More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2809 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  408  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  63.59 
 
 		 202 aa  244  8e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 		 367 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  38.83 
 
 		 197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 196 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 215 aa  99  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 199 aa  98.2  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 199 aa  97.8  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  33.49 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  35.27 
 
 		 205 aa  91.3  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  40.83 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5475  transcriptional regulator, TetR family  43.59 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  35.75 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4314  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.668708  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19310  hypothetical protein  35.51 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  32.62 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  34.05 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  25.51 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  25.51 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  31.31 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5183  putative transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  36.21 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6767  transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13760  transcriptional regulator, tetR family  41.18 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.484561  normal  0.0851511 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1671  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.290262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  31.37 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  36.8 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06181  transcriptional regulator BetI  26.11 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0681  transcriptional regulator, TetR family  32.21 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30040  hypothetical protein  45.31 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000857921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2260  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0104994  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1139  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 220 aa  52  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  27.69 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0254  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1647  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5113  transcriptional regulator BetI  29.76 
 
 		 218 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0491395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4935  transcriptional regulator BetI  29.76 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  48.1  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4321  regulatory protein TetR  34.71 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0684654  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  23.61 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 220 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000366  HTH-type transcriptional regulator BetI  24.26 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  29.55 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0069  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  28.74 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3867  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53155  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  29.55 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0868398 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  37.29 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0403  transcriptional regulator BetI  28.57 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  27.48 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  27.48 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  27.48 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 287 aa  46.6  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5242  transcriptional regulator BetI  27.38 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 291 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>