250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2337 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2337  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
500 aa  1016    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00797389  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3178  S-layer domain-containing protein  48.62 
 
 
1518 aa  302  1e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  unclonable  0.0033347  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3165  Allergen V5/Tpx-1 family protein  62.32 
 
 
568 aa  264  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.845212  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1243  heme peroxidase  57.14 
 
 
1625 aa  264  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.941188  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3166  Allergen V5/Tpx-1 family protein  67.93 
 
 
461 aa  261  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3167  S-layer domain-containing protein  67.2 
 
 
637 aa  261  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3169  S-layer domain-containing protein  62.43 
 
 
533 aa  258  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1230  polysaccharide deacetylase  50.88 
 
 
482 aa  246  6e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  61.17 
 
 
1129 aa  246  6e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3184  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  57.73 
 
 
1687 aa  246  9e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3554  polysaccharide deacetylase  52.89 
 
 
630 aa  245  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1231  polysaccharide deacetylase  51.33 
 
 
630 aa  243  6e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.534738  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3555  polysaccharide deacetylase  44.21 
 
 
487 aa  229  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1227  polysaccharide deacetylase  41.7 
 
 
657 aa  199  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0615  polysaccharide deacetylase  41.92 
 
 
843 aa  188  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00286732 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4145  S-layer domain-containing protein  47.42 
 
 
601 aa  177  6e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4171  LGFP repeat protein  47.69 
 
 
617 aa  176  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0880  polysaccharide deacetylase  34.8 
 
 
271 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1639  polysaccharide deacetylase domain protein  35.68 
 
 
269 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 
598 aa  97.4  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3339  polysaccharide deacetylase  35.26 
 
 
434 aa  80.9  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  34.38 
 
 
270 aa  76.6  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3874  polysaccharide deacetylase  33.96 
 
 
281 aa  71.2  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1454  polysaccharide deacetylase  36.89 
 
 
201 aa  69.3  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0891104  hitchhiker  0.0000678514 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.82 
 
 
1029 aa  68.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  35.43 
 
 
321 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  32.82 
 
 
322 aa  69.3  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2795  polysaccharide deacetylase  27.96 
 
 
600 aa  67.8  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0146758 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3200  polysaccharide deacetylase  31.44 
 
 
594 aa  67.8  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000473135  hitchhiker  0.00151321 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2794  polysaccharide deacetylase  31.4 
 
 
597 aa  67  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0412434 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0390  polysaccharide deacetylase  27.23 
 
 
294 aa  65.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1431  S-layer domain-containing protein  32.14 
 
 
458 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0853  polysaccharide deacetylase  36.09 
 
 
318 aa  64.7  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000296204  normal  0.358313 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0077  S-layer protein  31.58 
 
 
697 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0803176  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  31.05 
 
 
1131 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  31.05 
 
 
1131 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  33.79 
 
 
333 aa  63.5  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2320  polysaccharide deacetylase  33.87 
 
 
313 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1050  S-layer protein  28.76 
 
 
218 aa  63.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76784  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  31.93 
 
 
273 aa  63.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1130  S-layer protein  28.76 
 
 
218 aa  63.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0431486  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0146  polysaccharide deacetylase  28.33 
 
 
266 aa  63.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1208  putative S-layer protein  28.76 
 
 
218 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.447852 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  31.03 
 
 
319 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4533  S-layer protein  30.48 
 
 
257 aa  62  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4550  S-layer protein  29.41 
 
 
276 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4632  Excalibur domain-containing protein  30.27 
 
 
266 aa  61.6  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0234  S-layer protein  30.32 
 
 
241 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1028  S-layer protein  27.88 
 
 
220 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.317814  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1030  S-layer domain-containing protein  28.51 
 
 
218 aa  61.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1031  S-layer domain-containing protein  28.72 
 
 
225 aa  60.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354589  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1228  polysaccharide deacetylase  34.71 
 
 
327 aa  60.1  0.00000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1285  putative S-layer protein  25.64 
 
 
219 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0266369  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  31.21 
 
 
282 aa  60.1  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0673  polysaccharide deacetylase  37.4 
 
 
249 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.250144  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1227  S-layer protein, putative  25.64 
 
 
219 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1890  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.47 
 
 
470 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00294488  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  32.2 
 
 
316 aa  58.9  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
258 aa  58.9  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 
645 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  28.24 
 
 
255 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0924  polysaccharide deacetylase  32.56 
 
 
173 aa  58.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 
542 aa  58.2  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  27.33 
 
 
271 aa  57.8  0.0000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  32.14 
 
 
283 aa  57.4  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3425  S-layer protein  25.65 
 
 
510 aa  57  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3695  s-layer protein  25.65 
 
 
510 aa  57  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2644  cell wall/surface repeat protein  27.73 
 
 
2178 aa  57  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.615501  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  31.61 
 
 
264 aa  56.6  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1863  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 4  28.72 
 
 
459 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27744e-53 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  29.44 
 
 
461 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  32.2 
 
 
306 aa  56.6  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4918  putative S-layer protein  27.66 
 
 
272 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  29.9 
 
 
461 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3337  S-layer protein  27.36 
 
 
492 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3667  putative S-layer protein  26.48 
 
 
502 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.290497  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  26.54 
 
 
251 aa  55.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  31.36 
 
 
306 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0658  xylanase/chitin deacetylase-like protein  32.08 
 
 
221 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1043  hypothetical protein  25.48 
 
 
754 aa  55.5  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0065  polysaccharide deacetylase  32.79 
 
 
365 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00184975  hitchhiker  0.0058603 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4952  S-layer protein, putative  28.26 
 
 
272 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0818  hypothetical protein  30.11 
 
 
717 aa  55.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3386  S-layer protein  27.36 
 
 
510 aa  55.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.903804  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3645  putative S-layer protein  27.36 
 
 
492 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  34.29 
 
 
1118 aa  54.7  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1939  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 4  29.59 
 
 
470 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000781755  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2876  polysaccharide deacetylase  26.7 
 
 
257 aa  55.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3076  polysaccharide deacetylase  39.77 
 
 
258 aa  54.7  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4937  putative S-layer protein  28.26 
 
 
272 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1683  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.72 
 
 
459 aa  54.7  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00306779  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1818  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.72 
 
 
459 aa  54.7  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000545238  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4159  S-layer domain protein  28.65 
 
 
220 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.767768  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1659  polysaccharide deacetylase  35.2 
 
 
429 aa  54.3  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.243324  normal  0.117174 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  27.56 
 
 
262 aa  54.3  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  29.38 
 
 
461 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  29.38 
 
 
461 aa  53.9  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  29.38 
 
 
461 aa  53.9  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 
289 aa  53.9  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  26.14 
 
 
261 aa  53.9  0.000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>