More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2345 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2345  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 273 aa  544  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.949438  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1126  extracellular solute-binding protein family 3  65.04 
 
 		 271 aa  295  4e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.390537  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3136  extracellular solute-binding protein  55.08 
 
 		 257 aa  263  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4150  extracellular solute-binding protein family 3  56.76 
 
 		 268 aa  257  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.82 
 
 		 503 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3156  extracellular solute-binding protein  53.42 
 
 		 260 aa  252  6e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0760439 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3140  extracellular solute-binding protein  53.42 
 
 		 260 aa  251  7e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2527  extracellular solute-binding protein  53.42 
 
 		 260 aa  251  7e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6491  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  52.99 
 
 		 260 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.353302  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4942  amino acid ABC transporter permease  53.42 
 
 		 489 aa  249  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  53.42 
 
 		 489 aa  249  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  53.42 
 
 		 489 aa  249  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1232  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  53.04 
 
 		 503 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0615942 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1531  extracellular solute-binding protein  53.45 
 
 		 260 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0450484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0687  extracellular solute-binding protein  47.25 
 
 		 265 aa  242  5e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0413327  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0945  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  47.25 
 
 		 265 aa  241  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336039  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4430  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  47.25 
 
 		 265 aa  240  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0682  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  50.85 
 
 		 257 aa  240  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0812  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  47.25 
 
 		 265 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00534966  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0760  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  47.25 
 
 		 265 aa  240  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0753  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  47.25 
 
 		 265 aa  240  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00539884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1035  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  47.25 
 
 		 265 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00041367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0855  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  47.25 
 
 		 265 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0947  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  47.25 
 
 		 265 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0638  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  50.85 
 
 		 257 aa  240  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.890453  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2686  extracellular solute-binding protein family 3  50.21 
 
 		 260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4924  extracellular solute-binding protein  50.43 
 
 		 261 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263703 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7224  ABC transporter substrate binding protein (nopaline)  50.64 
 
 		 257 aa  239  4e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1432  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  50.21 
 
 		 260 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.897061 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3808  extracellular solute-binding protein  50.85 
 
 		 257 aa  237  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0908  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  46.52 
 
 		 265 aa  237  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00179052  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0759  extracellular solute-binding protein  46.15 
 
 		 265 aa  237  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0231  extracellular solute-binding protein family 3  50.86 
 
 		 255 aa  236  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4163  extracellular solute-binding protein family 3  51.27 
 
 		 257 aa  235  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1928  extracellular solute-binding protein  47.69 
 
 		 278 aa  235  6e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2239  flagellar hook protein FlgE  50.64 
 
 		 257 aa  234  9e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000435982  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3835  extracellular solute-binding protein family 3  50.42 
 
 		 257 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1150  extracellular solute-binding protein  46.74 
 
 		 281 aa  228  1e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0235  extracellular solute-binding protein family 3  49.14 
 
 		 255 aa  228  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3698  extracellular solute-binding protein family 3  47.03 
 
 		 256 aa  227  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3855  extracellular solute-binding protein family 3  46.61 
 
 		 256 aa  223  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.868062  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0790  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.57 
 
 		 483 aa  219  3.9999999999999997e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.124129  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2439  extracellular solute-binding protein  42.7 
 
 		 259 aa  217  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.732764  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2487  extracellular solute-binding protein  42.7 
 
 		 259 aa  217  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2005  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  42.34 
 
 		 262 aa  215  5e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1925  solute-binding family 1 protein  46.67 
 
 		 250 aa  206  4e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0781  amino-acid ABC transporter extracellular-binding protein yckK  41.92 
 
 		 252 aa  206  5e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1758  hook assembly protein, flagella  47.56 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000345404  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1924  glutamine-binding periplasmic protein/glutamine transport system permease protein  41.22 
 
 		 259 aa  199  6e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0207  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  41.32 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.670956  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1926  solute-binding family 1 protein  45.33 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0212  amino acid ABC transporter, substrate-binding  42.62 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  42.86 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  39.35 
 
 		 285 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  42.28 
 
 		 264 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  39.35 
 
 		 266 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  42.32 
 
 		 264 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  41.91 
 
 		 264 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  39.77 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  41.91 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  40.36 
 
 		 268 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  40.65 
 
 		 265 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  38.99 
 
 		 266 aa  176  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  38.41 
 
 		 266 aa  176  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  41.49 
 
 		 264 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  38.99 
 
 		 285 aa  175  6e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  38.63 
 
 		 266 aa  175  9e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  43.8 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  38.63 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.33 
 
 		 264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  39.53 
 
 		 265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  39.62 
 
 		 266 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  41.18 
 
 		 266 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  41.35 
 
 		 266 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  40.6 
 
 		 264 aa  171  9e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  39.23 
 
 		 266 aa  171  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  41.18 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  41.18 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1254  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.17 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 270 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1824  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.17 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0726824  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1977  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.17 
 
 		 284 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1808  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.17 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.655664  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1737  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.17 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.084035  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0767  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.17 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0133342  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0395  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.17 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364587  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  40.41 
 
 		 270 aa  169  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  40.24 
 
 		 265 aa  168  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  40.6 
 
 		 264 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  38.46 
 
 		 266 aa  168  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  38.46 
 
 		 266 aa  168  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  38.46 
 
 		 266 aa  168  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  40.34 
 
 		 266 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  40.6 
 
 		 264 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  41.1 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1553  extracellular solute-binding protein  40.17 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4695  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  40.17 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344661  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  40.08 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  40.08 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  41.1 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>