210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2251 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2251  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 
320 aa  646    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0678126  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1988  transcriptional regulator, DeoR family  90.62 
 
 
324 aa  591  1e-168  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000190118 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0561  transcriptional regulator, DeoR family  52.23 
 
 
322 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06830  transcriptional regulator  52.58 
 
 
320 aa  325  6e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0488  transcriptional regulator, DeoR family  47.44 
 
 
317 aa  296  3e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150286  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3288  transcriptional regulator, DeoR family  49.34 
 
 
324 aa  285  1.0000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.112061  normal  0.0190392 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1869  transcriptional regulator, DeoR family  44.23 
 
 
335 aa  266  4e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.273722  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2524  DeoR family transcriptional regulator  46.91 
 
 
357 aa  256  4e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29950  transcriptional regulator with sigma factor-related N-terminal domain  44.03 
 
 
319 aa  246  3e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1750  DeoR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
315 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00345901  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1894  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  32.92 
 
 
315 aa  179  8e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1702  deoxyribonucleoside regulator  32.92 
 
 
315 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000147991  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1468  DeoR family transcriptional regulator  32.6 
 
 
315 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010557  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1753  deoxyribonucleoside regulator DeoR  32.6 
 
 
315 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000750924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1731  deoxyribonucleoside regulator  32.6 
 
 
315 aa  176  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000228989  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1891  deoxyribonucleoside regulator DeoR  32.6 
 
 
315 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1926  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  32.6 
 
 
315 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.60106e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2001  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  32.6 
 
 
316 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000544844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3452  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  32.29 
 
 
315 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00224195  hitchhiker  1.06699e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1974  deoxyribonucleoside regulator DeoR, putative  32.5 
 
 
315 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00373249  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0115  DeoR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
310 aa  158  1e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156303  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1034  transcriptional regulator, DeoR family  27.07 
 
 
315 aa  142  9e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000316866  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0686  transcriptional regulator, DeoR family  32.4 
 
 
317 aa  135  8e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000719741  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2050  transcriptional regulator, DeoR family  32.29 
 
 
323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1126  DeoR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
307 aa  126  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3767  transcriptional regulator, DeoR family  25.89 
 
 
321 aa  120  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1071  transcriptional regulator, DeoR family  24.12 
 
 
308 aa  116  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0743327  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2685  DeoR family transcriptional regulator  30.16 
 
 
317 aa  116  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2030  transcriptional regulator, DeoR family  28.48 
 
 
316 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130685  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2252  transcriptional regulator, DeoR family  28.39 
 
 
316 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.345657  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3725  transcriptional regulator, DeoR family  28.52 
 
 
310 aa  112  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000852212  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0532  transcriptional regulator  28.62 
 
 
324 aa  106  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0327  transcriptional regulator, putative  28.13 
 
 
327 aa  104  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3849  transcriptional regulator  29.6 
 
 
325 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1190  DeoR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
326 aa  103  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11475  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2790  DeoR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
306 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2834  DeoR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
306 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2817  DeoR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
306 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0275474  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3224  putative transcription regulator  26.6 
 
 
338 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739516  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02313  putative transcriptional regulator  26.13 
 
 
318 aa  104  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00764074  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3426  transcriptional regulator, DeoR family  32.15 
 
 
336 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000128102  hitchhiker  0.000369774 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2797  transcriptional regulator, DeoR family  30.43 
 
 
315 aa  102  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314114  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2312  sugar-binding domain-containing protein  27.3 
 
 
333 aa  102  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2414  DeoR family transcriptional regulator  27.3 
 
 
333 aa  102  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.415693  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1069  transcriptional regulator, DeoR family  24.92 
 
 
316 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000512012  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2702  DeoR family transcriptional regulator  27.9 
 
 
341 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1726  DeoR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
317 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0090  operon regulator SmoC  28.3 
 
 
317 aa  99.8  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0568695  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4524  sorbitol operon regulator SorC  24.6 
 
 
315 aa  99.8  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3519  Crp/Fnr family sugar-binding transcriptional regulatory  25.89 
 
