More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2491 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2491  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  221  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0578365  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2231  nitrogen regulatory protein P-II  95.54 
 
 		 112 aa  213  5e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000261063 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0850  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 113 aa  157  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1565  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  156  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.204869  normal  0.0818079 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1786  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7999  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1235  Nitrogen regulatory protein PII  65.18 
 
 		 112 aa  148  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  147  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2546  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.164416 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0969  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  145  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23790  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.269755 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0981  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.502811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1299  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 117 aa  140  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1394  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00884752  decreased coverage  0.00366325 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1957  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2003  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1466  nitrogen regulatory protein P-II  56.76 
 
 		 113 aa  138  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1188  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671677  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  137  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  137  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  52.68 
 
 		 112 aa  137  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4014  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00726508  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3148  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000232085  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  53.57 
 
 		 112 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0259  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  134  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6030  nitrogen regulatory protein P-II 2  51.79 
 
 		 112 aa  134  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69810  nitrogen regulatory protein P-II 2  51.79 
 
 		 112 aa  134  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.241854 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1918  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  134  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  134  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2168  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  134  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000216085  hitchhiker  0.000000791345 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2852  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  133  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287324  normal  0.0455746 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  133  9e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  132  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2590  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  132  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3395  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  132  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0681  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  132  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.4321 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1181  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  132  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  57.14 
 
 		 112 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  131  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2604  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320307  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  131  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  131  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  131  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 121 aa  131  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000114835  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2406  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  130  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  51.79 
 
 		 112 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  53.57 
 
 		 112 aa  130  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  130  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2415  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194654  hitchhiker  0.00652052 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2321  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  130  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0286658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5738  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  130  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0879  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  130  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2711  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  130  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000634529  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1799  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.534869  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2456  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  130  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2411  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  130  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2479  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  130  6.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494885  normal  0.880519 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  50.89 
 
 		 112 aa  130  6.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00479  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  130  7.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2477  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  129  9e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.698113  normal  0.567778 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0491  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0623  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000846933  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1130  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1163  nitrogen regulatory protein P-II  56.76 
 
 		 113 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.334919  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3241  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  128  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  128  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 114 aa  128  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  128  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  128  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  128  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  128  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  128  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3058  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  128  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  128  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  128  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1085  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1243  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.50478  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  50 
 
 		 112 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03655  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 124 aa  127  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.949365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>