More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2530 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2530  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 350 aa  700    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000736484  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2268  3-isopropylmalate dehydrogenase  90 
 
 		 350 aa  621  1e-177  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000036299 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3368  3-isopropylmalate dehydrogenase  72.67 
 
 		 478 aa  475  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1417  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.02 
 
 		 347 aa  469  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.928689 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10780  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.75 
 
 		 339 aa  467  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473276  normal  0.969986 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1704  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.54 
 
 		 348 aa  464  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.106522 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1167  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.34 
 
 		 354 aa  444  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90936  normal  0.0719652 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2383  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.6 
 
 		 347 aa  442  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7787  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.6 
 
 		 358 aa  439  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1352  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.63 
 
 		 362 aa  432  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.762323  normal  0.873029 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08590  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.77 
 
 		 358 aa  427  1e-118  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8042  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.34 
 
 		 348 aa  424  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0710  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.57 
 
 		 348 aa  425  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.975761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4233  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.61 
 
 		 336 aa  418  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397196  normal  0.260479 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1911  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.61 
 
 		 336 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1891  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.61 
 
 		 336 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.338158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1957  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.61 
 
 		 336 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.54302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3224  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.64 
 
 		 337 aa  417  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2855  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.35 
 
 		 339 aa  416  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0981  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.89 
 
 		 343 aa  417  9.999999999999999e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4067  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.28 
 
 		 340 aa  417  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285874  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6014  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.57 
 
 		 345 aa  416  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08950  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.18 
 
 		 342 aa  411  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.102676  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0175  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.22 
 
 		 354 aa  414  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2812  3-isopropylmalate dehydrogenase  65.91 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0615  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.1 
 
 		 354 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3544  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.79 
 
 		 353 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18770  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.18 
 
 		 355 aa  400  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103024  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2129  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.03 
 
 		 336 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.985992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1472  3-isopropylmalate dehydrogenase  64.83 
 
 		 340 aa  395  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  0.121569 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13010  3-isopropylmalate dehydrogenase  63.87 
 
 		 336 aa  395  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.9867e-34  normal  0.83086 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4289  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.17 
 
 		 346 aa  388  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1098  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.25 
 
 		 342 aa  382  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1239  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.01 
 
 		 361 aa  367  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3632  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.67 
 
 		 342 aa  360  2e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1129  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.13 
 
 		 343 aa  351  1e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142086 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1536  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.06 
 
 		 342 aa  333  3e-90  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2989  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.14 
 
 		 357 aa  324  1e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.128527  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3031  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.14 
 
 		 357 aa  324  1e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10890  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.16 
 
 		 358 aa  317  2e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1962  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.28 
 
 		 353 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.292825  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2219  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.73 
 
 		 355 aa  309  5e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.215948  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1279  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.07 
 
 		 364 aa  307  1.0000000000000001e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1586  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.72 
 
 		 349 aa  293  3e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5246  tartrate dehydrogenase  46.02 
 
 		 359 aa  289  6e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6024  tartrate dehydrogenase  45.4 
 
 		 359 aa  287  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5230  tartrate dehydrogenase  45.92 
 
 		 359 aa  286  5e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.268691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0025  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.05 
 
 		 374 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0500752  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5811  tartrate dehydrogenase  45.45 
 
 		 359 aa  281  9e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.213581  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3993  tartrate dehydrogenase  45.17 
 
 		 363 aa  281  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5152  tartrate dehydrogenase  44.79 
 
 		 359 aa  281  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1486  tartrate dehydrogenase  45.66 
 
 		 360 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197806  hitchhiker  0.00128881 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6098  tartrate dehydrogenase  45.38 
 
 		 360 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4687  tartrate dehydrogenase  45.63 
 
 		 359 aa  277  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0774003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2935  tartrate dehydrogenase  46.2 
 
 		 359 aa  276  5e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0865052  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4031  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.31 
 
 		 351 aa  275  7e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1612  tartrate dehydrogenase oxidoreductase protein  44.63 
 
 		 361 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0186674  normal  0.0323069 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2567  tartrate dehydrogenase  44.38 
 
 		 356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.25872  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2879  tartrate dehydrogenase  43.82 
 
 		 362 aa  272  8.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284838  normal  0.0371966 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4538  tartrate dehydrogenase  44.6 
 
 		 358 aa  271  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0251  tartrate dehydrogenase  45.7 
 
 		 372 aa  271  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.66296  normal  0.147869 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5317  tartrate dehydrogenase  44.78 
 
 		 361 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2087  tartrate dehydrogenase  42.19 
 
 		 365 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3080  tartrate dehydrogenase  42.57 
 
 		 357 aa  269  5.9999999999999995e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.07336 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2360  tartrate dehydrogenase  43.18 
 
 		 362 aa  268  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5899  tartrate dehydrogenase  45.79 
 
 		 358 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2349  tartrate dehydrogenase  43.18 
 
 		 364 aa  268  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0663819  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1388  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  46.84 
 
 		 361 aa  267  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1942  tartrate dehydrogenase  44.23 
 
 		 359 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2860  tartrate dehydrogenase  43.18 
 
 		 364 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.668789  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1843  tartrate dehydrogenase  46.52 
 
 		 361 aa  266  5e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1888  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  46.52 
 
 		 361 aa  266  5e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1833  tartrate dehydrogenase  46.52 
 
 		 361 aa  266  5e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.286995 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2526  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  46.52 
 
 		 361 aa  266  5e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2026  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  46.52 
 
 		 361 aa  266  5e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00108776  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2363  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.09 
 
 		 371 aa  265  5.999999999999999e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.49502 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2662  tartrate dehydrogenase  41.39 
 
 		 364 aa  264  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.508333  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1841  tartrate dehydrogenase  44.32 
 
 		 375 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.473858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3166  tartrate dehydrogenase  42.54 
 
 		 361 aa  265  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2058  tartrate dehydrogenase/decarboxylase  46.52 
 
 		 361 aa  265  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01770  predicted dehydrogenase  46.2 
 
 		 361 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.273325  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01758  hypothetical protein  46.2 
 
 		 361 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00890  tartrate dehydrogenase, putative  43.79 
 
 		 359 aa  264  2e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1339  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.94 
 
 		 375 aa  263  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3626  tartrate dehydrogenase  44.1 
 
 		 361 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3237  tartrate dehydrogenase  41.44 
 
 		 361 aa  263  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5025  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.55 
 
 		 347 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.70387 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0609  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.36 
 
 		 374 aa  263  3e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.35358  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2191  tartrate dehydrogenase  43.33 
 
 		 363 aa  263  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3119  tartrate dehydrogenase  43.84 
 
 		 361 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.560856 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2396  tartrate dehydrogenase  43.57 
 
 		 373 aa  262  6e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0821619  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5152  tartrate dehydrogenase  43.53 
 
 		 361 aa  262  6e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4532  tartrate dehydrogenase  43.53 
 
 		 361 aa  262  6e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5707  tartrate dehydrogenase  43.53 
 
 		 361 aa  262  6e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0365882 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5311  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.43 
 
 		 347 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3034  tartrate dehydrogenase  43.96 
 
 		 360 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2992  tartrate dehydrogenase  43.43 
 
 		 359 aa  261  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3173  tartrate dehydrogenase  43.68 
 
 		 361 aa  260  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2196  tartrate dehydrogenase  41.32 
 
 		 363 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4976  tartrate dehydrogenase  43.84 
 
 		 361 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.260447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>