More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2436 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  100 
 
 
190 aa  389  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  88.42 
 
 
190 aa  335  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  55.5 
 
 
190 aa  221  6e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  57.98 
 
 
195 aa  216  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  55.33 
 
 
197 aa  214  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  58.01 
 
 
183 aa  214  9e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09550  peptide deformylase  56.32 
 
 
213 aa  213  9.999999999999999e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.255264  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  54.31 
 
 
197 aa  209  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  53.3 
 
 
197 aa  206  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  53.3 
 
 
197 aa  206  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  53.3 
 
 
197 aa  206  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  54.31 
 
 
197 aa  207  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  53.3 
 
 
215 aa  191  4e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3731  peptide deformylase  51.53 
 
 
198 aa  187  8e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.535737  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0660  peptide deformylase  53.54 
 
 
200 aa  182  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  51.15 
 
 
192 aa  164  5e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  50.29 
 
 
213 aa  160  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  52.41 
 
 
221 aa  150  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09360  peptide deformylase  49.73 
 
 
188 aa  150  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  50.31 
 
 
182 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  45.45 
 
 
180 aa  141  5e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2602  peptide deformylase  44.2 
 
 
199 aa  136  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280121  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1964  peptide deformylase  49.71 
 
 
219 aa  135  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000418525  hitchhiker  0.000000552794 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  42.44 
 
 
181 aa  135  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  47.56 
 
 
185 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  42.56 
 
 
186 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  45.93 
 
 
181 aa  131  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  44.77 
 
 
204 aa  130  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0358  peptide deformylase  49.7 
 
 
227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  42.05 
 
 
186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  42.55 
 
 
188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  45.66 
 
 
182 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  43.6 
 
 
181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  43.53 
 
 
230 aa  125  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  49.04 
 
 
200 aa  125  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  52.26 
 
 
191 aa  124  6e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  43.79 
 
 
173 aa  124  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  44.05 
 
 
164 aa  124  9e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  39.68 
 
 
184 aa  123  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  40.35 
 
 
162 aa  122  4e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  43.02 
 
 
225 aa  122  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  42.77 
 
 
180 aa  122  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  40.22 
 
 
182 aa  120  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  44.12 
 
 
162 aa  120  9e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  40.91 
 
 
168 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  42.77 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5333  peptide deformylase  46.41 
 
 
177 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.816635  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  42.01 
 
 
167 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  41.28 
 
 
183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  43.01 
 
 
181 aa  118  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  42.17 
 
 
204 aa  117  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1799  peptide deformylase  43.79 
 
 
162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.341074  hitchhiker  0.00908048 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  43.6 
 
 
197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  44.51 
 
 
162 aa  115  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  46.75 
 
 
161 aa  115  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  39.08 
 
 
183 aa  114  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  40.7 
 
 
178 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3250  peptide deformylase  43.79 
 
 
177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  39.31 
 
 
166 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1333  peptide deformylase  43.79 
 
 
177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465999  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14050  peptide deformylase  42.11 
 
 
162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455853  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2056  peptide deformylase  43.79 
 
 
177 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1559  peptide deformylase  43.79 
 
 
177 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.523571  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2587  peptide deformylase  43.79 
 
 
177 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2061  peptide deformylase  43.79 
 
 
177 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.203959  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  40.11 
 
 
177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2441  peptide deformylase  43.79 
 
 
177 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2498  peptide deformylase  43.79 
 
 
177 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  40.2 
 
 
230 aa  112  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  41.67 
 
 
162 aa  112  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1342  peptide deformylase  43.14 
 
 
177 aa  111  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2023  peptide deformylase  43.79 
 
 
177 aa  111  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.802716  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0165  peptide deformylase  38.89 
 
 
179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1997  peptide deformylase  39.35 
 
 
147 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  40 
 
 
168 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  40.13 
 
 
187 aa  109  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  39.43 
 
 
171 aa  109  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  39.43 
 
 
168 aa  109  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  42.48 
 
 
177 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1598  polypeptide deformylase  43.51 
 
 
179 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.331513  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  41.77 
 
 
177 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  38.75 
 
 
157 aa  108  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  40 
 
 
192 aa  108  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0246  peptide deformylase  40.96 
 
 
196 aa  108  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16790  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  35.88 
 
 
163 aa  107  7.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288836  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  42.35 
 
 
178 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  40 
 
 
168 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3780  peptide deformylase  42.75 
 
 
179 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.873393  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  39.43 
 
 
168 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  38.86 
 
 
168 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  40.8 
 
 
167 aa  106  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  37.71 
 
 
168 aa  106  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  39.43 
 
 
168 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  39.2 
 
 
168 aa  106  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  41.77 
 
 
177 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2590  peptide deformylase  42.42 
 
 
179 aa  106  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  39.01 
 
 
178 aa  106  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3284  peptide deformylase  43.29 
 
 
176 aa  105  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.373391  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  36.78 
 
 
170 aa  105  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  36.78 
 
 
170 aa  105  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>