  aminotransferase, class I and II  43.64 
 
 
390 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1193  aminotransferase class I and II  42.64 
 
 
402 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0161082  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2654  aspartate aminotransferase  43.72 
 
 
400 aa  319  7e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.24242  decreased coverage  0.00639864 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2736  aspartate aminotransferase  41.69 
 
 
400 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0888724  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0762  aspartate aminotransferase  43.07 
 
 
400 aa  318  2e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  43.69 
 
 
400 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4122  aspartate aminotransferase  43.18 
 
 
401 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2980  aspartate aminotransferase  43.18 
 
 
400 aa  317  3e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.181934  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1128  aminotransferase class I and II  41.5 
 
 
397 aa  317  4e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.472609  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3596  L-aspartate aminotransferase  40.81 
 
 
390 aa  316  4e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1135  aminotransferase  44.08 
 
 
400 aa  316  4e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.309528  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2245  aminotransferase class I and II  42.38 
 
 
397 aa  315  6e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.154581  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0881  aminotransferase, class I and II  42.36 
 
 
402 aa  315  7e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>