203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2573 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 1023 aa  1972    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  59.45 
 
 		 1025 aa  952    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  29.84 
 
 		 1018 aa  301  4e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  29.99 
 
 		 1018 aa  298  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  30.65 
 
 		 1018 aa  278  3e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  55.96 
 
 		 881 aa  229  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4360  putative ATP-dependent dsDNA exonuclease  40 
 
 		 986 aa  220  8.999999999999998e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288982  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  38.35 
 
 		 986 aa  217  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  37.03 
 
 		 989 aa  206  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  47.66 
 
 		 1291 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  59.78 
 
 		 995 aa  201  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  28.06 
 
 		 1029 aa  197  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2166  SMC domain-containing protein  50.51 
 
 		 1249 aa  194  8e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  27.88 
 
 		 1029 aa  192  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  28.28 
 
 		 1029 aa  191  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  28.1 
 
 		 1029 aa  190  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  28.1 
 
 		 1029 aa  190  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  27.23 
 
 		 1029 aa  189  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  29.74 
 
 		 1029 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2960  DNA repair exonuclease, SbcC  54.92 
 
 		 1191 aa  186  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.263309 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  59.89 
 
 		 962 aa  186  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  27.29 
 
 		 1029 aa  185  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  27.63 
 
 		 1029 aa  184  7e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  28.57 
 
 		 1029 aa  183  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08420  exonuclease SbcC  57.56 
 
 		 1009 aa  179  3e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1225  putative exonuclease  58.38 
 
 		 1058 aa  171  5e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  32.01 
 
 		 1018 aa  170  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  39.29 
 
 		 1046 aa  167  6.9999999999999995e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  40.09 
 
 		 1017 aa  167  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  32.9 
 
 		 1020 aa  167  8e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  44.2 
 
 		 1030 aa  166  2.0000000000000002e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  52.33 
 
 		 1047 aa  165  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  42.03 
 
 		 953 aa  163  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  30.51 
 
 		 1018 aa  160  9e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1924  DNA repair exonuclease, SbcC  53.41 
 
 		 995 aa  159  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557877  decreased coverage  0.00069537 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  47.8 
 
 		 1009 aa  157  1e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  38.39 
 
 		 1013 aa  155  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  40.19 
 
 		 1020 aa  153  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  46.07 
 
 		 1018 aa  152  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  49.4 
 
 		 1039 aa  152  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  46.41 
 
 		 1049 aa  151  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  46.07 
 
 		 1018 aa  151  6e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  46.07 
 
 		 1018 aa  151  7e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  46.07 
 
 		 1018 aa  150  9e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  37.87 
 
 		 1081 aa  150  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  39.55 
 
 		 1018 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  36.18 
 
 		 1018 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  46.63 
 
 		 1018 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  46.63 
 
 		 1018 aa  150  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  46.63 
 
 		 1018 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  29.59 
 
 		 1018 aa  149  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  45.81 
 
 		 1009 aa  147  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  45.81 
 
 		 1009 aa  147  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  55.56 
 
 		 1006 aa  147  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  27.34 
 
 		 1038 aa  146  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  39.8 
 
 		 1022 aa  144  8e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  49.46 
 
 		 1020 aa  143  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  41.07 
 
 		 1059 aa  126  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1031  SMC domain-containing protein  44.77 
 
 		 1033 aa  126  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  39.74 
 
 		 1046 aa  120  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  47.24 
 
 		 1024 aa  120  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  29.19 
 
 		 1011 aa  115  3e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1149  SMC protein-like protein  49.66 
 
 		 1101 aa  116  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  36.79 
 
 		 1091 aa  114  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  43.57 
 
 		 1223 aa  113  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  45.04 
 
 		 1223 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  45.26 
 
 		 1224 aa  112  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  38.51 
 
 		 1234 aa  110  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  35.27 
 
 		 824 aa  110  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  37.91 
 
 		 1226 aa  110  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  44.53 
 
 		 1307 aa  109  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  42.62 
 
 		 1213 aa  110  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  29.35 
 
 		 1219 aa  109  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  44.53 
 
 		 1303 aa  109  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  41.14 
 
 		 1230 aa  108  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  51.72 
 
 		 1214 aa  108  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  43.8 
 
 		 1088 aa  108  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  52.73 
 
 		 1214 aa  107  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  50.85 
 
 		 1214 aa  107  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  52.73 
 
 		 1214 aa  107  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  52.73 
 
 		 1214 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  52.73 
 
 		 1214 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1496  SMC domain-containing protein  35.27 
 
 		 824 aa  106  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00508772  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0894  SMC domain-containing protein  35.09 
 
 		 1165 aa  107  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  33.18 
 
 		 1047 aa  105  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  33.64 
 
 		 906 aa  105  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0316  exonuclease subunit SbcC  33.18 
 
 		 1047 aa  105  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.53041  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00345  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  33.18 
 
 		 1048 aa  105  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3212  exonuclease SbcC  33.18 
 
 		 1048 aa  105  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223053  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  40.12 
 
 		 910 aa  105  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0865  exonuclease subunit SbcC  34.9 
 
 		 1042 aa  105  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.379439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00349  hypothetical protein  33.18 
 
 		 1048 aa  105  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0424  exonuclease subunit SbcC  32.72 
 
 		 1047 aa  104  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  49.24 
 
 		 1211 aa  104  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0451  exonuclease subunit SbcC  27.19 
 
 		 1046 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03135  exonuclease SbcC  48.03 
 
 		 1238 aa  103  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  49.24 
 
 		 1211 aa  104  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1980  SMC domain-containing protein  31.94 
 
 		 1227 aa  103  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0432  exonuclease subunit SbcC  31.94 
 
 		 1046 aa  103  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  42.34 
 
 		 1346 aa  102  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>