44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2177 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2177  20S proteasome, A and B subunits  100 
 
 		 235 aa  475  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0017271  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1920  20S proteasome A and B subunits  80.51 
 
 		 236 aa  386  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000592834 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1874  20S proteasome A and B subunits  62.44 
 
 		 237 aa  267  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20860  20S proteasome subunit (alpha or beta)  62.2 
 
 		 255 aa  265  4e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1489  20S proteasome A and B subunits  61.86 
 
 		 244 aa  261  6.999999999999999e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2646  20S proteasome, A and B subunits  57.87 
 
 		 255 aa  255  3e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.786174  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2312  20S proteasome A and B subunits  56.77 
 
 		 228 aa  255  5e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000534674  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1789  putative 20S proteasome alpha-subunit  53.88 
 
 		 249 aa  252  3e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234866  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4460  20S proteasome A and B subunits  54.58 
 
 		 265 aa  252  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190123  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22020  20S proteasome subunit (alpha or beta)  51.87 
 
 		 255 aa  251  6e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0199133  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2000  20S proteasome A and B subunits  63.16 
 
 		 244 aa  248  6e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.184278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2683  20S proteasome A and B subunits  55.61 
 
 		 287 aa  239  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4878  20S proteasome A and B subunits  52.59 
 
 		 239 aa  239  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2362  20S proteasome A and B subunits  51.49 
 
 		 273 aa  238  5e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.674548  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2626  20S proteasome, A and B subunits  52.34 
 
 		 238 aa  238  5.999999999999999e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2245  20S proteasome, A and B subunits  52.65 
 
 		 260 aa  237  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.916002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5870  20S proteasome alpha and beta subunits-like protein  54.82 
 
 		 257 aa  236  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1205  20S proteasome A and B subunits  54.03 
 
 		 236 aa  235  5.0000000000000005e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114404  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1831  20S proteasome subunits AB  51.71 
 
 		 276 aa  235  6e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2242  20S proteasome A and B subunits  53.77 
 
 		 263 aa  233  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00166177  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1189  20S proteasome, A and B subunits  56.19 
 
 		 234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.431495  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1496  20S proteasome A and B subunits  52.17 
 
 		 251 aa  233  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213534 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3448  20S proteasome, A and B subunits  48.74 
 
 		 254 aa  233  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0911  20S proteasome A and B subunits  52.61 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0394766  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2427  20S proteasome A and B subunits  54.08 
 
 		 292 aa  226  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0676783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3129  20S proteasome, A and B subunits  47.9 
 
 		 250 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3190  20S proteasome, A and B subunits  47.9 
 
 		 250 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617763  normal  0.125579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3140  20S proteasome, A and B subunits  47.9 
 
 		 250 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2968  20S proteasome A and B subunits  49.58 
 
 		 269 aa  226  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000852426  normal  0.0112001 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12141  proteasome alpha subunit prcA  48.12 
 
 		 248 aa  226  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000936858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2160  20S proteasome A and B subunits  51.01 
 
 		 242 aa  223  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3078  20S proteasome, A and B subunits  47.48 
 
 		 251 aa  221  8e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.136631 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2464  20S proteasome A and B subunits  52.78 
 
 		 262 aa  218  5e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130665  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2237  protein of unknown function DUF245 domain protein  69.03 
 
 		 690 aa  218  6e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.195166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  25.54 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  26.43 
 
 		 249 aa  48.5  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  26.05 
 
 		 248 aa  46.2  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  25.11 
 
 		 251 aa  46.2  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  26.32 
 
 		 247 aa  46.2  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  23.71 
 
 		 241 aa  44.3  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  22.41 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  24.74 
 
 		 245 aa  43.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  24.48 
 
 		 271 aa  42.7  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  25.12 
 
 		 256 aa  41.6  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>