More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2711 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2711  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
601 aa  1215    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0394383  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2442  histidine kinase  82.56 
 
 
597 aa  976    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000162177 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14760  signal transduction histidine kinase  52.66 
 
 
607 aa  463  1e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.476011  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.49 
 
 
539 aa  455  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259668  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1764  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.59 
 
 
575 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09350  signal transduction histidine kinase  44.03 
 
 
574 aa  426  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.165664  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1826  histidine kinase  45.96 
 
 
558 aa  418  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2513  histidine kinase  43.89 
 
 
586 aa  419  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332673  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2331  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.72 
 
 
589 aa  417  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000623788  decreased coverage  0.00000124143 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2495  sensor histidine kinase  45 
 
 
579 aa  410  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1434  ATPase domain-containing protein  43.83 
 
 
544 aa  410  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7593  histidine kinase  43.3 
 
 
608 aa  406  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1241  histidine kinase  49.6 
 
 
587 aa  405  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560474  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4042  histidine kinase  45.06 
 
 
594 aa  405  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554212  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.34 
 
 
581 aa  404  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335096  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0771  histidine kinase  44.23 
 
 
594 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1413  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.86 
 
 
579 aa  395  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119595  normal  0.0381206 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1850  histidine kinase  42.45 
 
 
554 aa  392  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 
605 aa  395  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404155  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.62 
 
 
552 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.470241 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0968  ATPase domain-containing protein  42.81 
 
 
557 aa  381  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1753  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.05 
 
 
547 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408385  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0905  histidine kinase  43.14 
 
 
557 aa  373  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474957  normal  0.117481 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.38 
 
 
555 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.801088  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3636  ATP-binding region ATPase domain protein  40.9 
 
 
557 aa  375  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351374  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20640  signal transduction histidine kinase  47.2 
 
 
572 aa  373  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0698794  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.38 
 
 
555 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30930  signal transduction histidine kinase  42.75 
 
 
577 aa  375  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4711  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.48 
 
 
551 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848915 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13274  two component system sensor transduction histidine kinase mtrB  41.65 
 
 
567 aa  369  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.620022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6309  histidine kinase  43.6 
 
 
801 aa  355  8.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08600  signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 
538 aa  347  3e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.890839  normal  0.98586 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4248  histidine kinase  42.24 
 
 
648 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.24223  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0043  signal transduction histidine kinase  36.83 
 
 
565 aa  313  5.999999999999999e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0980006  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.03 
 
 
554 aa  303  6.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.696871  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0792  histidine kinase  37.01 
 
 
505 aa  208  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0259  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.13 
 
 
460 aa  185  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3090  histidine kinase  30.95 
 
 
482 aa  184  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8521  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.05 
 
 
468 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  30.29 
 
 
518 aa  175  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 
487 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 
364 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13580  signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 
613 aa  164  6e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.111156 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 
452 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 
524 aa  161  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  32.2 
 
 
364 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  32.2 
 
 
364 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  31.09 
 
 
463 aa  160  7e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 
473 aa  160  8e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 
467 aa  160  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.113829  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  32.17 
 
 
449 aa  159  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
483 aa  158  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 
496 aa  158  3e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 
457 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2569  ATPase domain-containing protein  32.98 
 
 
450 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.704872  normal  0.286023 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 
639 aa  156  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 
639 aa  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 
425 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3275  histidine kinase  33.81 
 
 
487 aa  153  8.999999999999999e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1945  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 
371 aa  153  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2094  histidine kinase  35.22 
 
 
477 aa  153  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854924  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  30 
 
 
458 aa  152  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  31.48 
 
 
486 aa  152  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  28.44 
 
 
508 aa  152  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  28.09 
 
 
466 aa  151  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  28.09 
 
 
466 aa  151  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 
466 aa  151  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  28.09 
 
 
466 aa  151  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
483 aa  151  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  28.09 
 
 
466 aa  151  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  27.78 
 
 
466 aa  151  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 
471 aa  151  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  30.82 
 
 
458 aa  150  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 
639 aa  150  7e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  30.82 
 
 
458 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  30.49 
 
 
458 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  31.63 
 
 
356 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  30.49 
 
 
458 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  27.47 
 
 
466 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  30.82 
 
 
458 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 
389 aa  149  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
474 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 
473 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  27.47 
 
 
466 aa  148  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 
459 aa  148  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.55 
 
 
471 aa  148  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 
459 aa  147  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  30.18 
 
 
496 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  33.33 
 
 
566 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 
359 aa  147  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  29.87 
 
 
458 aa  147  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  29.57 
 
 
501 aa  147  5e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 
493 aa  147  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  28.09 
 
 
466 aa  147  8.000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  30.7 
 
 
490 aa  146  8.000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  30.49 
 
 
458 aa  147  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2057  sensor histidine kinase  28.7 
 
 
452 aa  146  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
484 aa  146  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  31.23 
 
 
503 aa  146  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2213  sensor histidine kinase  28.7 
 
 
452 aa  146  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>