 
306 aa  99.8  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4482  sorbitol operon regulator SorC  24.6 
 
 
315 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.543234 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3705  transcriptional regulator, DeoR family  26.58 
 
 
328 aa  99.4  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3649  DeoR family transcriptional regulator  25.89 
 
 
331 aa  99.4  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0417  citrate lyase regulator  25.5 
 
 
319 aa  99  8e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0867  erythritol transcriptional regulator  26.1 
 
 
316 aa  97.8  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4358  DeoR family transcriptional regulator  29.11 
 
 
339 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4444  DeoR family transcriptional regulator  29.11 
 
 
339 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0599387 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1680  DeoR family transcriptional regulator  27.65 
 
 
317 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.388051  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5499  sorbitol operon regulator SorC  24.27 
 
 
315 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3131  DeoR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
316 aa  97.1  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4738  DeoR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
339 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1816  putative sugar-binding protein  26.28 
 
 
339 aa  95.9  8e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129993  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1790  PTS system, mannitol-specific IIBC component  26.28 
 
 
339 aa  95.9  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0814  putative sugar-binding protein  26.28 
 
 
339 aa  95.9  8e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1105  putative sugar-binding protein  26.28 
 
 
339 aa  95.9  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2078  putative sugar-binding protein  26.28 
 
 
339 aa  95.9  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4114  DeoR family transcriptional regulator  25.82 
 
 
339 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0453  DNA-binding protein  26.28 
 
 
339 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0358  putative transcriptional regulator  26.28 
 
 
339 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217611  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2165  DeoR family transcriptional regulator  25.32 
 
 
345 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03820  transcriptional regulator with sigma factor-related N-terminal domain  27.24 
 
 
318 aa  94.7  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  28.34 
 
 
700 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2232  DeoR family transcriptional regulator  26.98 
 
 
339 aa  95.1  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2908  DeoR family transcriptional regulator  26.1 
 
 
316 aa  94.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2395  transcriptional regulator, putative  26.77 
 
 
317 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129773  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1990  transcriptional regulator, DeoR family  22.33 
 
 
319 aa  94  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.356638  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4059  DeoR family transcriptional regulator  26.38 
 
 
326 aa  93.6  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.810419  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2088  transcriptional regulator, DeoR family  29.32 
 
 
315 aa  93.6  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1339  DeoR family transcriptional regulator  25.49 
 
 
363 aa  93.2  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3537  DeoR family transcriptional regulator  26.05 
 
 
323 aa  93.2  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0455  HTH-type transcriptional regulator  25 
 
 
326 aa  92.8  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1160  citrate lyase regulator, putative  21.17 
 
 
321 aa  92.8  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152534  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4103  transcriptional regulator, DeoR family  24.19 
 
 
313 aa  92.4  9e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000227341  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1366  DeoR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
322 aa  91.3  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1713  transcriptional repressor LsrR  24.44 
 
 
317 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1594  transcriptional repressor LsrR  24.44 
 
 
317 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2146  DeoR family transcriptional regulator  24.44 
 
 
317 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2125  transcriptional repressor LsrR  24.44 
 
 
317 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2010  DeoR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
342 aa  90.5  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4174  DeoR family transcriptional regulator  26.2 
 
 
310 aa  90.5  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3776  DeoR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
313 aa  90.1  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5326  transcriptional regulator, DeoR family  25.48 
 
 
311 aa  89.7  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.625003 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3737  transcriptional regulator, DeoR family  26.73 
 
 
325 aa  89.4  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4578  DeoR family transcriptional regulator  25.51 
 
 
318 aa  89.4  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.684282  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2134  transcriptional regulator, DeoR family  24.12 
 
 
317 aa  89  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10334  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  26.37 
 
 
694 aa  89  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0087  transcriptional regulator  26.01 
 
 
326 aa  87.8  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.284033  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0255  DeoR family transcriptional regulator  25.7 
 
 
320 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.991369  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2041  DeoR family transcriptional regulator  24.83 
 
 
333 aa  87.8  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3018  deoxyribonucleoside regulator  24.27 
 
 
315 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>