57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2888 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2598  hypothetical protein  83.01 
 
 
411 aa  687    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000882332 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2888  hypothetical protein  100 
 
 
414 aa  837    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00389281  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3060  hypothetical protein  51.4 
 
 
400 aa  366  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29160  hypothetical protein  49.53 
 
 
438 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2590  hypothetical protein  49.63 
 
 
400 aa  351  1e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08510  hypothetical protein  48.16 
 
 
422 aa  350  4e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0734  hypothetical protein  48.66 
 
 
396 aa  342  7e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.386022  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16610  hypothetical protein  49.17 
 
 
443 aa  341  1e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0682  hypothetical protein  48.48 
 
 
418 aa  335  1e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601703  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0634  hypothetical protein  43.2 
 
 
412 aa  312  6.999999999999999e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3648  hypothetical protein  43.72 
 
 
388 aa  262  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4259  hypothetical protein  47.51 
 
 
415 aa  246  6e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2600  hypothetical protein  44.04 
 
 
423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.590151  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4027  hypothetical protein  39.57 
 
 
428 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1152  hypothetical protein  40.64 
 
 
388 aa  232  8.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4454  hypothetical protein  42.09 
 
 
407 aa  219  5e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0077  hypothetical protein  37.62 
 
 
392 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1085  hypothetical protein  44.17 
 
 
403 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.643719  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3843  hypothetical protein  43.09 
 
 
428 aa  210  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07540  hypothetical protein  37.18 
 
 
474 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.559975 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4233  hypothetical protein  43.18 
 
 
411 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1663  hypothetical protein  35.82 
 
 
396 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0971  hypothetical protein  32.97 
 
 
385 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6063  hypothetical protein  34.34 
 
 
383 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5789  hypothetical protein  33.82 
 
 
487 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712723  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2934  hypothetical protein  33.42 
 
 
382 aa  150  4e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0802  hypothetical protein  33.33 
 
 
477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4268  hypothetical protein  35.57 
 
 
372 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28440  hypothetical protein  35.88 
 
 
399 aa  135  9e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3266  hypothetical protein  31.07 
 
 
399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3087  hypothetical protein  32.36 
 
 
416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000449393  hitchhiker  0.0000364534 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1860  hypothetical protein  33.72 
 
 
412 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1907  hypothetical protein  33.72 
 
 
412 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1841  hypothetical protein  33.72 
 
 
369 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2091  hypothetical protein  33.05 
 
 
381 aa  127  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2351  hypothetical protein  28.77 
 
 
407 aa  120  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175675  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13053  hypothetical protein  30.89 
 
 
358 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2452  hypothetical protein  25.81 
 
 
402 aa  91.3  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.280378  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2587  hypothetical protein  28.22 
 
 
444 aa  89  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2822  hypothetical protein  27.79 
 
 
420 aa  84  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0021  hypothetical protein  24.87 
 
 
399 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0629415  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2182  hypothetical protein  27.67 
 
 
401 aa  80.9  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2423  hypothetical protein  23.5 
 
 
419 aa  73.2  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1098  hypothetical protein  27.2 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.697484 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2063  hypothetical protein  24.87 
 
 
417 aa  67  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1249  Methyltransferase type 11  20.83 
 
 
385 aa  65.5  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.419487  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1360  hypothetical protein  23.49 
 
 
375 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2446  methyltransferase  21.31 
 
 
357 aa  62.4  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.949706  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13168  hypothetical protein  21.1 
 
 
396 aa  62.8  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1929  hypothetical protein  23.86 
 
 
383 aa  59.7  0.00000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0557173  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0324  SAM-dependent methyltransferase  25.47 
 
 
431 aa  58.2  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.71025  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2262  hypothetical protein  25.89 
 
 
396 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237582  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4993  hypothetical protein  25 
 
 
408 aa  57.4  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.513988 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4599  hypothetical protein  21.86 
 
 
393 aa  57.8  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2926  hypothetical protein  24.36 
 
 
394 aa  54.7  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.812191  hitchhiker  0.000139992 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3389  hypothetical protein  23.92 
 
 
399 aa  53.9  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2918  Methyltransferase type 11  32.56 
 
 
264 aa  53.1  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>