122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2601 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2601  hypothetical protein  100 
 
 		 877 aa  1747    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00218331  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2334  protein of unknown function DUF470  66 
 
 		 844 aa  1023    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4377  hypothetical protein  35.98 
 
 		 905 aa  421  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.947401  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3394  protein of unknown function DUF470  37.33 
 
 		 850 aa  403  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4568  protein of unknown function DUF470  32.39 
 
 		 839 aa  382  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1364  hypothetical protein  32.85 
 
 		 857 aa  331  5.0000000000000004e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1037  hypothetical protein  28.89 
 
 		 852 aa  314  3.9999999999999997e-84  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3572  protein of unknown function DUF470  43.33 
 
 		 346 aa  266  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4813  protein of unknown function DUF470  39.4 
 
 		 723 aa  259  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0824  hypothetical protein  25.97 
 
 		 568 aa  124  8e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.896168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3199  hypothetical protein  26.42 
 
 		 556 aa  120  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1005  protein of unknown function DUF470  26.48 
 
 		 556 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0976  protein of unknown function DUF470  26.48 
 
 		 556 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  29.2 
 
 		 1118 aa  108  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  29.06 
 
 		 1113 aa  102  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1456  hypothetical protein  21.23 
 
 		 851 aa  95.9  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.291506  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  26.8 
 
 		 850 aa  95.5  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1258  hypothetical protein  20.89 
 
 		 851 aa  92.4  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0075337  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  26.57 
 
 		 896 aa  92.8  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2319  lysyl-tRNA synthetase  26.61 
 
 		 1132 aa  91.7  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7583  protein of unknown function DUF470  28.51 
 
 		 597 aa  90.1  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.389483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0206  hypothetical protein  28.76 
 
 		 599 aa  89.7  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.914985  normal  0.140787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1489  protein of unknown function DUF470  23.85 
 
 		 861 aa  86.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1520  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  23.85 
 
 		 859 aa  85.9  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3825  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  23.85 
 
 		 859 aa  85.5  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000241179 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  23.43 
 
 		 861 aa  84.3  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  23.43 
 
 		 861 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  23.43 
 
 		 861 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  23.43 
 
 		 861 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  23.43 
 
 		 861 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 1100 aa  83.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  23.43 
 
 		 861 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  23.43 
 
 		 861 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000388659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1202  hypothetical protein  24.93 
 
 		 880 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04799  hypothetical protein  23.96 
 
 		 883 aa  82.4  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0255937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6803  protein of unknown function DUF470  23.97 
 
 		 592 aa  82.8  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  25.33 
 
 		 1098 aa  82  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1231  hypothetical protein  24.93 
 
 		 880 aa  82  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0755535  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2131  hypothetical protein  26.09 
 
 		 847 aa  81.6  0.00000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  23.01 
 
 		 861 aa  81.3  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2476  protein of unknown function DUF470  26.15 
 
 		 578 aa  80.5  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  21.35 
 
 		 858 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4216  hypothetical protein  25.38 
 
 		 880 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  26.97 
 
 		 1147 aa  80.1  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4555  hypothetical protein  24.47 
 
 		 346 aa  79.7  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  23.65 
 
 		 866 aa  78.6  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  25.09 
 
 		 1094 aa  78.6  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1219  hypothetical protein  22.32 
 
 		 917 aa  78.2  0.0000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.316039  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4013  hypothetical protein  25.14 
 
 		 880 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  20.34 
 
 		 862 aa  77.4  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  26.61 
 
 		 1138 aa  77  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  23.17 
 
 		 854 aa  76.3  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  25.61 
 
 		 1172 aa  75.9  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  22.7 
 
 		 871 aa  75.1  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  22.7 
 
 		 871 aa  75.1  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3993  protein of unknown function DUF470  22.37 
 
 		 877 aa  75.1  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18850  hypothetical protein  26.15 
 
 		 876 aa  75.1  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11879  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  22.37 
 
 		 877 aa  75.1  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.628735 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3991  hypothetical protein  25.29 
 
 		 880 aa  74.7  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1194  hypothetical protein  25.36 
 
 		 879 aa  74.3  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685135  normal  0.0802635 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2930  protein of unknown function DUF470  24.44 
 
 		 854 aa  74.3  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.58792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52350  hypothetical protein  25.56 
 
 		 881 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.890769 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0379  lysyl-tRNA synthetase (class II)  19.94 
 
 		 844 aa  73.2  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.646345  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  24.07 
 
 		 1120 aa  73.2  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1396  hypothetical protein  23.7 
 
 		 880 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4591  hypothetical protein  24.77 
 
 		 881 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  21.12 
 
 		 863 aa  71.6  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1066  protein of unknown function DUF470  24.14 
 
 		 590 aa  71.2  0.00000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0261019  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1351  hypothetical protein  25.07 
 
 		 864 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880074  normal  0.100606 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  20.13 
 
 		 863 aa  68.9  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1140  hypothetical protein  21.49 
 
 		 429 aa  69.3  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  24.5 
 
 		 1112 aa  68.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  24.5 
 
 		 1112 aa  68.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  23.58 
 
 		 864 aa  68.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  23.85 
 
 		 844 aa  68.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1693  protein of unknown function DUF470  23.85 
 
 		 844 aa  67  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153321  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  22.99 
 
 		 870 aa  67.4  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  24.19 
 
 		 1111 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  24.58 
 
 		 1101 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  21.83 
 
 		 867 aa  65.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  21.83 
 
 		 867 aa  65.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  20.83 
 
 		 850 aa  65.1  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0534  protein of unknown function DUF472  26.67 
 
 		 454 aa  65.5  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  21.97 
 
 		 851 aa  64.3  0.000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8424  protein of unknown function DUF470  25.63 
 
 		 701 aa  64.7  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3871  hypothetical protein  23.26 
 
 		 889 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5123  protein of unknown function DUF470  25.33 
 
 		 342 aa  63.9  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4498  hypothetical protein  23.26 
 
 		 889 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2725  hypothetical protein  23.3 
 
 		 855 aa  64.3  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5804  hypothetical protein  23.26 
 
 		 889 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  20.54 
 
 		 850 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000274946 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1522  hypothetical protein  21.03 
 
 		 861 aa  63.5  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2233  protein of unknown function DUF470  22.96 
 
 		 864 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  20.36 
 
 		 850 aa  62.4  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  25.4 
 
 		 872 aa  62.8  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1547  hypothetical protein  26.09 
 
 		 656 aa  62.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.736781  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  23.47 
 
 		 869 aa  61.6  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4150  hypothetical protein  23.26 
 
 		 864 aa  61.6  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155507  normal  0.123779 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2033  transmembrane protein, LpiA-like  22.66 
 
 		 850 aa  61.6  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358436  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2745  hypothetical protein  25.09 
 
 		 643 aa  61.2  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>