216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2323 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2323  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  503  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059756  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2049  protein of unknown function DUF159  74.09 
 
 
247 aa  369  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012263 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10600  hypothetical protein  52.01 
 
 
283 aa  228  6e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0546903  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4324  hypothetical protein  50 
 
 
252 aa  224  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  48.08 
 
 
253 aa  214  7e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4181  protein of unknown function DUF159  48.32 
 
 
231 aa  206  4e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  46.3 
 
 
253 aa  205  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1044  protein of unknown function DUF159  43.89 
 
 
251 aa  195  5.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2820  protein of unknown function DUF159  42.01 
 
 
256 aa  192  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107889  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0536  hypothetical protein  43.08 
 
 
250 aa  192  5e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.932733  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3478  protein of unknown function DUF159  48.4 
 
 
236 aa  187  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  41.76 
 
 
268 aa  181  9.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  40.15 
 
 
261 aa  180  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1704  hypothetical protein  42.58 
 
 
253 aa  180  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0118518  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1024  protein of unknown function DUF159  41.98 
 
 
253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1903  protein of unknown function DUF159  42.29 
 
 
252 aa  179  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  43.67 
 
 
223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25410  hypothetical protein  44.32 
 
 
261 aa  171  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0698226  normal  0.491918 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7889  protein of unknown function DUF159  42.31 
 
 
253 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.451082 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  40.65 
 
 
259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  40.39 
 
 
253 aa  166  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  41.8 
 
 
259 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  41.53 
 
 
257 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  38.21 
 
 
224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  38.41 
 
 
281 aa  163  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  40.49 
 
 
226 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  40.96 
 
 
226 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4193  protein of unknown function DUF159  42.8 
 
 
248 aa  159  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.772557  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  40 
 
 
239 aa  158  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  35.66 
 
 
233 aa  158  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  38.52 
 
 
233 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  37.8 
 
 
238 aa  157  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18820  hypothetical protein  37.87 
 
 
274 aa  157  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0853  protein of unknown function DUF159  40.91 
 
 
270 aa  157  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000182403  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  38.17 
 
 
248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  39.34 
 
 
235 aa  155  7e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  34.43 
 
 
234 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1254  hypothetical protein  37.18 
 
 
338 aa  152  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0999798 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  38.67 
 
 
252 aa  152  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20440  hypothetical protein  36.51 
 
 
248 aa  152  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00702652  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  38.11 
 
 
221 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  40.89 
 
 
222 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  36.94 
 
 
262 aa  151  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3704  protein of unknown function DUF159  37.89 
 
 
283 aa  149  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0546  hypothetical protein  36.77 
 
 
285 aa  149  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  42.04 
 
 
222 aa  149  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  40.49 
 
 
257 aa  148  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  41.04 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  38.11 
 
 
242 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  36.89 
 
 
239 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  34.69 
 
 
222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2598  protein of unknown function DUF159  37.55 
 
 
290 aa  146  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.107736 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  40.28 
 
 
221 aa  146  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  38.37 
 
 
221 aa  146  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  36.89 
 
 
254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  39.44 
 
 
243 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  38.17 
 
 
219 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  36.89 
 
 
224 aa  144  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  36.59 
 
 
232 aa  143  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  38.4 
 
 
227 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  33.2 
 
 
227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1100  protein of unknown function DUF159  38.82 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  34.44 
 
 
268 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  36.84 
 
 
252 aa  138  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  36 
 
 
222 aa  137  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2201  hypothetical protein  36.14 
 
 
337 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  36.99 
 
 
224 aa  135  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  31.43 
 
 
222 aa  135  8e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  35.45 
 
 
261 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3713  hypothetical protein  36.25 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  34.43 
 
 
266 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  34.43 
 
 
266 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  31.43 
 
 
222 aa  132  6e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  31.43 
 
 
222 aa  132  6e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0095  protein of unknown function DUF159  35.92 
 
 
250 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3527  protein of unknown function DUF159  36.84 
 
 
255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  35.85 
 
 
252 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  36.95 
 
 
243 aa  129  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  35.32 
 
 
244 aa  129  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  36.21 
 
 
243 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  34.39 
 
 
254 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  33.33 
 
 
231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3110  hypothetical protein  33.61 
 
 
240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11099  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  36.55 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  32.42 
 
 
240 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  32.78 
 
 
222 aa  124  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0673  hypothetical protein  34.54 
 
 
259 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  29.72 
 
 
232 aa  124  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2022  hypothetical protein  32.92 
 
 
252 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00187393  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  36.73 
 
 
254 aa  122  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  35.51 
 
 
241 aa  122  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  32.67 
 
 
233 aa  122  6e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1171  protein of unknown function DUF159  32.94 
 
 
254 aa  121  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1211  protein of unknown function DUF159  36.05 
 
 
265 aa  120  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.074414 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  34.77 
 
 
231 aa  119  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2613  hypothetical protein  34.54 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1467  hypothetical protein  30.95 
 
 
251 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2383  hypothetical protein  40.32 
 
 
204 aa  116  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  0.518006 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0711  hypothetical protein  33.87 
 
 
256 aa  116  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.590948 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  35.65 
 
 
234 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>