174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2442 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2442  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  511  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00412496  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2191  hypothetical protein  80.24 
 
 		 254 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173373 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14990  hypothetical protein  54.96 
 
 		 258 aa  237  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.224372  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1834  protein of unknown function DUF328  58.05 
 
 		 266 aa  224  7e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0152715 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1496  protein of unknown function DUF328  53.02 
 
 		 263 aa  221  8e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2082  protein of unknown function DUF328  53.97 
 
 		 277 aa  204  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.190932  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3327  protein of unknown function DUF328  50.62 
 
 		 247 aa  201  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103955  normal  0.782071 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09500  hypothetical protein  46.39 
 
 		 265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2016  hypothetical protein  47.28 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0608561  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2140  protein of unknown function DUF328  53.68 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1609  protein of unknown function DUF328  42.86 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0459423  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7087  hypothetical protein  44.93 
 
 		 246 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.770257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2136  hypothetical protein  41.73 
 
 		 265 aa  156  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.730089  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1706  protein of unknown function DUF328  43.97 
 
 		 251 aa  152  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200146  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2992  hypothetical protein  43.52 
 
 		 248 aa  152  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.865077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2146  protein of unknown function DUF328  43.12 
 
 		 247 aa  150  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.747027  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3311  protein of unknown function DUF328  42.86 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5098  hypothetical protein  45.29 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0555591 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12110  hypothetical protein  44.63 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0506388  normal  0.0991463 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5887  protein of unknown function DUF328  39.09 
 
 		 272 aa  142  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0872  protein of unknown function DUF328  34.75 
 
 		 279 aa  142  6e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.20044 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4987  protein of unknown function DUF328  43.97 
 
 		 252 aa  142  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10150  hypothetical protein  44.66 
 
 		 249 aa  141  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2726  hypothetical protein  42.4 
 
 		 248 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508073  normal  0.289148 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3273  hypothetical protein  41.51 
 
 		 248 aa  139  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.416895  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2696  hypothetical protein  41.94 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2740  hypothetical protein  41.94 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.113399  normal  0.734535 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5849  hypothetical protein  41.74 
 
 		 255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000227019  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16650  hypothetical protein  41.07 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0536513  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0488  protein of unknown function DUF328  37.6 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.470707 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2790  protein of unknown function DUF328  38.08 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00205799  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0381  protein of unknown function DUF328  30.53 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0917004  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2642  protein of unknown function DUF328  39.91 
 
 		 232 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1003  hypothetical protein  26.77 
 
 		 246 aa  89.4  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1066  hypothetical protein  25.3 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.299456  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0642  hypothetical protein  32.26 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.510239  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0804  hypothetical protein  24.41 
 
 		 246 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.770512  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0435  conserved hypothetical protein (DUF328 domain protein)  26.91 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000530905  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1358  hypothetical protein  35.98 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0026  hypothetical protein  36.59 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.234225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0799  hypothetical protein  25.23 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000173918  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0363  hypothetical protein  35.17 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000177188  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3597  hypothetical protein  35.06 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0753  hypothetical protein  26.58 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3333  hypothetical protein  36.84 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0344  protein of unknown function DUF328  28.45 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000311872  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1068  hypothetical protein  26.07 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.786925  normal  0.0318222 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2261  hypothetical protein  33.33 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2140  hypothetical protein  32.92 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540337  normal  0.546865 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5551  hypothetical protein  29.24 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.177629 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1979  hypothetical protein  31.29 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1048  hypothetical protein  29.79 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000331032  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1054  hypothetical protein  32.65 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00231161  normal  0.551617 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4905  hypothetical protein  30.41 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1115  hypothetical protein  29.79 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210932  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3241  hypothetical protein  29.79 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.441817 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1149  hypothetical protein  31.69 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0805  hypothetical protein  30.25 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29099  normal  0.224825 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1284  hypothetical protein  31.17 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00673755  normal  0.205334 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3600  hypothetical protein  30.25 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2963  hypothetical protein  30.5 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0521489  normal  0.778941 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1375  hypothetical protein  27.97 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.508327  hitchhiker  0.00492897 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3473  hypothetical protein  30.25 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.957254  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2161  hypothetical protein  32.41 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4789  hypothetical protein  31.03 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204392  normal  0.287151 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1093  hypothetical protein  30.77 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000355318  normal  0.0378607 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0604  protein of unknown function DUF328  29.1 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0200357  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2247  hypothetical protein  28.27 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0767296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03318  hypothetical protein  30.38 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2652  hypothetical protein  28.51 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3540  hypothetical protein  29.58 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3180  hypothetical protein  31.29 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0791396  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0917  hypothetical protein  32.24 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000728538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1934  hypothetical protein  27.31 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000499143  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1090  hypothetical protein  31.97 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3620  hypothetical protein  31.79 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.558982  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3045  hypothetical protein  29.79 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000132824  normal  0.280975 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2092  hypothetical protein  31.33 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.786423 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11743  predicted protein  28.12 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.555211  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0536  protein of unknown function DUF328  27.62 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2009  hypothetical protein  29.57 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004446  hypothetical protein  29.14 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00375515  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2893  hypothetical protein  29.57 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1467  hypothetical protein  31.97 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000638991  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1611  hypothetical protein  28.69 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3665  hypothetical protein  28.29 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2223  hypothetical protein  28.69 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1161  hypothetical protein  31.97 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000956326  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0708  hypothetical protein  31.97 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.018816  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1321  hypothetical protein  31.97 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.522581  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1330  hypothetical protein  31.97 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0444  hypothetical protein  31.97 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.82979  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0005  hypothetical protein  27.27 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0915517  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4436  hypothetical protein  27.81 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133598  normal  0.857589 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0575  protein of unknown function DUF328  29.66 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3046  hypothetical protein  31.21 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00949  hypothetical protein  27.31 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0444  hypothetical protein  29.59 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3860  hypothetical protein  30.34 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0016  hypothetical protein  32.14 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>