More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2289 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2289  major facilitator transporter  100 
 
 		 458 aa  913    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21518  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3484  major facilitator transporter  64.17 
 
 		 468 aa  540  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8642  major facilitator superfamily MFS_1  49.76 
 
 		 453 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5092  major facilitator superfamily MFS_1  48.05 
 
 		 493 aa  414  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0117  major facilitator superfamily MFS_1  48.92 
 
 		 444 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4082  major facilitator transporter  47.82 
 
 		 439 aa  402  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3858  major facilitator superfamily MFS_1  47.5 
 
 		 439 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2329  major facilitator superfamily MFS_1  46.47 
 
 		 452 aa  389  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126091  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3499  major facilitator transporter  48.28 
 
 		 442 aa  381  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5790  major facilitator superfamily MFS_1  44.44 
 
 		 477 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.339463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  44.19 
 
 		 450 aa  356  5e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5797  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 477 aa  346  4e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2248  major facilitator superfamily MFS_1  43.05 
 
 		 463 aa  346  5e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.169754  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4303  major facilitator superfamily MFS_1  40.18 
 
 		 461 aa  344  2e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.625349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4413  major facilitator superfamily MFS_1  40.18 
 
 		 461 aa  344  2e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.906196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4438  major facilitator transporter  40.75 
 
 		 464 aa  340  4e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357208  normal  0.925745 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0634  major facilitator transporter  41.74 
 
 		 461 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4754  major facilitator transporter  40.42 
 
 		 467 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6411  major facilitator transporter  38.6 
 
 		 461 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0121  major facilitator superfamily MFS_1  39.68 
 
 		 468 aa  333  3e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0299314  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2553  major facilitator family transporter  38.97 
 
 		 457 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0427116  decreased coverage  0.00798136 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2224  major facilitator transporter  39.2 
 
 		 457 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0671964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3363  major facilitator transporter  39.25 
 
 		 457 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124155  normal  0.451531 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3319  major facilitator superfamily MFS_1  38.83 
 
 		 469 aa  330  4e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3162  major facilitator transporter  38.73 
 
 		 457 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.688084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0190  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  40.19 
 
 		 459 aa  328  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5800  major facilitator superfamily MFS_1  42.12 
 
 		 477 aa  324  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000483558  normal  0.391929 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5816  major facilitator superfamily MFS_1  38.95 
 
 		 468 aa  322  7e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.349561 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  40 
 
 		 430 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  43.3 
 
 		 439 aa  300  4e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2371  major facilitator transporter  40.84 
 
 		 406 aa  300  4e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.363547  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  40.88 
 
 		 446 aa  298  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  39.07 
 
 		 443 aa  295  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  40.33 
 
 		 447 aa  293  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  39.81 
 
 		 450 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0102  major facilitator superfamily MFS_1  39 
 
 		 456 aa  286  5e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  36.95 
 
 		 438 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  42.36 
 
 		 461 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  36.95 
 
 		 438 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  36.72 
 
 		 438 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  36.72 
 
 		 438 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  36.95 
 
 		 438 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  36.72 
 
 		 438 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  41.05 
 
 		 438 aa  283  6.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  36.72 
 
 		 438 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  36.72 
 
 		 438 aa  280  3e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  40.53 
 
 		 465 aa  280  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  37.64 
 
 		 437 aa  280  4e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  39.13 
 
 		 437 aa  279  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  39.14 
 
 		 461 aa  279  9e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  38.27 
 
 		 439 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  39.02 
 
 		 435 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  39.02 
 
 		 435 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  39.02 
 
 		 435 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  39.01 
 
 		 435 aa  276  8e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  38.52 
 
 		 439 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  39 
 
 		 437 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4108  major facilitator family transporter  40.62 
 
 		 449 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.073539  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  38.52 
 
 		 439 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4135  general substrate transporter  40.62 
 
 		 449 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  38.52 
 
 		 439 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  39.32 
 
 		 439 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  37.55 
 
 		 457 aa  274  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  39.32 
 
 		 439 aa  274  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  35.68 
 
 		 468 aa  273  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  38.07 
 
 		 457 aa  273  6e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  38.07 
 
 		 457 aa  273  6e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  39.77 
 
 		 451 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  42.22 
 
 		 432 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  38.02 
 
 		 439 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  42.22 
 
 		 432 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  42.22 
 
 		 432 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  38.66 
 
 		 437 aa  271  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  38.17 
 
 		 434 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  39.48 
 
 		 433 aa  270  4e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  37.44 
 
 		 433 aa  270  5e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  39.29 
 
 		 435 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  38.66 
 
 		 456 aa  269  8e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  38.32 
 
 		 461 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  36.17 
 
 		 465 aa  268  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0365  major facilitator transporter  36.83 
 
 		 441 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  40.28 
 
 		 440 aa  268  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  39.04 
 
 		 435 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  38.32 
 
 		 461 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  38.32 
 
 		 461 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  39.04 
 
 		 435 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  40.62 
 
 		 430 aa  269  1e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.27 
 
 		 437 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  38.15 
 
 		 437 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  35.76 
 
 		 459 aa  268  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  38.03 
 
 		 435 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  38.03 
 
 		 435 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  38.19 
 
 		 442 aa  268  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  39.22 
 
 		 441 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1346  major facilitator superfamily MFS_1  38.64 
 
 		 472 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63119  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  38.41 
 
 		 439 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  39.29 
 
 		 438 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  38.39 
 
 		 435 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1782  major facilitator superfamily MFS_1  40.35 
 
 		 457 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3082  major facilitator transporter  37.21 
 
 		 441 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>