More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2141 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1888  glycogen synthase  93 
 
 
404 aa  743    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000814984 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2141  glycogen synthase  100 
 
 
401 aa  810    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309796  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  69.77 
 
 
398 aa  565  1e-160  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  65.83 
 
 
397 aa  543  1e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  67.84 
 
 
404 aa  537  1e-151  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1421  glycogen synthase  62.74 
 
 
431 aa  519  1e-146  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  64.68 
 
 
404 aa  520  1e-146  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2317  glycogen synthase  65.6 
 
 
409 aa  493  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2900  glycogen synthase  67 
 
 
396 aa  491  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.823096  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1691  glycogen synthase  64.48 
 
 
409 aa  484  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533865  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3718  glycogen synthase  63 
 
 
397 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.375533  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  59.19 
 
 
396 aa  462  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  57.83 
 
 
392 aa  448  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  54.13 
 
 
416 aa  439  9.999999999999999e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4001  glycogen synthase  53.81 
 
 
382 aa  408  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4075  glycogen synthase  53.81 
 
 
382 aa  408  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1119  glycogen synthase  56.19 
 
 
386 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493813  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2152  glycogen synthase  56.74 
 
 
386 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171657  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3306  glycogen synthase  54.66 
 
 
384 aa  404  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4504  glycogen synthase  53.25 
 
 
387 aa  403  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.746384 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2191  glycogen synthase  54.04 
 
 
382 aa  404  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1822  glycogen synthase  54.86 
 
 
398 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.222954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  55.16 
 
 
395 aa  397  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  52.79 
 
 
382 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  53.22 
 
 
395 aa  381  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11236  glycosyl transferase  50.62 
 
 
387 aa  375  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000059903  normal  0.0287618 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1174  glycogen synthase  51.76 
 
 
387 aa  373  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  48.27 
 
 
404 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  50.95 
 
 
411 aa  363  4e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  45.19 
 
 
404 aa  362  9e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  45.12 
 
 
406 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  42.75 
 
 
388 aa  327  3e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 
536 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 
390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 
391 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  33.75 
 
 
405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 
408 aa  121  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 
391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 
440 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  26.24 
 
 
398 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.82 
 
 
378 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 
391 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 
373 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  28.54 
 
 
396 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 
396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 
396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 
424 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  29.74 
 
 
396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  29.07 
 
 
394 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  25.36 
 
 
410 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 
384 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  31.56 
 
 
480 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 
419 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  27.47 
 
 
396 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 
419 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 
672 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  28.35 
 
 
423 aa  107  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
415 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  25.38 
 
 
355 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  35.16 
 
 
439 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  28.28 
 
 
413 aa  107  5e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3232  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 
464 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0216694  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  29.31 
 
 
418 aa  106  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 
405 aa  106  8e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  26.77 
 
 
405 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  32.3 
 
 
450 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 
387 aa  105  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 
411 aa  105  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  25.67 
 
 
413 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  29.4 
 
 
415 aa  104  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  29.19 
 
 
935 aa  104  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 
358 aa  103  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1551  glycosyl transferase, group 1  28.9 
 
 
407 aa  103  5e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  29.06 
 
 
419 aa  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  25.36 
 
 
395 aa  103  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  31.58 
 
 
431 aa  103  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  31.76 
 
 
417 aa  103  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 
377 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 
414 aa  103  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
422 aa  103  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  27.84 
 
 
351 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 
435 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.91 
 
 
443 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.91 
 
 
443 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
453 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 
426 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  30.26 
 
 
458 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.91 
 
 
499 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.91 
 
 
443 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.91 
 
 
443 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.91 
 
 
498 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.91 
 
 
495 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  29.12 
 
 
396 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0439  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 
395 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.63616  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
390 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0621  glycosyl transferase group 1  32.29 
 
 
342 aa  100  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.152612  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1266  glycosyl transferase, group 1  26.99 
 
 
390 aa  100  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.610895  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  29.63 
 
 
443 aa  99.8  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  27.38 
 
 
414 aa  99.8  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>