86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2677 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2677  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
344 aa  699    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0305483  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2418  glycosyl transferase family 2  45.48 
 
 
354 aa  284  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.319221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0055  glycosyl transferase family 2  42.59 
 
 
1171 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180545  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.48 
 
 
321 aa  92  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3357  glycosyl transferase family protein  29.68 
 
 
342 aa  89.7  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.356276 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4928  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
234 aa  86.7  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2855  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 
306 aa  84  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.328226  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3795  putative glycosyl transferase  33.33 
 
 
332 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2992  glycosyltransferase-like protein  29.82 
 
 
332 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1875  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.68 
 
 
241 aa  80.1  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3096  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 
350 aa  80.1  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1436  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  29.2 
 
 
313 aa  79.3  0.00000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
348 aa  79.3  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2174  glycosyl transferase family protein  31.42 
 
 
308 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203622  decreased coverage  0.00000290408 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0768  glycosyl transferase family 2  31.51 
 
 
334 aa  77.4  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2405  glycosyl transferase family 2  25.88 
 
 
298 aa  77  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0207  glycosyltransferase  29.38 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0393294  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  24.15 
 
 
303 aa  70.1  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2176  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0528602  hitchhiker  0.0000162414 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1577  glycosyl transferase family 2  26.91 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1509  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.36 
 
 
331 aa  67  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2328  glycosyl transferase group 2 family protein  27.71 
 
 
326 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.775783  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.36 
 
 
313 aa  65.5  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000268918  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3901  glycosyl transferase family 2  27.05 
 
 
313 aa  65.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2680  glycosyl transferase family protein  27.05 
 
 
256 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.043994  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2834  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
349 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2580  glycosyl transferase family 2  25.78 
 
 
341 aa  63.2  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.392013 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2417  glycosyl transferase family 2  29.47 
 
 
247 aa  63.2  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.385127 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1430  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
338 aa  63.2  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.339779  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4473  glycosyl transferase family 2  26.45 
 
 
309 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3485  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 
310 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0232814 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4147  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
330 aa  58.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.43533 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29980  Glycosyl transferase, family 2 protein  25.47 
 
 
325 aa  57.4  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.86 
 
 
266 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  28.86 
 
 
266 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.86 
 
 
266 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.5 
 
 
266 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.79 
 
 
266 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3027  putative glycosyltransferase  26.74 
 
 
237 aa  55.8  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3263  glycosyl transferase family 2  25.33 
 
 
242 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3922  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
308 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4080  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
312 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.106116 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3842  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
312 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.051073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.19 
 
 
266 aa  54.7  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3866  glycosyl transferase family 2  26.24 
 
 
325 aa  53.9  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1026  hypothetical protein  27.93 
 
 
339 aa  53.9  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215824  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0237  putative glycosyl transferase  26.29 
 
 
334 aa  53.5  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000312549  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3102  glycosyl transferase family protein  24.28 
 
 
312 aa  53.1  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0611107  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1218  glycosyl transferase family protein  27.86 
 
 
301 aa  53.1  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.332146  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1067  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.6 
 
 
337 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.7 
 
 
321 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2566  glycosyl transferase family 2  28.27 
 
 
252 aa  50.4  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2879  glycosyl transferase family protein  26.48 
 
 
298 aa  49.3  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  27.81 
 
 
341 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  28.65 
 
 
344 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  32.56 
 
 
324 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
397 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  35.78 
 
 
357 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1414  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.4 
 
 
308 aa  47.4  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
1015 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0417  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.88 
 
 
302 aa  47.4  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.163858  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4052  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 
329 aa  47  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45239  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  32.95 
 
 
310 aa  47  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1478  glycosyl transferase  23.16 
 
 
325 aa  47  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00283905  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  24.57 
 
 
1250 aa  46.6  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0383  glycosyl transferase family 2  27.37 
 
 
329 aa  44.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 
351 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1334  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 
300 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0703476 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2653  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
332 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.106292  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3932  glycosyl transferase family protein  27.12 
 
 
306 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0299205  normal  0.191145 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  27.45 
 
 
347 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2652  glycosyl transferase family protein  35.23 
 
 
372 aa  44.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.689444  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  22.82 
 
 
336 aa  44.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1078  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.05 
 
 
309 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.952222  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3039  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 
308 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1570  glycosyl transferase family protein  35.8 
 
 
252 aa  43.9  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1499  glycosyltransferase-like protein  22.69 
 
 
350 aa  43.9  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.311462  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2531  glycosyl transferase family protein  19.47 
 
 
310 aa  43.5  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 
354 aa  43.5  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  34.09 
 
 
264 aa  43.5  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0488  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 
609 aa  43.5  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26710  glycosyl transferase  25.45 
 
 
668 aa  43.5  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  25.17 
 
 
347 aa  43.1  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.8 
 
 
295 aa  43.1  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1236  glycosyl transferase  30.77 
 
 
302 aa  42.7  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.215388 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>