More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2406 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2160  trigger factor  91.39 
 
 		 464 aa  820    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000432452 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2406  trigger factor  100 
 
 		 469 aa  928    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0022242  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09870  trigger factor  62.82 
 
 		 454 aa  562  1.0000000000000001e-159  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.478528  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3518  trigger factor  55.08 
 
 		 471 aa  484  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1392  trigger factor  55.05 
 
 		 460 aa  479  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.323159  normal  0.446961 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09080  trigger factor  53.68 
 
 		 452 aa  474  1e-132  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.985719  normal  0.0224029 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24390  trigger factor  57.38 
 
 		 469 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1118  trigger factor  56.67 
 
 		 449 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2599  trigger factor  52.14 
 
 		 470 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0954  trigger factor  51.3 
 
 		 455 aa  433  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.928041 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  51.13 
 
 		 454 aa  409  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12170  trigger factor  46.23 
 
 		 479 aa  402  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4041  trigger factor  47.52 
 
 		 473 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.248232  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  46.79 
 
 		 461 aa  401  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09520  trigger factor  50.59 
 
 		 519 aa  399  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.301416  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  47.23 
 
 		 450 aa  389  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  46.21 
 
 		 507 aa  382  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1850  trigger factor  46.7 
 
 		 513 aa  384  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00394566  normal  0.0360337 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  45.32 
 
 		 479 aa  380  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7296  trigger factor  48.53 
 
 		 466 aa  378  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  46.27 
 
 		 482 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  46.27 
 
 		 478 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  46.27 
 
 		 478 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0689  trigger factor  46.84 
 
 		 459 aa  370  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000380818  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  46.15 
 
 		 481 aa  368  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  45.66 
 
 		 468 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2478  trigger factor  46.8 
 
 		 463 aa  365  1e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.444634 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  46.92 
 
 		 448 aa  361  2e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  46.52 
 
 		 471 aa  360  3e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  46.79 
 
 		 463 aa  360  4e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12487  trigger factor  44.34 
 
 		 466 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0882  trigger factor  45.35 
 
 		 449 aa  357  2.9999999999999997e-97  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3500  trigger factor  45.77 
 
 		 465 aa  353  4e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0736  trigger factor  42.7 
 
 		 449 aa  350  4e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.45082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1576  trigger factor  44.04 
 
 		 491 aa  348  1e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  44.37 
 
 		 481 aa  348  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  41.65 
 
 		 483 aa  346  6e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1369  trigger factor  44.06 
 
 		 458 aa  316  7e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.684255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  33.1 
 
 		 488 aa  206  8e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  34.16 
 
 		 446 aa  193  5e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  31.29 
 
 		 429 aa  189  5.999999999999999e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  32.25 
 
 		 478 aa  184  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  29.48 
 
 		 438 aa  183  6e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  29.72 
 
 		 448 aa  181  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  31.38 
 
 		 436 aa  179  8e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  28.38 
 
 		 435 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  28.61 
 
 		 438 aa  177  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  29.4 
 
 		 435 aa  176  6e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  27.71 
 
 		 435 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  28.18 
 
 		 446 aa  171  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  27.94 
 
 		 435 aa  169  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  28.24 
 
 		 433 aa  167  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  28 
 
 		 435 aa  166  8e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0109  trigger factor  29.36 
 
 		 432 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17984 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  28.38 
 
 		 428 aa  162  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  26.94 
 
 		 432 aa  160  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  27.36 
 
 		 431 aa  160  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  28.04 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  28.04 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  28.87 
 
 		 428 aa  159  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  30.57 
 
 		 425 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  26.54 
 
 		 433 aa  157  4e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  27.67 
 
 		 426 aa  156  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  30.4 
 
 		 425 aa  155  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  30 
 
 		 427 aa  155  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  30.4 
 
 		 425 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  30.4 
 
 		 425 aa  155  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  30.4 
 
 		 425 aa  155  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  30.4 
 
 		 425 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  29.89 
 
 		 425 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  29.89 
 
 		 425 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  30.4 
 
 		 425 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  30.17 
 
 		 425 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1735  trigger factor  28.18 
 
 		 433 aa  153  8e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  26.67 
 
 		 428 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  30.91 
 
 		 428 aa  150  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  26.4 
 
 		 428 aa  150  6e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  28.35 
 
 		 435 aa  149  8e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2222  trigger factor  29.29 
 
 		 438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.939539  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0488  trigger factor  29.14 
 
 		 433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0133776  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  29.35 
 
 		 500 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2566  trigger factor  29.95 
 
 		 435 aa  147  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  30.99 
 
 		 436 aa  146  6e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  29.32 
 
 		 438 aa  146  7.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  27.92 
 
 		 428 aa  146  9e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  26.93 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21241  trigger factor  29.71 
 
 		 472 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0586  trigger factor  30.09 
 
 		 485 aa  144  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.960131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0916  trigger factor  27.44 
 
 		 440 aa  144  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  27.13 
 
 		 427 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1253  trigger factor  29.44 
 
 		 472 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  27.68 
 
 		 428 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  27.23 
 
 		 435 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  29.59 
 
 		 449 aa  142  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  31.75 
 
 		 434 aa  141  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  27.61 
 
 		 432 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  30.94 
 
 		 434 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0066  trigger factor  30.75 
 
 		 469 aa  140  6e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  27.17 
 
 		 433 aa  140  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  28.11 
 
 		 431 aa  140  6e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>