93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2172 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1915  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  92.11 
 
 		 354 aa  652    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000210354 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2172  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  100 
 
 		 355 aa  717    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00868355  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20910  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  69.81 
 
 		 349 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2005  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  69.57 
 
 		 349 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.398115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1484  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  67.81 
 
 		 334 aa  437  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1200  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  68.89 
 
 		 341 aa  433  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0440767  normal  0.457596 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11850  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  67.52 
 
 		 354 aa  433  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00898867  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1857  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  68.42 
 
 		 363 aa  416  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2243  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  68.63 
 
 		 342 aa  405  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.834026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2416  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  67.47 
 
 		 330 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13950  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  61.08 
 
 		 363 aa  400  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.846433 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16210  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  58.28 
 
 		 359 aa  387  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0743414  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1485  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  62.54 
 
 		 354 aa  372  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.130209  normal  0.405795 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2632  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  61.13 
 
 		 344 aa  364  1e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.310153  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4474  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  62.09 
 
 		 294 aa  360  2e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.135344 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2355  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  62.46 
 
 		 326 aa  359  4e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.805289  normal  0.143216 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2306  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  63.77 
 
 		 305 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00564306  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5892  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  62.31 
 
 		 289 aa  351  8.999999999999999e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0406172 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1810  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  58.54 
 
 		 298 aa  347  1e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4884  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  62.15 
 
 		 358 aa  348  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.340373  normal  0.205134 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1839  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  59.86 
 
 		 296 aa  345  8e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.865717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2238  hypothetical protein  62.77 
 
 		 318 aa  344  1e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2638  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  56.25 
 
 		 316 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.427664  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2228  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  59.27 
 
 		 275 aa  325  7e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2152  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  59.64 
 
 		 275 aa  316  3e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.644059  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2677  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  58.18 
 
 		 296 aa  315  9.999999999999999e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390254  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2457  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  59.27 
 
 		 276 aa  313  2.9999999999999996e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22120  tRNA (adenine-58-N(1)-) methyltransferase  58.11 
 
 		 273 aa  306  2.0000000000000002e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3462  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  58.33 
 
 		 275 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1182  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  57.31 
 
 		 293 aa  301  9e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0707578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3065  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  56.83 
 
 		 288 aa  301  1e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0788326 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12150  RNA methyltransferase  58.33 
 
 		 280 aa  298  1e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3148  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  56.73 
 
 		 284 aa  295  8e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215916  normal  0.672211 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3136  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  56.73 
 
 		 284 aa  295  8e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3198  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  56.73 
 
 		 284 aa  295  8e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594401  normal  0.149021 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0540  tRNA(1-methyladenosine) methyltransferase  41.57 
 
 		 356 aa  260  3e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0936  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  40.91 
 
 		 383 aa  259  5.0000000000000005e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1601  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  43.88 
 
 		 284 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1587  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  40.54 
 
 		 263 aa  208  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1481  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  39.77 
 
 		 286 aa  170  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000220785  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2514  SAM-dependent methyltransferase  34.72 
 
 		 303 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0905  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  38.04 
 
 		 296 aa  159  6e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.56455  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2376  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  35.77 
 
 		 277 aa  150  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0645  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  34.63 
 
 		 266 aa  146  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1129  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  31.94 
 
 		 281 aa  145  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1692  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  35.11 
 
 		 282 aa  144  3e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3348  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  32.68 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0225  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  32.22 
 
 		 263 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000107997  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0179  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  31.27 
 
 		 262 aa  136  5e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.160214  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0459  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  31.89 
 
 		 277 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0181  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  30.89 
 
 		 262 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.780552  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0539  protein-L-isoaspartate methyltransferase-like  31.37 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000466201  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0467  methyltransferase type 11  35.02 
 
 		 255 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0069  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  32.2 
 
 		 253 aa  129  7.000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2231  tRNA (adenine-57, 58-N(1)-) methyltransferase  33.86 
 
 		 253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000396256 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1367  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  33.72 
 
 		 254 aa  127  3e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0209  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  34.63 
 
 		 237 aa  122  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0923  beta-aspartate methyltransferase  33.07 
 
 		 254 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0429  tRNA(1-methyladenosine) methyltransferase and related methyltransferase-like protein  33.33 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0656732  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1401  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  29.34 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468814  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2378  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  28.85 
 
 		 298 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0323  protein-L-isoaspartate methyltransferase-like protein  32.3 
 
 		 297 aa  119  6e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.202075  normal  0.268178 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1298  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  31.2 
 
 		 290 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.84093  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0620  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  32.18 
 
 		 290 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0203  tRNA (adenine-57, 58-N(1)-) methyltransferase  31.2 
 
 		 290 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0201025  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0927  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  31.88 
 
 		 283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.769745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0804  beta-aspartate methyltransferase, conjectural  34.98 
 
 		 255 aa  114  3e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.10576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0823  beta-aspartate methyltransferase, conjectural  30.38 
 
 		 254 aa  114  3e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0358944 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1919  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  31.1 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.134811  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0607  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  30.61 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0685  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  32.07 
 
 		 285 aa  108  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.727075  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2288  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  31 
 
 		 254 aa  107  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00198385  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1224  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  30.43 
 
 		 267 aa  106  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16240  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  30.7 
 
 		 255 aa  106  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0690  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  24.69 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0354  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  26.36 
 
 		 252 aa  92.8  7e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000362524  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2122  putative methyltransferase  27.45 
 
 		 250 aa  89.4  9e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01430  hypothetical protein  28.99 
 
 		 433 aa  84  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00362706  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_3687  predicted protein  26.79 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0625278  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35232  predicted protein  25.11 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0112484  normal  0.375973 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0800  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  26.05 
 
 		 270 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1687  protein-L-isoaspartate methyltransferase-like protein  28.68 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0381011  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2751  methyltransferase small  29.3 
 
 		 309 aa  72.4  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2535  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  27.13 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2273  protein-L-isoaspartate methyltransferase-like  26.74 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1831  protein-L-isoaspartate methyltransferase-like protein  25.75 
 
 		 241 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1391  Methyltransferase type 12  30.08 
 
 		 246 aa  69.3  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.974092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3184  methyltransferase small  28.64 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.241453  normal  0.13403 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65994  translational repressor of GCN4  24.48 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0228  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  27.19 
 
 		 243 aa  67  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.811474  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1350  hypothetical protein  27.31 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.656837  hitchhiker  0.0000326001 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  32.46 
 
 		 274 aa  44.3  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1699  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  29.76 
 
 		 210 aa  42.7  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>