More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2401 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2155  valyl-tRNA synthetase  90.33 
 
 		 872 aa  1596    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123734 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2593  valyl-tRNA synthetase  57.54 
 
 		 902 aa  1009    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0019  valyl-tRNA synthetase  58.3 
 
 		 862 aa  1008    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.661225 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1936  valyl-tRNA synthetase  62.44 
 
 		 881 aa  1088    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24280  valyl-tRNA synthetase  60.14 
 
 		 906 aa  1053    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3508  valyl-tRNA synthetase  62.65 
 
 		 877 aa  1087    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.633691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09130  valyl-tRNA synthetase  58.18 
 
 		 885 aa  1010    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0788672 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09690  valyl-tRNA synthetase  60.3 
 
 		 895 aa  1054    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1701  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  61.47 
 
 		 846 aa  1074    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000331073  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1314  valyl-tRNA synthetase  60.36 
 
 		 903 aa  1049    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.558712 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0963  valyl-tRNA synthetase  60.22 
 
 		 901 aa  1060    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1125  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  59.15 
 
 		 916 aa  1026    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5200  valyl-tRNA synthetase  61.14 
 
 		 876 aa  1087    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1197  valyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 		 911 aa  992    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6767  valyl-tRNA synthetase  60.49 
 
 		 845 aa  1055    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0832206 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0192  valine--tRNA ligase  54.21 
 
 		 925 aa  971    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1403  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  62.67 
 
 		 886 aa  1102    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00382029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0015  valyl-tRNA synthetase  58.32 
 
 		 860 aa  1031    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139403  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1581  aminoacyl-tRNA synthetase class Ia  62.07 
 
 		 861 aa  1096    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2401  valyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 873 aa  1785    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0307  valyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 		 855 aa  809    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2292  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  62.31 
 
 		 836 aa  1063    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.436685  normal  0.164077 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2881  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  62.48 
 
 		 858 aa  1035    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3473  valyl-tRNA synthetase  59.12 
 
 		 871 aa  996    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560604  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09930  valyl-tRNA synthetase  73.8 
 
 		 894 aa  1342    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0088  valyl-tRNA synthetase  38.42 
 
 		 802 aa  581  1e-164  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0136  valyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 		 808 aa  582  1e-164  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0464  valyl-tRNA synthetase  36.8 
 
 		 864 aa  552  1e-156  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1241  valyl-tRNA synthetase  36.32 
 
 		 896 aa  518  1.0000000000000001e-145  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3319  valyl-tRNA synthetase  35.6 
 
 		 928 aa  501  1e-140  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0018  valyl-tRNA synthetase  36.77 
 
 		 892 aa  479  1e-133  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.910453  normal  0.161561 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1536  valyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 		 908 aa  478  1e-133  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0205  valyl-tRNA synthetase  33.7 
 
 		 905 aa  462  1e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  32.2 
 
 		 886 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  32.16 
 
 		 886 aa  437  1e-121  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1721  valyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 		 864 aa  438  1e-121  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  31.9 
 
 		 886 aa  438  1e-121  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  30.27 
 
 		 906 aa  435  1e-120  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  31.18 
 
 		 886 aa  433  1e-120  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  32.81 
 
 		 855 aa  430  1e-119  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1572  valyl-tRNA synthetase  34.76 
 
 		 863 aa  428  1e-118  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.330125  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  32.74 
 
 		 858 aa  428  1e-118  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2626  valyl-tRNA synthetase  32.66 
 
 		 865 aa  425  1e-117  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0403  valyl-tRNA synthetase  35.15 
 
 		 865 aa  422  1e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.52584  normal  0.0399554 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  32.05 
 
 		 809 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1477  valyl-tRNA synthetase  32 
 
 		 771 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2064  valyl-tRNA synthetase  34.45 
 
 		 863 aa  413  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2184  valyl-tRNA synthetase  31.45 
 
 		 865 aa  411  1e-113  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1976  valyl-tRNA synthetase  32.61 
 
 		 869 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1456  valyl-tRNA synthetase  33.06 
 
 		 799 aa  387  1e-106  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1019  valyl-tRNA synthetase  32.66 
 
