More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2448 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 277 aa  559  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  59.26 
 
 		 278 aa  309  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.34 
 
 		 291 aa  295  4e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  53.36 
 
 		 287 aa  293  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  51.85 
 
 		 278 aa  292  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  54.72 
 
 		 279 aa  288  7e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  49.07 
 
 		 273 aa  288  7e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  53.58 
 
 		 279 aa  287  1e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  51.11 
 
 		 283 aa  285  5.999999999999999e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10740  short chain dehydrogenase  47.51 
 
 		 278 aa  249  4e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.896736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2717  short chain dehydrogenase  46.62 
 
 		 276 aa  248  7e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03890  short chain dehydrogenase  47.01 
 
 		 276 aa  247  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.67 
 
 		 267 aa  236  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615665  normal  0.271714 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0983  short chain dehydrogenase  45.93 
 
 		 277 aa  230  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1560  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  43.01 
 
 		 272 aa  216  4e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.74 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.28 
 
 		 280 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152344 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0069  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  42.03 
 
 		 277 aa  204  1e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0065  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  42.91 
 
 		 274 aa  199  5e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  40.37 
 
 		 272 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.38 
 
 		 285 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  39.33 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.22 
 
 		 273 aa  182  7e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  41.64 
 
 		 275 aa  181  8.000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.26 
 
 		 273 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  42.11 
 
 		 286 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000200632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 		 271 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.42 
 
 		 271 aa  179  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  36.84 
 
 		 291 aa  179  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 		 285 aa  178  8e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.300574 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  36.33 
 
 		 283 aa  176  5e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.41 
 
 		 306 aa  175  6e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2806  short chain dehydrogenase  35.69 
 
 		 291 aa  175  8e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.928497  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1648  hypothetical protein  36.33 
 
 		 283 aa  175  8e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2060  short chain dehydrogenase  41.95 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2827  short chain dehydrogenase  35.09 
 
 		 291 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  37.54 
 
 		 291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  39.85 
 
 		 271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.81 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2582  short chain dehydrogenase  35.44 
 
 		 291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0166341  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2778  short chain dehydrogenase  37.54 
 
 		 281 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0106  short chain dehydrogenase  43.28 
 
 		 284 aa  172  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.417565  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  37.19 
 
 		 291 aa  172  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  41.29 
 
 		 272 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  36.84 
 
 		 291 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  35.44 
 
 		 291 aa  171  9e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2541  short chain dehydrogenase  36.49 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000142979  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0723  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.66 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158642  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.53 
 
 		 275 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.67 
 
 		 271 aa  168  9e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.54 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6205  short chain dehydrogenase  40.98 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3194  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234456  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1121  short chain dehydrogenase  37.08 
 
 		 256 aa  165  8e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0921359  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 		 317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1140  short-chain dehydrogenase/reductase  36.59 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3541  short chain dehydrogenase  39.93 
 
 		 270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100637  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1905  short chain dehydrogenase  34.98 
 
 		 280 aa  163  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0945301  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 		 276 aa  163  3e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1861  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  40.89 
 
 		 270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0952097  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  48.21 
 
 		 280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.41 
 
 		 314 aa  161  9e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.01 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.64 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4006  short chain dehydrogenase  37.82 
 
 		 277 aa  159  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.3 
 
 		 291 aa  160  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0718028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0805  short chain dehydrogenase  34.81 
 
 		 275 aa  160  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.83 
 
 		 284 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.62 
 
 		 279 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1586  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 		 271 aa  159  5e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1053  short chain dehydrogenase  35.32 
 
 		 258 aa  159  5e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.98 
 
 		 272 aa  159  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  35.64 
 
 		 344 aa  158  9e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3850  short chain dehydrogenase  36.86 
 
 		 277 aa  158  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.91 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  49.75 
 
 		 280 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3006  short chain dehydrogenase  35.69 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.662258  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0101  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.26 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.5 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  49.23 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.18 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4099  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.16 
 
 		 292 aa  156  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0934887  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2279  short chain dehydrogenase  41.42 
 
 		 272 aa  156  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3557  short chain dehydrogenase  37.13 
 
 		 277 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18665  normal  0.726998 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3209  short chain dehydrogenase  35.82 
 
 		 268 aa  155  9e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.821388  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46600  short chain dehydrogenase  37.74 
 
 		 268 aa  155  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000918039  hitchhiker  0.00000172259 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.62 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.719818  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1156  short chain dehydrogenase  35.96 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.565879  hitchhiker  0.0000930327 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1270  short chain dehydrogenase  34.83 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3160  short chain dehydrogenase  34.83 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140307  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3022  short chain dehydrogenase  34.83 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.515629  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 		 286 aa  154  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0967  short chain dehydrogenase  35.21 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3447  short chain dehydrogenase  39.02 
 
 		 268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.71 
 
 		 256 aa  152  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0572  short chain dehydrogenase  33.71 
 
 		 269 aa  152  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0597  short chain dehydrogenase  33.71 
 
 		 269 aa  152  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.853747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>