More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2594 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2594  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 339 aa  657    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.238157  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2327  thioredoxin domain protein  74.7 
 
 		 334 aa  464  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128937 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1333  Thioredoxin domain protein  44.44 
 
 		 311 aa  222  7e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1730  putative thioredoxin domain-containing protein  43.5 
 
 		 313 aa  219  7e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1092  Thioredoxin domain protein  45.17 
 
 		 310 aa  205  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.509026  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  43.37 
 
 		 337 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10300  thioredoxin domain-containing protein  43.24 
 
 		 313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2422  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.5 
 
 		 319 aa  194  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1282  Thioredoxin domain  43.54 
 
 		 319 aa  194  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00790933  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09500  thioredoxin domain-containing protein  39.37 
 
 		 346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.460116  normal  0.88242 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  38.27 
 
 		 297 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6079  thioredoxin domain protein  42.12 
 
 		 326 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  39.19 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19060  thioredoxin domain-containing protein  40 
 
 		 299 aa  157  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.595284  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1804  thioredoxin domain-containing protein  40.43 
 
 		 314 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08240  thioredoxin domain-containing protein  40.95 
 
 		 324 aa  150  4e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  43.48 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0139  hypothetical protein  31.69 
 
 		 340 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1954  Thioredoxin domain protein  36.76 
 
 		 313 aa  145  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1704  thioredoxin domain protein  34.89 
 
 		 310 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  34.34 
 
 		 299 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11356  thioredoxin  33.13 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3988  thioredoxin domain-containing protein  36.96 
 
 		 300 aa  136  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000709703 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3683  thioredoxin-related  39.42 
 
 		 329 aa  135  8e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3886  Thioredoxin domain protein  34.04 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54182  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3607  thioredoxin domain-containing protein  36.96 
 
 		 300 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2342  thioredoxin domain-containing protein  34.64 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.299917  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0921  thioredoxin domain-containing protein  34.78 
 
 		 301 aa  126  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.460441 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1117  thioredoxin-related protein  34.44 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3848  thioredoxin domain-containing protein  33.43 
 
 		 299 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00807359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3862  thioredoxin domain-containing protein  33.43 
 
 		 299 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3936  thioredoxin domain-containing protein  33.43 
 
 		 299 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4105  Thioredoxin domain protein  36.9 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2392  putative thioredoxin  39.13 
 
 		 309 aa  123  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1268  Thioredoxin domain protein  38.06 
 
 		 323 aa  119  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0364  putative thioredoxin  35.74 
 
 		 320 aa  119  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4303  thioredoxin domain-containing protein  32.34 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408854  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3098  thioredoxin  38.75 
 
 		 333 aa  112  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032408  hitchhiker  0.0000022841 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  31.07 
 
 		 281 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  29.64 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  29.17 
 
 		 310 aa  96.3  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  29.55 
 
 		 280 aa  96.3  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3161  thioredoxin domain-containing protein  26.39 
 
 		 289 aa  95.5  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.324735  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1269  putative thioredoxin  26.39 
 
 		 289 aa  95.5  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3023  putative thioredoxin  26.39 
 
 		 289 aa  95.5  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  30.14 
 
 		 280 aa  93.6  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2127  thioredoxin domain-containing protein  29.67 
 
 		 311 aa  93.2  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  26.96 
 
 		 324 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  27.82 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  26.96 
 
 		 324 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  27.42 
 
 		 306 aa  90.1  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  27.78 
 
 		 330 aa  89.7  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  31.72 
 
 		 280 aa  89.4  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  28.16 
 
 		 306 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1539  thioredoxin domain-containing protein  26.3 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  29.43 
 
 		 285 aa  89  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  27.48 
 
 		 302 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  28.62 
 
 		 293 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  26.64 
 
 		 334 aa  87.4  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3195  Thioredoxin domain protein  27.59 
 
 		 286 aa  87.8  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  28.16 
 
 		 338 aa  85.9  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  28.81 
 
 		 301 aa  85.9  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  27.08 
 
 		 305 aa  85.9  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1155  thioredoxin domain-containing protein  26.41 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155818  hitchhiker  0.00000315771 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  30.96 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  26.65 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0966  thioredoxin domain-containing protein  42.31 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0531  protein YbbN  27.93 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.735174  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0427  protein YbbN  27.93 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0571  protein YbbN  27.93 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0596  protein YbbN  27.93 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0541  protein YbbN  27.93 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1120  Thioredoxin domain protein  26.21 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  26.69 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  29.82 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  28.12 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  30.03 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00443  predicted thioredoxin domain-containing protein  27.34 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3118  Thioredoxin domain protein  27.34 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3124  thioredoxin domain-containing protein  27.34 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112242 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  28.09 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00448  hypothetical protein  27.34 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  27.42 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  27.93 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  27.33 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  28.12 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  27.05 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3007  Thioredoxin domain protein  27.99 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  27.13 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  28.93 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  27.93 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  28.27 
 
 		 317 aa  79  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1429  thioredoxin-related  26.57 
 
 		 287 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000020457  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2298  thioredoxin domain-containing protein  25.44 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  28.2 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  25.5 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0073  thioredoxin-related  28.97 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0246134 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  28.57 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0551  thioredoxin domain protein  25.33 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  27.87 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>