 		 799 aa  384  1e-105  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000648947 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1649  valyl-tRNA synthetase  33.99 
 
 		 799 aa  377  1e-103  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.737664 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0166  valyl-tRNA synthetase  32.85 
 
 		 806 aa  375  1e-102  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000560387  normal  0.070078 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1497  valyl-tRNA synthetase  33.73 
 
 		 799 aa  374  1e-102  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.702651  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1878  valyl-tRNA synthetase  29.59 
 
 		 816 aa  365  1e-99  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1683  valyl-tRNA synthetase  32.98 
 
 		 808 aa  351  3e-95  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0962202  normal  0.0485293 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0603  putative valyl-tRNA synthetase  35.45 
 
 		 877 aa  340  5e-92  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0513  valyl-tRNA synthetase  26.73 
 
 		 883 aa  302  1e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0445  valyl-tRNA synthetase  27.08 
 
 		 883 aa  297  5e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.262089  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12474  valyl-tRNA synthetase  31.08 
 
 		 876 aa  290  6e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2982  valyl-tRNA synthetase  28.24 
 
 		 1002 aa  289  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  27.05 
 
 		 885 aa  288  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  27.13 
 
 		 881 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  27.34 
 
 		 881 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  27.13 
 
 		 881 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  27.13 
 
 		 881 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  27.01 
 
 		 881 aa  287  5e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2846  valyl-tRNA synthetase  28.59 
 
 		 904 aa  287  7e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.292827  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  27.97 
 
 		 882 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  27.13 
 
 		 881 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4303  valyl-tRNA synthetase  27.37 
 
 		 881 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  26.9 
 
 		 881 aa  285  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  27.6 
 
 		 882 aa  285  3.0000000000000004e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3951  valyl-tRNA synthetase  29.8 
 
 		 897 aa  285  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  27.01 
 
 		 881 aa  285  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  27.01 
 
 		 881 aa  284  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1928  valyl-tRNA synthetase  27.92 
 
 		 893 aa  283  7.000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  27.01 
 
 		 881 aa  283  8.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3559  valyl-tRNA synthetase  29.4 
 
 		 951 aa  283  9e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0705  valyl-tRNA synthetase  29.86 
 
 		 909 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.727948  normal  0.597989 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2853  valyl-tRNA synthetase  29.29 
 
 		 957 aa  281  3e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.250427  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0678  valyl-tRNA synthetase  29.73 
 
 		 909 aa  281  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3722  valyl-tRNA synthetase  29.27 
 
 		 951 aa  280  6e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12918  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1392  valyl-tRNA synthetase  28.24 
 
 		 902 aa  280  6e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0390871  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12260  valyl-tRNA synthetase  29.33 
 
 		 882 aa  280  9e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4102  valyl-tRNA synthetase  27.43 
 
 		 1006 aa  280  1e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1475  valyl-tRNA synthetase  27.6 
 
 		 947 aa  279  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.515714  normal  0.107806 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3681  valyl-tRNA synthetase  29.38 
 
 		 965 aa  278  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.470005  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3545  valyl-tRNA synthetase  29.38 
 
 		 965 aa  278  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.562165  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  29.72 
 
 		 909 aa  278  4e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0343  valyl-tRNA synthetase  28.05 
 
 		 867 aa  278  4e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6497  valyl-tRNA synthetase  28.83 
 
 		 903 aa  277  7e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  27.61 
 
 		 911 aa  277  7e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0407  valyl-tRNA synthetase  27.36 
 
 		 880 aa  277  7e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0922688  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4045  valyl-tRNA synthetase  29.25 
 
 		 965 aa  276  1.0000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.230085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_372  valyl-tRNA synthetase  27.35 
 
 		 880 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0207996  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4227  valyl-tRNA synthetase  28.13 
 
 		 909 aa  275  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  27.81 
 
 		 879 aa  274  4.0000000000000004e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0322  valyl-tRNA synthetase  30.03 
 
 		 894 aa  274  4.0000000000000004e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0442  valyl-tRNA synthetase  28.95 
 
 		 951 aa  273  7e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>