34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2713 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2713  integral membrane protein  100 
 
 		 479 aa  913    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000899465  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2444  integral membrane protein  50.59 
 
 		 336 aa  290  4e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162268 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3746  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, membrane domain protein  30.42 
 
 		 514 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2515  hypothetical protein  34.44 
 
 		 422 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.618475  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09330  hypothetical protein  31.79 
 
 		 470 aa  134  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.828003  normal  0.646857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1411  hypothetical protein  31.58 
 
 		 428 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  decreased coverage  0.00790445 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1442  hypothetical protein  29.64 
 
 		 439 aa  124  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0729346  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5843  putative integral membrane protein  31.31 
 
 		 394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00448187  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4857  putative transmembrane protein  32.59 
 
 		 398 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.983726  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4946  putative transmembrane protein  32.59 
 
 		 398 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5225  putative transmembrane protein  32.59 
 
 		 398 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1829  hypothetical protein  27.27 
 
 		 414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2333  hypothetical protein  33.12 
 
 		 392 aa  106  8e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0394945  decreased coverage  0.000000641267 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7595  integral membrane protein  31.07 
 
 		 377 aa  106  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.37201  normal  0.0302088 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0762  putative integral membrane protein  32.3 
 
 		 335 aa  106  9e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2497  hypothetical protein  31.5 
 
 		 430 aa  104  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.992932  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06850  hypothetical protein  30.49 
 
 		 294 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.543826  normal  0.0569801 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3816  integral membrane protein  34.17 
 
 		 331 aa  101  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115314  hitchhiker  0.00496397 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5452  putative transmembrane protein  30.25 
 
 		 384 aa  99  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.982552  normal  0.461593 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0769  hypothetical protein  31.33 
 
 		 390 aa  94.4  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.165359 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13720  transmembrane protein  29.79 
 
 		 451 aa  86.7  9e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.31543 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1239  integral membrane protein  28.08 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3907  hypothetical protein  30.32 
 
 		 362 aa  79  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.837728  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4818  hypothetical protein  29.11 
 
 		 375 aa  76.6  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1340  putative transmembrane protein  28.53 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20660  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase-like protein  29.68 
 
 		 374 aa  65.9  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0488743  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4250  hypothetical protein  28.3 
 
 		 335 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2090  hypothetical protein  36 
 
 		 218 aa  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09278  hypothetical protein  26.03 
 
 		 296 aa  50.1  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.237107  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  39.22 
 
 		 687 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1349  hypothetical protein  33.66 
 
 		 248 aa  47  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0270376 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4810  hypothetical protein  30.97 
 
 		 284 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000731243  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0234  hypothetical protein  30.37 
 
 		 294 aa  44.3  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5862  hypothetical protein  38.79 
 
 		 438 aa  43.5  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310924  normal  0.906322 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>