247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2130 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2130  hypothetical protein  100 
 
 
374 aa  706    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000290153  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1881  hypothetical protein  70.83 
 
 
347 aa  395  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1340  hypothetical protein  46.95 
 
 
411 aa  210  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6400  membrane protein-like protein  39.47 
 
 
472 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.798401  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18100  predicted membrane protein  41.53 
 
 
361 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3594  conserved hypothetical protein 698  43.89 
 
 
335 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.348147  normal  0.225581 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  35.34 
 
 
355 aa  139  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09940  predicted membrane protein  36.94 
 
 
441 aa  136  7.000000000000001e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.903662  normal  0.219021 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  35.2 
 
 
355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  32.92 
 
 
360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  32.92 
 
 
360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  33.15 
 
 
348 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  32.1 
 
 
354 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  33.23 
 
 
355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2972  hypothetical protein  33.33 
 
 
339 aa  127  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  33.02 
 
 
352 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11040  predicted membrane protein  40.71 
 
 
363 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  30.19 
 
 
377 aa  119  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  28.91 
 
 
352 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  28.81 
 
 
352 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  29.25 
 
 
352 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  28.91 
 
 
340 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  28.57 
 
 
340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  28.19 
 
 
340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  28.91 
 
 
340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2818  hypothetical protein  31.91 
 
 
322 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0054  hypothetical protein  32.82 
 
 
380 aa  117  3.9999999999999997e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.698005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  33.23 
 
 
324 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  29.73 
 
 
368 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  28.14 
 
 
340 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  30.98 
 
 
340 aa  115  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  28.81 
 
 
337 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  40.28 
 
 
343 aa  114  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  32.31 
 
 
339 aa  114  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1630  hypothetical protein  31.92 
 
 
359 aa  113  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  29.25 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  28.91 
 
 
352 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  31.01 
 
 
349 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  31.01 
 
 
349 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  31.01 
 
 
349 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  31.01 
 
 
349 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  31.01 
 
 
349 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  28.2 
 
 
357 aa  109  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1845  hypothetical protein  27.78 
 
 
360 aa  109  8.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0726233  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  26.96 
 
 
338 aa  109  9.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6041  hypothetical protein  43.7 
 
 
288 aa  109  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2132  hypothetical protein  27.65 
 
 
361 aa  108  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.861594  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  27.85 
 
 
348 aa  108  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6170  hypothetical protein  35.03 
 
 
355 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  24.12 
 
 
335 aa  107  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71100  hypothetical protein  34.5 
 
 
355 aa  106  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4698  hypothetical protein  34.73 
 
 
329 aa  103  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  29.45 
 
 
361 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  29.45 
 
 
361 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1159  hypothetical protein  32.03 
 
 
340 aa  102  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898117  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  30.46 
 
 
349 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  30.46 
 
 
349 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  30.46 
 
 
349 aa  102  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  30.46 
 
 
349 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  29.45 
 
 
346 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  30.46 
 
 
349 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  30.46 
 
 
349 aa  102  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  30.46 
 
 
349 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  30.46 
 
 
349 aa  102  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3934  hypothetical protein  33.22 
 
 
336 aa  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  30.16 
 
 
361 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  30.82 
 
 
348 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2420  hypothetical protein  29.88 
 
 
361 aa  100  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2281  hypothetical protein  30.09 
 
 
365 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4540  hypothetical protein  28.3 
 
 
342 aa  99.8  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0584057  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  30.19 
 
 
349 aa  99  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0957  hypothetical protein  31.71 
 
 
356 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3226  hypothetical protein  30.29 
 
 
362 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000050779 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0954  hypothetical protein  31.99 
 
 
367 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.006029  normal  0.0131459 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  29.38 
 
 
359 aa  97.4  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2518  hypothetical protein  27.92 
 
 
380 aa  97.8  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2292  hypothetical protein  31.71 
 
 
356 aa  97.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2159  hypothetical protein  31.71 
 
 
356 aa  97.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2283  hypothetical protein  31.14 
 
 
362 aa  96.3  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00533884 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2308  hypothetical protein  31.29 
 
 
360 aa  96.3  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2819  hypothetical protein  31.29 
 
 
360 aa  96.3  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.720965  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2100  hypothetical protein  31.4 
 
 
356 aa  96.7  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435669  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0605  hypothetical protein  33.69 
 
 
351 aa  96.3  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.982935  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  24.72 
 
 
337 aa  95.9  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1657  hypothetical protein  29.29 
 
 
343 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2674  hypothetical protein  27.32 
 
 
362 aa  95.9  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2755  hypothetical protein  27.32 
 
 
362 aa  95.9  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.218534  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1533  hypothetical protein  27.32 
 
 
362 aa  95.9  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.212301  normal  0.210583 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0399  hypothetical protein  30.69 
 
 
331 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5197  hypothetical protein  32.36 
 
 
365 aa  95.1  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  27.33 
 
 
340 aa  95.1  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2179  hypothetical protein  31.84 
 
 
310 aa  94.7  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000299596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0389  hypothetical protein  30.69 
 
 
331 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445768  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2038  hypothetical protein  32.43 
 
 
338 aa  93.6  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.204311  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1051  hypothetical protein  31.99 
 
 
367 aa  93.6  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00435413  normal  0.0767092 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1657  hypothetical protein  29.45 
 
 
358 aa  93.6  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1990  hypothetical protein  29.86 
 
 
348 aa  93.2  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.81385  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  24.53 
 
 
341 aa  93.2  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2242  hypothetical protein  31.1 
 
 
353 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1523  hypothetical protein  30.98 
 
 
355 aa  92  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.735996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>