More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2229 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2229  GTP-binding protein Era  100 
 
 
318 aa  635    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00352178  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1966  GTP-binding protein Era  92.48 
 
 
319 aa  588  1e-167  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000219392 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13500  GTP-binding protein Era  72.64 
 
 
314 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2203  GTP-binding protein Era  72.58 
 
 
306 aa  438  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.00609862 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2185  GTP-binding protein Era  73.08 
 
 
319 aa  434  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646134  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2116  GTP-binding protein Era  72.55 
 
 
310 aa  432  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7045  GTP-binding protein Era  69.74 
 
 
375 aa  428  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1254  GTP-binding protein Era  67.97 
 
 
298 aa  424  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3243  GTP-binding protein Era  69.93 
 
 
311 aa  422  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0404456  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1271  GTP-binding protein Era  69.61 
 
 
307 aa  422  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12310  GTP-binding protein Era  70.51 
 
 
321 aa  419  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1752  GTP-binding protein Era  69.71 
 
 
312 aa  416  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2710  GTP-binding protein Era  69.51 
 
 
304 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.521075  normal  0.585399 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3384  GTP-binding protein Era  69.97 
 
 
308 aa  414  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.731226  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11760  GTP-binding protein Era  66.12 
 
 
310 aa  410  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.28121  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3828  GTP-binding protein Era  68.52 
 
 
305 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13620  GTP-binding protein Era  65.46 
 
 
300 aa  405  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.475105  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1543  GTP-binding protein Era  67.64 
 
 
314 aa  405  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0711  GTP-binding protein Era  66.23 
 
 
322 aa  403  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0848  GTP-binding protein Era  64.92 
 
 
315 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319285  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1162  GTP-binding protein Era  65.13 
 
 
303 aa  395  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111162  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2303  GTP-binding protein Era  65.46 
 
 
306 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3828  GTP-binding protein Era  63.82 
 
 
300 aa  389  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1919  GTP-binding protein Era  66.45 
 
 
313 aa  389  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247131  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3449  GTP-binding protein Era  63.82 
 
 
299 aa  389  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0196733 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3463  GTP-binding protein Era  65.57 
 
 
299 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.720109  normal  0.032958 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3452  GTP-binding protein Era  65.9 
 
 
299 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00911502  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3515  GTP-binding protein Era  65.9 
 
 
299 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3155  GTP-binding protein Era  64.59 
 
 
302 aa  383  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0422741  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0793  GTP-binding protein Era  63.16 
 
 
297 aa  375  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.998663  normal  0.0560127 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12390  GTP-binding protein Era  64.38 
 
 
300 aa  372  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196376  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2758  GTP-binding protein Era  63.23 
 
 
318 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0588408  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4623  GTP-binding protein Era  59.54 
 
 
298 aa  365  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236944  hitchhiker  0.0010995 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17220  GTP-binding protein Era  59.38 
 
 
313 aa  346  3e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00402768  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1662  GTP-binding protein Era  54.1 
 
 
305 aa  308  9e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.438796  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1580  GTP-binding protein Era  58.06 
 
 
272 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.116629  normal  0.081764 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0861  GTP-binding protein Era  49.54 
 
 
353 aa  288  6e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0593  GTP-binding protein Era  48.14 
 
 
354 aa  280  2e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  44.92 
 
 
302 aa  260  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12970  GTP-binding protein Era  45.39 
 
 
301 aa  260  2e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.141984 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  44.03 
 
 
308 aa  258  8e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  45.07 
 
 
307 aa  255  7e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  44.74 
 
 
300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  41.58 
 
 
299 aa  250  2e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  41.58 
 
 
299 aa  249  6e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  41.58 
 
 
299 aa  249  6e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  42.95 
 
 
301 aa  247  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  42.95 
 
 
301 aa  247  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  42.95 
 
 
301 aa  247  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  42.95 
 
 
301 aa  247  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  42.95 
 
 
301 aa  247  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  42.62 
 
 
301 aa  245  6e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  42.62 
 
 
301 aa  245  6e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  42.62 
 
 
301 aa  243  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  42.62 
 
 
301 aa  243  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  43.41 
 
 
301 aa  243  3.9999999999999997e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  41.97 
 
 
301 aa  243  5e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  43.93 
 
 
302 aa  242  7e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  43.28 
 
 
298 aa  240  2.9999999999999997e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  40.98 
 
 
301 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  40.52 
 
 
302 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  42.95 
 
 
302 aa  235  9e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1506  GTP-binding protein Era  43.18 
 
 
301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.094805  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  44.74 
 
 
300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07630  GTP-binding protein Era  40.38 
 
 
315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.718236 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  40.46 
 
 
303 aa  232  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  40.13 
 
 
299 aa  232  5e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  40.52 
 
 
297 aa  231  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  39.8 
 
 
305 aa  231  2e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  40.79 
 
 
303 aa  229  4e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  39.47 
 
 
299 aa  228  9e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  40.66 
 
 
293 aa  226  4e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  38.69 
 
 
298 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  36.79 
 
 
303 aa  225  6e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  41.12 
 
 
303 aa  225  6e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  41.45 
 
 
297 aa  225  9e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  40.13 
 
 
297 aa  222  6e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  36.39 
 
 
294 aa  222  8e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  40.79 
 
 
299 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  39.38 
 
 
301 aa  218  1e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0134  GTP-binding protein Era  39.8 
 
 
299 aa  218  2e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  39.14 
 
 
298 aa  216  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0160  GTP-binding protein Era  40.66 
 
 
311 aa  216  5e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.709103  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  39.87 
 
 
305 aa  215  7e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0791  GTP-binding protein Era  38.36 
 
 
312 aa  215  9e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000010193  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  38.24 
 
 
300 aa  215  9e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2851  GTP-binding protein Era  45.21 
 
 
300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  36.18 
 
 
296 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19471  GTP-binding protein Era  41.88 
 
 
343 aa  212  7e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  35.86 
 
 
296 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  41.64 
 
 
301 aa  209  7e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3235  GTP-binding protein Era  40.73 
 
 
489 aa  207  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00276402  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  35.2 
 
 
303 aa  206  5e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13281  GTP-binding protein Era-like protein  37.79 
 
 
314 aa  205  7e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.593826 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  39.47 
 
 
311 aa  205  8e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  38.49 
 
 
296 aa  205  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  39.59 
 
 
299 aa  204  2e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  39.67 
 
 
468 aa  202  7e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1511  GTP-binding protein Era  40.39 
 
 
319 aa  202  7e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  41.83 
 
 
451 aa  202  8e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>