More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2844 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2844  pirin domain-containing protein  100 
 
 
363 aa  717    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.923717  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2558  Pirin domain protein  71.11 
 
 
336 aa  482  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000413123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1645  Pirin domain protein  48.08 
 
 
324 aa  320  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3476  Pirin domain protein  50.41 
 
 
319 aa  292  6e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.944311 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3190  Pirin domain protein  47.4 
 
 
351 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2245  hypothetical protein  46.41 
 
 
332 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169099  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35540  Pirin-related protein  42.58 
 
 
381 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0508  Pirin domain protein  45.95 
 
 
329 aa  261  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0100  Pirin domain protein  45.28 
 
 
335 aa  255  9e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0663  pirin domain-containing protein  44.24 
 
 
351 aa  249  5e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3726  Pirin domain protein  40.86 
 
 
336 aa  245  8e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5391  pirin domain-containing protein  45.35 
 
 
317 aa  242  9e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5681  pirin domain-containing protein  45.35 
 
 
317 aa  242  9e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5302  Pirin-like protein  45.35 
 
 
317 aa  242  9e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.178895  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4144  Pirin domain protein  41.87 
 
 
329 aa  239  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.173069  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2016  Pirin domain protein  42.4 
 
 
343 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.656131  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3633  Pirin domain protein  39.79 
 
 
330 aa  231  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0490  Pirin domain protein  41.62 
 
 
322 aa  229  5e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0687764  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2745  Pirin domain-containing protein  40.82 
 
 
319 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.211686  normal  0.964257 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0062  pirin domain-containing protein  38.59 
 
 
321 aa  223  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0919  pirin domain-containing protein  37.43 
 
 
338 aa  222  9e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200809  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0788  pirin domain-containing protein  39.13 
 
 
321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02280  Pirin-related protein  39.52 
 
 
335 aa  220  3.9999999999999997e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4173  hypothetical protein  37.84 
 
 
332 aa  209  8e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1778  Pirin-like protein  39.05 
 
 
313 aa  206  5e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48730  hypothetical protein  37.54 
 
 
315 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159869 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0050  Pirin-like protein  37.8 
 
 
301 aa  204  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2835  pirin domain-containing protein  38.13 
 
 
313 aa  192  7e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4301  pirin domain-containing protein  35.62 
 
 
307 aa  192  9e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.411445  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23410  Pirin-related protein  37.87 
 
 
348 aa  192  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0699691  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0053  pirin domain-containing protein  35 
 
 
307 aa  189  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030122 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0061  pirin domain-containing protein  34.38 
 
 
308 aa  190  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000222873 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3147  Pirin domain protein  37.34 
 
 
301 aa  189  5.999999999999999e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0057  Pirin domain protein  35 
 
 
307 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0050  pirin domain-containing protein  34.94 
 
 
307 aa  189  7e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0017274  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0058  pirin domain-containing protein  35 
 
 
307 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.00000580792 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0055  pirin domain-containing protein  35.53 
 
 
307 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000241022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0053  pirin domain-containing protein  34.06 
 
 
307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3541  pirin-like protein  32.59 
 
 
297 aa  181  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0649  Pirin-like protein  37.86 
 
 
294 aa  171  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4855  pirin domain-containing protein  38.08 
 
 
312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0149  Pirin-like  37.41 
 
 
305 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0561  Pirin domain protein  37.77 
 
 
305 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0128  Pirin domain protein  37.72 
 
 
312 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.266704 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0185  pirin domain-containing protein  37.72 
 
 
312 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0703  Pirin-like protein  37.41 
 
 
305 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1965  pirin domain-containing protein  38.35 
 
 
309 aa  160  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0444426  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2913  Pirin-like  34.77 
 
 
296 aa  158  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0009  Pirin-like  36.69 
 
 
306 aa  155  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00543202  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0019  putative Pirin family protein  35.25 
 
 
305 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0608  Pirin domain protein  32.25 
 
 
307 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.228088 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0566  Pirin domain protein  32.25 
 
 
307 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.660641  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0435  pirin-related protein  35.11 
 
 
290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0346  Pirin-like  34.89 
 
 
305 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2304  pirin domain-containing protein  30.89 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000453876  normal  0.0236921 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2983  Pirin domain protein  34.15 
 
 
287 aa  147  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.373808  normal  0.0595027 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0219  pirin  34.89 
 
 
306 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2613  pirin domain-containing protein  36.3 
 
 
293 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2143  pirin domain-containing protein  35.25 
 
 
305 aa  146  7.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0273  Pirin-like protein  33.45 
 
 
291 aa  145  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.355193 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3573  Pirin domain protein  37.15 
 
 
307 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0364  pirin domain-containing protein  33.12 
 
 
318 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2372  pirin domain-containing protein  32.57 
 
 
311 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178763  normal  0.995053 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2897  Pirin-like  34.29 
 
 
294 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04763  pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  35.09 
 
 
296 aa  144  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1805  Pirin domain protein  34.71 
 
 
296 aa  144  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.5163  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0734  Pirin-like  33.81 
 
 
306 aa  143  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0326  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  35.11 
 
 
291 aa  142  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0517  pirin domain-containing protein  34.16 
 
 
293 aa  142  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.858026 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1954  Pirin-like  35.59 
 
 
293 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0828005  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2565  pirin domain-containing protein  35.59 
 
 
293 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0904  pirin domain-containing protein  35.23 
 
 
293 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2484  pirin domain-containing protein  35.59 
 
 
293 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0887266 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3641  Pirin domain protein  36.68 
 
 
307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1666  pirin-related protein  30.94 
 
 
290 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0486523  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2089  Pirin domain protein  33.66 
 
 
304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0362  hypothetical protein  35.23 
 
 
293 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0654105  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0662  hypothetical protein  35.23 
 
 
293 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.276579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2498  hypothetical protein  35.23 
 
 
293 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.149095  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0111  hypothetical protein  35.23 
 
 
293 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.335192  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0818  pirin domain-containing protein  35.03 
 
 
296 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0493  pirin domain-containing protein  31.79 
 
 
307 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0286  pirin-related protein  31.79 
 
 
306 aa  140  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3218  Pirin domain protein  33.45 
 
 
291 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0720  hypothetical protein  35.46 
 
 
340 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00526543  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3489  Pirin-like  36.9 
 
 
307 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0907  pirin domain-containing protein  35.23 
 
 
293 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2092  Pirin domain protein  32.88 
 
 
311 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0640  pirin-related protein  31.79 
 
 
291 aa  138  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.524638  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2589  pirin domain-containing protein  35.23 
 
 
293 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437288  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0377  putative pirin-like protein  34.97 
 
 
289 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4570  pirin domain-containing protein  34.67 
 
 
296 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203406  normal  0.316672 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0731  pirin domain-containing protein  35.46 
 
 
293 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3696  Pirin domain protein  29.9 
 
 
300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.01108  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4923  Pirin domain protein  30.9 
 
 
310 aa  137  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.695284  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0744  hypothetical protein  33.1 
 
 
291 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.738482  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1367  pirin domain-containing protein  34.02 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0431465 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1300  pirin domain-containing protein  34.02 
 
 
294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.937895  normal  0.0576323 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5228  pirin domain-containing protein  33.56 
 
 
298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739076  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0546  pirin domain-containing protein  31.41 
 
 
306 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.266378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>